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![第九章蛋白質(zhì)的生物合成_第2頁](http://file4.renrendoc.com/view/134de75ed1cec349a6e90f7db082f50d/134de75ed1cec349a6e90f7db082f50d2.gif)
![第九章蛋白質(zhì)的生物合成_第3頁](http://file4.renrendoc.com/view/134de75ed1cec349a6e90f7db082f50d/134de75ed1cec349a6e90f7db082f50d3.gif)
![第九章蛋白質(zhì)的生物合成_第4頁](http://file4.renrendoc.com/view/134de75ed1cec349a6e90f7db082f50d/134de75ed1cec349a6e90f7db082f50d4.gif)
![第九章蛋白質(zhì)的生物合成_第5頁](http://file4.renrendoc.com/view/134de75ed1cec349a6e90f7db082f50d/134de75ed1cec349a6e90f7db082f50d5.gif)
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文檔簡介
第九章蛋白質(zhì)的生物合成第一頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第二頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第三頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一翻譯(translation)以mRNA為直接模板,tRNA為氨基酸運載體,核糖體為裝配場所,共同協(xié)調(diào)完成蛋白質(zhì)生物合成的過程。也就是把mRNA的堿基排列順序轉(zhuǎn)譯成多肽鏈中氨基酸的排列順序。第四頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一
主要內(nèi)容
掌握三種RNA在蛋白質(zhì)生物合成中的作用(第一節(jié))熟悉各種輔助因子的作用(第二節(jié))熟悉蛋白質(zhì)的生物合成過程(第二節(jié))第五頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第一節(jié)
RNA在蛋白質(zhì)生物合成中的重要
功能
第六頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一一、mRNAmRNA上四種堿基→蛋白質(zhì)組成20種aa堿基與氨基酸對應(yīng)關(guān)系?
3個相鄰的堿基→1個aa,有43種排列→64種密碼子—UAAUAUUAGUAC—破譯了64種密碼子第七頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一密碼子(codon)mRNA中每三個相鄰的堿基決定一個AA,這三個相鄰的堿基稱為一個密碼子或者三聯(lián)體密碼。第八頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第九頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第十頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第十一頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一遺傳密碼子的主要特點連續(xù)性:密碼子是不重疊、無標點的、不間斷。第十二頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一Insertionordeletion
Frameshift
Frameshiftmutation第十三頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一2.簡并性:degeneracy
幾個不同密碼子表示同一種氨基酸。
61種密碼子→20種aa,同種aa可由2-6種密碼子編碼。同義密碼子(synonymouscodon)
編碼同一個氨基酸的一組密碼子稱為第十四頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第十五頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一3.擺動性:密碼子與反密碼子配對時出現(xiàn)不遵從堿基配對規(guī)律的情況。第十六頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一tRNA反密碼子堿基IUG(第一位)mRNA密碼子堿基
A,C,UA,GC,U
(第三位)
密碼子與反密碼子配對的搖擺現(xiàn)象第十七頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第十八頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一密碼的簡并性有什么生物學意義第十九頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一4.通用性:
病毒、原核細胞、真核細胞都用同一套遺傳密碼子表。終止密碼子UAA、UAG、UGA,起始密碼子AUG第二十頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一二、tRNA和氨基酰-tRNAtRNA的結(jié)構(gòu)tRNA應(yīng)具備的功能氨基酸活化過程氨基酰-tRNA的表示方法第二十一頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第二十二頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第二十三頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一tRNA須具備的功能:
(1)與氨基酸結(jié)合(3′末端)
(2)識別特異的氨基酰-tRNA合成酶(3)識別mRNA鏈上密碼子
(4)與核糖體結(jié)合
根據(jù)tRNA在合成蛋白質(zhì)中的作用,試推想tRNA須具備什么功能
第二十四頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一D環(huán)可被氨酰tRNA酶識別TψC環(huán)可與核糖體結(jié)合活化的CCA末端可連接AA反密碼環(huán)含反密碼子第二十五頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一同功受體tRNA:Isoacceptor
能夠運輸同一種氨基酸的多種tRNA分子稱為氨基酸的同功受體tRNA第二十六頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一氨基酸的活化和氨酰tRNA生成一個氨基酸的羧基與另一個氨基酸的氨基失水縮合成為肽鍵,從熱力學上是極端困難的。但是若將氨基酸轉(zhuǎn)移到tRNA分子上,則能使氨基酸的羧基活化,就能較容易地與氨基酸失水縮合了。第二十七頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一1.氨基酸的活化
AA+ATP+酶→[AA?AMP?酶]+ppi2.氨酰tRNA的形成
[AA?AMP?酶]+tRNA→AMP+
AA-tRNA+酶
氨酰tRNA合成酶對氨基酸、tRNA高度特異地識別;水解酯鍵的催化作用,發(fā)揮酶的校正活性。第二十八頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第二套遺傳密碼氨酰tRNA合成酶既能識別相應(yīng)的氨基酸,又能識別與此氨基酸相對應(yīng)的一個或多個tRNA分子。因此把這種氨酰tRNA合成酶與tRNA分子間的相互作用稱為第二套遺傳密碼。副密碼子
tRNA分子上決定其攜帶氨基酸的區(qū)域稱為副密碼子第二十九頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第三十頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第三十一頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第三十二頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一氨基酰-tRNA的表示方法tRNAAla
;Ala-tRNA
;Ala-tRNAAla
Met-tRNAm;
fMet-tRNAf第三十三頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一三、rRNArRNA與蛋白質(zhì)結(jié)合構(gòu)成核蛋白體,分為大小亞基(50S,30S)原核生物70S真核生物80S小亞基rRNA蛋白質(zhì)16S-rRNA18S-rRNA21種33種大亞基rRNA蛋白質(zhì)5S-rRNA5S-rRNA23S-rRNA28S-rRNA5.8S-rRNA34種49種第三十四頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一核糖體第三十五頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第三十六頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第三十七頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第三十八頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一核糖體特點
小亞基可與mRNA結(jié)合
大亞基在沒有小亞基存在時不能與
mRNA結(jié)合,但可與tRNA非特異結(jié)合第三十九頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一30S50S
第四十頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一核糖體的活性位點在50S亞基上二位點模型三位點模型第四十一頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一A部位:氨?;课唬邮馨滨;鵷RNAP部位:肽?;课?,起始氨酰tRNA或延伸的肽基tRNA結(jié)合的部位,及
tRNA被釋放的部位E部位:出口位,特異結(jié)合無負載的
tRNA及無負載的tRNA離開的位點第四十二頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第四十三頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一蛋白質(zhì)的合成過程,就是以mRNA為模板,在輔助因子和GTP等的作用下,核糖體從mRNA的5’端向3’端移動,不同的氨酰-tRNA
按照mRNA上密碼子所決定的順序進入核糖體,對號入座,在不斷生長著的肽鏈上由氨基端逐個加上氨基酸的過程。第二節(jié)蛋白質(zhì)的生物合成過程第四十四頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一原料:20種L-氨基酸
3種RNA酶:氨基酰tRNA合成酶、轉(zhuǎn)肽酶兩種高能核苷酸:ATP、GTP金屬離子:K+,Mg2+(促進肽鍵形成)第四十五頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一多種蛋白質(zhì)因子:
起始因子:IF(initiationfactors)
延長因子:EF(elongationfactors)
釋放因子:RF/TF(releasefactors)方向:氨基端-------羧基端
第四十六頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第四十七頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一mRNA是一條長鏈分子。因此,在進行蛋白質(zhì)合成時,可同時被多個核糖體翻譯。這樣,在顯微鏡下便可見到多個核糖體排列成一串。這種結(jié)構(gòu)就稱為多聚核糖體(polyribosome或polysome)。第四十八頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一翻譯過程mRNA5′3′5′AUG…………3′UAA肽鏈延長方向NC
氨基酸活化起始階段進入/進位過程成肽延長階段轉(zhuǎn)位終止階段
第四十九頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一
一、
氨基酸的活化
AA+ATP+酶[氨酰~AMP?酶]+ppi [氨酰~AMP?酶]+tRNAAMP+
氨酰~tRNA+酶
氨酰tRNA合成酶,
合成部位,水解部位-----保證準確性第五十頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一氨酰~AMP氨酰~tRNA第五十一頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一二、翻譯的起始PA5’3’MetAUG
fMet-tRNAfMet-tRNAmfMet第五十二頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一S-D序列(Shine-Dalgarno序列):又稱核糖體結(jié)合位點(RBS),在翻譯起始密碼AUG的上游,相距8-13個核苷酸處,有一段富含嘌呤的核苷酸序列,可以與核蛋白體小亞基16S-rRNA互補配對,使核糖體與mRNA在特定位置上結(jié)合。這種結(jié)合能協(xié)助辨認起始密碼子,這一段1.mRNA鏈上起始信號的辨認第五十三頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一幾種基因mRNA上的S-D序列第五十四頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一Met-tRNAf+N10甲酰四氫葉酸
fMet-tRNAf+四氫葉酸Met-tRNAm只能用于延伸2.起始氨酰—tRNA的形成轉(zhuǎn)甲酰酶第五十五頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一3.起始因子(IF)
:參與蛋白質(zhì)生物合成起始的可溶性蛋白質(zhì)因子IF-1:無專一功能,增加IF-2,IF-3活性IF-2:使fMet-tRNAf選擇性地與30S亞基結(jié)合。結(jié)合并水解GTPIF-3:具有解離活性,使亞基保持為解離態(tài);使30S與mRNA起始部位連接第五十六頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一
翻譯的起始第五十七頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一4.起始復(fù)合物的生成過程mRNA.IF-3.30sIF-2.GTP.fMet-tRNAfmRNA.30s.fMet-tRNAf
.IF-3.GTP.IF-1.IF-2IF-3mRNA.70s.fMet-tRNAf50SIF-1IF-2.GDPIF-1第五十八頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第五十九頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第六十頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一三、肽鏈的延長翻譯過程中的肽鏈延長,又稱核糖體循環(huán)(ribosomalcycle)。分三步驟:
進入(進位) 核糖體循環(huán) 轉(zhuǎn)肽(轉(zhuǎn)肽酶)
移位第六十一頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一
肽鏈的延伸第六十二頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一延伸因子(EF):
參與肽鏈延伸的蛋白質(zhì)因子EF-TU,EF-TS:
共同促使氨酰-tRNA進入核糖體的A位具有GTP酶活性EF-G:
具有GTP酶活性促使肽酰-tRNA位移至P位及空的tRNA
離開核糖體第六十三頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一(1)進入EF-Tu.GTP.氨酰-tRNA進入A位消耗1個GTPEF-Ts功能是保護EF-Tu,并使EF-Tu.GDP再生為EF-Tu.GTP,繼續(xù)參與肽鏈延伸EF-Tu能不能與fMet-tRNAf結(jié)合?第六十四頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第六十五頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一(2)轉(zhuǎn)肽(形成肽鍵)肽酰轉(zhuǎn)移酶:轉(zhuǎn)肽酶,P位點A位點形成肽鍵:P位點的fMet-tRNAf(或肽酰-tRNA)的羧基與A位點的AA-tRNA的氨基結(jié)合形成肽鍵不消耗GTP,可能來自AA~tRNA(或肽酰~tRNA)間的酯鍵水解第六十六頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一(3)移位肽?;?tRNA從核糖體的A位移到P位的過程核糖體沿mRNA的5’----3’方向移動與移位過程相偶聯(lián)(每次移動距離是1個密碼子)移位酶,EF-G(G因子)消耗1個GTP第六十七頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一3’PA5’fMetAUG23’PA5’MetAUG2進入ffMetfMet第六十八頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一轉(zhuǎn)肽移位f3’PA5’metAUG23PA3’5’AUG2fMetfMet第六十九頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一PA3’5’AUGMet23PA3’5’AUGMet234
進位轉(zhuǎn)肽fffMetfMet第七十頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一PA3’5’AUGMet234PA3’5’AUGMet234fffMetfMet第七十一頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一第七十二頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一釋放因子(RF):終止肽鏈合成并將其從核糖體上釋放出來的一類蛋白質(zhì)因子終止密碼子:UAA、UAG、UGARF-1:UAA,UAGRF-2:UAA,UGARF-3:本身無識別密碼子性質(zhì),但可增強RF-1,RF-2的活性。四、肽鏈合成的終止第七十三頁,共八十四頁,編輯于2023年,星期一(1)終止密碼子(UAA、UAG、UGA)出現(xiàn)在核糖體A位時,釋放因子(RF)就與之結(jié)合,(2)肽基轉(zhuǎn)移酶變?yōu)樗饷福剐律碾逆溑ctRNA分離,并從核糖體上脫落下來,(3)mRN
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