高三生物多聚酶鏈式反應(yīng)擴增DNA片段課件_第1頁
高三生物多聚酶鏈式反應(yīng)擴增DNA片段課件_第2頁
高三生物多聚酶鏈式反應(yīng)擴增DNA片段課件_第3頁
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文檔簡介

高三生物多聚酶鏈式反應(yīng)擴增DNA片段課件第一頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二一、基礎(chǔ)知識(一)DNA分子的結(jié)構(gòu)第二頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二一、基礎(chǔ)知識1、組成元素(一)DNA分子的結(jié)構(gòu)第三頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二一、基礎(chǔ)知識C、H、O、N、P1、組成元素(一)DNA分子的結(jié)構(gòu)第四頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二一、基礎(chǔ)知識C、H、O、N、P1、組成元素2、基本單位(一)DNA分子的結(jié)構(gòu)第五頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二一、基礎(chǔ)知識C、H、O、N、P1、組成元素脫氧核苷酸2、基本單位(一)DNA分子的結(jié)構(gòu)第六頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二一、基礎(chǔ)知識C、H、O、N、P1、組成元素脫氧核苷酸2、基本單位3、脫氧核苷酸結(jié)構(gòu)(一)DNA分子的結(jié)構(gòu)第七頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二脫氧核苷酸結(jié)構(gòu)式第八頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二OOPOHO堿基OOHOOPOHOOH堿基5’3’3’5’堿基脫氧核糖磷酸基團堿基脫氧核糖堿基脫氧核糖5’3’多脫氧核苷酸鏈結(jié)構(gòu)簡圖第九頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二連接第十頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二連接ATGC第十一頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二連接ATGCATGC第十二頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二連接ATGCATGC第十三頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二連接ATGCATGC3'端(含羥基)第十四頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二連接ATGCATGC5'端含磷酸基團3'端(含羥基)第十五頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二連接ATGCATGC5'端含磷酸基團3'端(含羥基)3'端第十六頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二連接ATGCATGC5'端含磷酸基團3'端(含羥基)3'端5'端第十七頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二5、DNA分子的雙螺旋結(jié)構(gòu)第十八頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二5、DNA分子的雙螺旋結(jié)構(gòu)①DNA分子是由兩條反向平行的(即一條鏈為3’-5’,另一條鏈為5’-3’)脫氧核苷酸長鏈盤旋而成的規(guī)則雙螺旋結(jié)構(gòu)第十九頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二5、DNA分子的雙螺旋結(jié)構(gòu)①DNA分子是由兩條反向平行的(即一條鏈為3’-5’,另一條鏈為5’-3’)脫氧核苷酸長鏈盤旋而成的規(guī)則雙螺旋結(jié)構(gòu)②脫氧核糖與磷酸交替連結(jié),排列在外側(cè),構(gòu)成基本骨架;堿基排列在鏈的內(nèi)側(cè)第二十頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二③兩條鏈上的堿基通過氫鍵連結(jié)起來,形成堿基對。堿基對的組成有特定的規(guī)律:即腺嘌呤一定與胸腺嘧啶配對,鳥嘌呤一定同胞嘧啶配對。5、DNA分子的雙螺旋結(jié)構(gòu)第二十一頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二(三)DNA的復(fù)制2、時期3、場所1、概念第二十二頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二(三)DNA的復(fù)制2、時期3、場所1、概念由一個DNA形成兩個完全相同的DNA的過程第二十三頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二(三)DNA的復(fù)制2、時期有絲分裂間期減數(shù)第一次分裂前的間期3、場所1、概念由一個DNA形成兩個完全相同的DNA的過程第二十四頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二(三)DNA的復(fù)制2、時期有絲分裂間期減數(shù)第一次分裂前的間期3、場所細胞核(主)、線粒體、葉綠體1、概念由一個DNA形成兩個完全相同的DNA的過程第二十五頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二5、原材料6、基本條件4、模板第二十六頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二5、原材料6、基本條件4、模板DNA母鏈第二十七頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二5、原材料脫氧核苷酸6、基本條件4、模板DNA母鏈第二十八頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二5、原材料脫氧核苷酸6、基本條件酶、ATP、原料、模板4、模板DNA母鏈第二十九頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二7、復(fù)制過程第三十頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二7、復(fù)制過程①DNA的解旋第三十一頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二7、復(fù)制過程①DNA的解旋親代DNA分子利用細胞提供的能量在解旋酶的作用下氫鍵斷裂,部分雙螺旋鏈解旋為兩條平行的雙鏈第三十二頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二DNA聚合酶的特性

DNA聚合酶不能從頭開始合成DNA,而只能從3’端延伸DNA鏈。因此,DNA復(fù)制需要引物。

第三十三頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二②RNA引物的合成第三十四頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二②RNA引物的合成以單股DNA為模板,在引物酶的作用下合成小段的RNA引物第三十五頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二②RNA引物的合成以單股DNA為模板,在引物酶的作用下合成小段的RNA引物③DNA的生成第三十六頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二②RNA引物的合成以單股DNA為模板,在引物酶的作用下合成小段的RNA引物③DNA的生成以單股的DNA為模板,在DNA聚合酶的作用下,在RNA引物的末端由5’端-3’端合成DNA。第三十七頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二④切掉引物生成岡崎片斷第三十八頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二④切掉引物生成岡崎片斷在核酸酶的作用下切掉引物。在DNA聚合酶的作用下將引物部位換上DNA,此時的DNA片斷稱為岡崎片斷第三十九頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二④切掉引物生成岡崎片斷在核酸酶的作用下切掉引物。在DNA聚合酶的作用下將引物部位換上DNA,此時的DNA片斷稱為岡崎片斷⑤DNA片斷的連接第四十頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二④切掉引物生成岡崎片斷在核酸酶的作用下切掉引物。在DNA聚合酶的作用下將引物部位換上DNA,此時的DNA片斷稱為岡崎片斷⑤DNA片斷的連接在DNA連接酶的作用下將岡崎片斷連接起來。形成一條完整的新的DNA鏈。新鏈與舊鏈構(gòu)成新的DNA第四十一頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二第四十二頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二DNA合成的方向從子鏈由5’端向3’端延伸第四十三頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二思考:DAN復(fù)制的前提是什么?體外擴增DNA如何打開雙鏈?第四十四頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二DNA復(fù)制的前提是______________;用_________________方法思考:DAN復(fù)制的前提是什么?體外擴增DNA如何打開雙鏈?第四十五頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二DNA復(fù)制的前提是______________;用_________________方法思考:DAN復(fù)制的前提是什么?體外擴增DNA如何打開雙鏈?雙鏈的解開第四十六頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二DNA復(fù)制的前提是______________;用_________________方法思考:DAN復(fù)制的前提是什么?體外擴增DNA如何打開雙鏈?雙鏈的解開控制溫度第四十七頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二4.DNA分子的熱變性原理:第四十八頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二DNA雙鏈4.DNA分子的熱變性原理:第四十九頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二DNA雙鏈變性(加熱80-100℃)4.DNA分子的熱變性原理:第五十頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二DNA雙鏈單鏈變性(加熱80-100℃)4.DNA分子的熱變性原理:第五十一頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二DNA雙鏈單鏈變性(加熱80-100℃)復(fù)性(緩慢冷卻)4.DNA分子的熱變性原理:第五十二頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二DNA雙鏈單鏈變性(加熱80-100℃)復(fù)性(緩慢冷卻)變性的目的:4.DNA分子的熱變性原理:第五十三頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二DNA雙鏈單鏈變性(加熱80-100℃)復(fù)性(緩慢冷卻)變性的目的:解開雙鏈4.DNA分子的熱變性原理:第五十四頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二DNA雙鏈單鏈變性(加熱80-100℃)復(fù)性(緩慢冷卻)變性的目的:復(fù)性的目的:解開雙鏈4.DNA分子的熱變性原理:第五十五頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二DNA雙鏈單鏈變性(加熱80-100℃)復(fù)性(緩慢冷卻)變性的目的:復(fù)性的目的:解開雙鏈有利于引物Ⅰ和引物Ⅱ與兩條單鏈的結(jié)合4.DNA分子的熱變性原理:第五十六頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二思考:高溫使DNA解旋,但普通DNA聚合酶會失活,__________________找到耐高溫DNA聚合酶。第五十七頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二思考:高溫使DNA解旋,但普通DNA聚合酶會失活,__________________找到耐高溫DNA聚合酶。托馬斯.布魯克第五十八頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二5、體外DNA復(fù)制的條件(PCR反應(yīng)的條件)第五十九頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二5、體外DNA復(fù)制的條件(PCR反應(yīng)的條件)①DNA模板;第六十頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二5、體外DNA復(fù)制的條件(PCR反應(yīng)的條件)①DNA模板;②分別與兩條模板鏈相結(jié)合的兩種引物;第六十一頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二5、體外DNA復(fù)制的條件(PCR反應(yīng)的條件)①DNA模板;②分別與兩條模板鏈相結(jié)合的兩種引物;③四種脫氧核苷酸;第六十二頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二5、體外DNA復(fù)制的條件(PCR反應(yīng)的條件)①DNA模板;②分別與兩條模板鏈相結(jié)合的兩種引物;③四種脫氧核苷酸;④耐高溫的聚合酶;第六十三頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二5、體外DNA復(fù)制的條件(PCR反應(yīng)的條件)①DNA模板;②分別與兩條模板鏈相結(jié)合的兩種引物;③四種脫氧核苷酸;④耐高溫的聚合酶;⑤控制溫度,但不需解旋酶。第六十四頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二(五)

PCR的反應(yīng)過程1、PCR的反應(yīng)步驟第六十五頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二(五)

PCR的反應(yīng)過程1、PCR的反應(yīng)步驟

PCR一般經(jīng)歷三十多次循環(huán),每次循環(huán)可以分為三個基本步驟──變性、復(fù)性和延伸第六十六頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二①變性(模板DNA解旋)模板DNA經(jīng)加熱至900C以上。一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使成為單鏈,以便于它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準備。2、循環(huán)過程第六十七頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二靶序列靶序列PCR循環(huán)第一步:加熱變性第六十八頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二②復(fù)性(退火)模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降到500C左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合第六十九頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二靶序列靶序列引物Ⅰ引物Ⅱ5’3’5’5’3’5’3’3’PCR循環(huán)第二步:引物與靶序列退火第七十頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二③延伸

DNA模板-引物結(jié)合物在TaqDNA聚合酶的作用下以脫氧核苷酸為原料,以母鏈為模板,按堿基互補配對的原則與半保留復(fù)制的原理,合成一條新的DNA鏈第七十一頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二靶序列靶序列引物Ⅰ引物Ⅱ5’3’5’5’3’5’3’3’TaqDNA聚合酶PCR循環(huán)第三步:引物延伸第七十二頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二靶序列

靶序列第1個PCR循環(huán)完成后:得到兩個拷貝的靶序列第七十三頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二3、30次循環(huán)后靶序列擴增的數(shù)量第七十四頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二3、30次循環(huán)后靶序列擴增的數(shù)量第七十五頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二循環(huán)次數(shù)DNA數(shù)量122438201,048,576301,073,741,8243、30次循環(huán)后靶序列擴增的數(shù)量第七十六頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二4、PCR循環(huán)的結(jié)果第七十七頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二4、PCR循環(huán)的結(jié)果①從第二輪循環(huán)開始,上一次循環(huán)的產(chǎn)物也作為模板參與反應(yīng),并且由引物Ⅰ延伸而成的DNA單鏈會與引物Ⅱ結(jié)合,進行DNA的延伸第七十八頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二4、PCR循環(huán)的結(jié)果②DNA聚合酶只能特異性地復(fù)制處于兩個引物之間的DNA序列,使這段固定長度的序列呈指數(shù)擴增①從第二輪循環(huán)開始,上一次循環(huán)的產(chǎn)物也作為模板參與反應(yīng),并且由引物Ⅰ延伸而成的DNA單鏈會與引物Ⅱ結(jié)合,進行DNA的延伸第七十九頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二95℃變性(1)PCR循環(huán)——變性第八十頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二(1)PCR循環(huán)——變性95℃變性第八十一頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二95℃變性(1)PCR循環(huán)——變性第八十二頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二55℃復(fù)性(2)PCR循環(huán)—復(fù)性第八十三頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二(3)PCR循環(huán)—延伸第八十四頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二(3)PCR循環(huán)—延伸第八十五頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二(3)PCR循環(huán)—延伸第八十六頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二(3)PCR循環(huán)—延伸第八十七頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二第八十八頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二第八十九頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二第九十頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二第九十一頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二4、循環(huán)特點:①上一次循環(huán)的產(chǎn)物為下一循環(huán)的模板②結(jié)果單鏈中有最初母鏈的只兩條(無引物存于兩個子代DNA分子中③其它子代DNA分子都為雙引物分子式④處于兩引物之間的DNA序列呈指數(shù)增長1×2N第九十二頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二二、實驗步驟第九十三頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二①準備好PCR反應(yīng)體系的配方二、實驗步驟第九十四頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二①準備好PCR反應(yīng)體系的配方②用微量移液器按配方在微量試管中加入各組分二、實驗步驟第九十五頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二①準備好PCR反應(yīng)體系的配方②用微量移液器按配方在微量試管中加入各組分③蓋嚴蓋子,用手指輕輕彈擊管壁二、實驗步驟第九十六頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二①準備好PCR反應(yīng)體系的配方②用微量移液器按配方在微量試管中加入各組分③蓋嚴蓋子,用手指輕輕彈擊管壁④離心10分鐘二、實驗步驟第九十七頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二①準備好PCR反應(yīng)體系的配方②用微量移液器按配方在微量試管中加入各組分③蓋嚴蓋子,用手指輕輕彈擊管壁④離心10分鐘⑤將離心管放入PCR儀上,設(shè)置好循環(huán)程序二、實驗步驟第九十八頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二①準備好PCR反應(yīng)體系的配方②用微量移液器按配方在微量試管中加入各組分③蓋嚴蓋子,用手指輕輕彈擊管壁④離心10分鐘⑤將離心管放入PCR儀上,設(shè)置好循環(huán)程序⑥電泳檢測PCR結(jié)果二、實驗步驟第九十九頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二

1.為避免外源DNA等因素的污染,PCR實驗中使用的微量離心管、槍頭、緩沖液以及蒸餾水等在使用前必須進行高壓滅菌。

2.PCR所用的緩沖液和酶應(yīng)分裝成小份,并在-20℃儲存。使用前,將所需試劑從冰箱拿出,放在冰塊上緩慢融化。三、操作提示第一百頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二

3.在微量離心管中添加反應(yīng)成分時,每吸取一種試劑后,移液器上的槍頭都必須更換。所有的成分都加入后,蓋嚴離心管口的蓋子,用手指輕輕彈擊管的側(cè)壁,使反應(yīng)液混合均勻,再將微量離心管放在離心機上,離心約10s,使反應(yīng)液集中在離心管底部,再放入PCR儀中進行反應(yīng)。第一百零一頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二目的:避免外源性DNA大量擴增造成假陽性反應(yīng)。第一百零二頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二1、原理:DNA在260nm的紫外線波段有一強烈的吸收峰(圖5-11)??梢岳肈NA的這一特點進行DNA含量的測定。四、結(jié)果分析與評價第一百零三頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二四、結(jié)果分析與評價(了解)2、具體方法如下。1)將樣品進行50倍稀釋:取2μLPCR反應(yīng)液,加入98μL蒸餾水。2)以蒸餾水作為空白對照,在波長260nm處,將紫外分光

光度計(圖5-12)的讀數(shù)

調(diào)節(jié)至零。第一百零四頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二3)加入步驟1中的DNA稀釋液100L至比色杯中,測定260nm處的光吸收值。4)根據(jù)下面的公式計算DNA含量。

DNA含量(μg/ml)=50×(260nm的讀數(shù))×稀釋倍數(shù)第一百零五頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二五、課題延伸第一百零六頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二1、PCR優(yōu)點:五、課題延伸第一百零七頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二原理雖然復(fù)雜,但操作卻十分簡單??焖佟⒏咝?、靈活和易于操作。1、PCR優(yōu)點:五、課題延伸第一百零八頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二原理雖然復(fù)雜,但操作卻十分簡單??焖?、高效、靈活和易于操作。1、PCR優(yōu)點:2、PCR技術(shù)的意義五、課題延伸第一百零九頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二復(fù)習:PCR技術(shù)與體內(nèi)DNA復(fù)制的區(qū)別第一百一十頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二復(fù)習:PCR技術(shù)與體內(nèi)DNA復(fù)制的區(qū)別1.PCR不需要解旋酶;體內(nèi)DNA復(fù)制需要;第一百一十一頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二復(fù)習:PCR技術(shù)與體內(nèi)DNA復(fù)制的區(qū)別1.PCR不需要解旋酶;體內(nèi)DNA復(fù)制需要;2.PCR需要耐熱的DNA聚合酶(常用TaqDNA聚合酶),而生物體內(nèi)的聚合酶在高溫時會變性;第一百一十二頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二復(fù)習:PCR技術(shù)與體內(nèi)DNA復(fù)制的區(qū)別1.PCR不需要解旋酶;體內(nèi)DNA復(fù)制需要;2.PCR需要耐熱的DNA聚合酶(常用TaqDNA聚合酶),而生物體內(nèi)的聚合酶在高溫時會變性;3.PCR一般要經(jīng)歷三十多次循環(huán),而生物體內(nèi)DNA復(fù)制需要生物體自身的復(fù)制。第一百一十三頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二1.DNA單鏈的________末端為3'端,________末端為5'端,在DNA復(fù)制時,引物從模板鏈的______端配對結(jié)合。在___________酶的作用下,引物提供____端,使子鏈向下延伸。2.每次循環(huán)可以分為_________________這三個過程,對應(yīng)溫度分別為_______________________。練習第一百一十四頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二1.DNA單鏈的________末端為3'端,________末端為5'端,在DNA復(fù)制時,引物從模板鏈的______端配對結(jié)合。在___________酶的作用下,引物提供____端,使子鏈向下延伸。2.每次循環(huán)可以分為_________________這三個過程,對應(yīng)溫度分別為_______________________。羥基練習第一百一十五頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二1.DNA單鏈的________末端為3'端,________末端為5'端,在DNA復(fù)制時,引物從模板鏈的______端配對結(jié)合。在___________酶的作用下,引物提供____端,使子鏈向下延伸。2.每次循環(huán)可以分為_________________這三個過程,對應(yīng)溫度分別為_______________________。磷酸基團羥基練習第一百一十六頁,共一百二十一頁,編輯于2023年,星期二1.DNA單鏈的________末端為3'端,________末端為5'端,在DNA復(fù)制時,引物從模板鏈的______端配對結(jié)合。在___________酶的作用下,引物提供____端,使子鏈向下延伸。2.每次循環(huán)可以分為

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