分子生態(tài)學名詞解釋

實用文檔一、翻譯并解釋名詞：(10x4分)allele等位基因一個位點的序列變異。Effectivepopulationsize(Ne)有效種群大?。〝?shù)目）規(guī)模相對應的真實的種群雜合性隨時間喪失的速率相同的個體數(shù)。F-statisticsF統(tǒng)計檢驗應用于定量亞種群的遺傳分化。Geneticload遺傳負荷相對于理論最佳值來說降低了的基因型適合度。Hardy-Weibergequilibrium位基因頻率從一個世代到下一個世代應該保持不變。Bottleneckeffect種群的規(guī)模大為縮小，隨后常常有一個（種群的）恢復。7.Selectionsweep7.Selectionsweep課件：Occurrenceofabeneficialmutation，OnlyindividualscarryingthemutationreproducePopulationbottleneckMainlyaffectsloci。IAM無限等位基因模型其中突變不是以可預料的方式一個接一個發(fā)生，而大多數(shù)突變是像產(chǎn)生SNP（單核苷酸多態(tài)性）那樣出現(xiàn)的。Linkagedisequilibrium(LD)連鎖不平衡。術(shù)語表：Linkageequilibrium連鎖平衡：由重組促成的情形，其中遺傳位點在色體上的物理位置太接近時，則發(fā)生不平衡。百度：(linkagedisequilibrium)HLAMetapopulation種群再分為多個同類群，至少其中的一些偶爾滅絕，隨后通過從其他同類群遷入再建立種群。Microsatellite帶有單序列（通常為2-，3-或4-核苷酸）重復多次的遺傳位點。MtDNADNA存在于線粒體中的環(huán)狀染色體。Non-synomousmutation實用文檔由一個三聯(lián)密碼變化使特定氨基酸改變的突變。PCR用寡核苷酸引物和耐熱的DNA聚合酶擴增大量DNA序列的一種方法。SNP在DNA序列中一個特殊位點上出現(xiàn)不同核苷酸堿基的等位基因。RFLP用限制性酶和凝膠電泳鑒定DNA序列多態(tài)性的方法。Transition一個嘌呤核苷酸被另一個嘌呤核苷酸替代，或一個嘧啶核苷酸被另一個嘧啶核苷酸取代的突變。Transversion一個嘌呤核苷酸被另一個嘧啶核苷酸取代或相反過程的突變。19.19.Molecularecology課件:分子生物學是應用分子生物學的原理和方法來研究生命系統(tǒng)與環(huán)境20.20.Functionalecologicalandevolutionarygenomics(FEEG)生態(tài)和進化基因組學？？PhylogeographicPhylogeographiy研究調(diào)控系譜世系的地理分布的原理和過程的科學。Monophyly單系的后代都在這個類群中。Intron內(nèi)含子真核生物的結(jié)構(gòu)基因間的非編碼DNA序列。內(nèi)含子被轉(zhuǎn)錄但它們的RNA拷貝在功能產(chǎn)生期間被切除。Introgression漸滲雜交群間或物種間的近交或雜交這樣的結(jié)果。25.25.Geneticdrift遺傳漂變《生物多樣性導論》：在有性生殖的群體中，每個世代的基因庫是對上Wright產(chǎn)生及結(jié)合過程中的隨機性導致的基因頻率的波動稱為遺傳漂變driftWrightHaplotype單（倍體）型源于同一染色體或染色體單倍體組的一套等位基因。ESU(EvolutionarySignificantUnit)進化顯著單元實用文檔分類學上對保護重要類群的一種嘗試性定義。28.28.Metagenomics宏基因組學又叫微生物環(huán)境基因組學、元基因組學。它通過直接從環(huán)境樣品中提取全部微生物的DNA,構(gòu)建宏基因組文庫，利用基因活性物質(zhì)（或獲得新基因）的新理念和新方法。其主要含義是：對特定環(huán)境中全部為生物的總DNA（也稱宏基因組，metagenomic）進行克隆，并通過構(gòu)建宏rDNA物，通過系統(tǒng)學分析獲得該環(huán)境中微生物的遺傳多樣性和分子生態(tài)學信息。CpDNADNA存在于葉綠體內(nèi)的環(huán)狀染色體。Heterosis 雜種優(yōu)勢，雜合體優(yōu)勢雜合子比純合子有較高的適合度的情形。Recombination 重組二倍體生物中減數(shù)分裂期間同源（配對）染色體間的DNA交換。rRNA RNA核糖體中的RNA分子…………SNP單核苷酸多態(tài)性在DNA序列中一個特殊位點上出現(xiàn)不同核苷酸堿基的等位基因。Sympatricspeciation同域發(fā)生（物種形成生活在同一地區(qū)的個體中形成的新物種。Vicariance 地理隔離種群或物種被環(huán)境事件，如山脈形成造成的物理隔離注：描黃部分為術(shù)語表中無相關(guān)解釋的，僅供參考。分子生態(tài)學簡答題什么是分子生態(tài)學，分子生態(tài)學的主要研究內(nèi)容是什么？教材的定義:分子生物學是應用分子生物學的原理和方法來研究生命系統(tǒng)與互滲透而形成的一門新興交叉學科。技術(shù)應用中的生態(tài)安全、環(huán)境與人類健康等重大問題將產(chǎn)生深刻的影響。什么是宏基因組學，其主要研究過程如何？宏基因組學（Metagenomics）又叫微生物環(huán)境基因組學、元基因組學。它通實用文檔過直接從環(huán)境樣品中提取全部微生物的DNA,構(gòu)建宏基因組文庫，利用基因組學的研究策略研究環(huán)境樣品所包含的全部微生物的遺傳組成及其群落功能。宏基因組學的研究過程：對特定環(huán)境中全部為生物的總DNA（也稱宏基因組，metagenomic）進行克隆，并通過構(gòu)建宏基因組文庫和篩選等手段獲得新的生理活性物質(zhì)；或者根據(jù)rDNA數(shù)據(jù)庫設計引物，通過系統(tǒng)學分析獲得該環(huán)境中微生物的遺傳多樣性和分子生態(tài)學信息。什么是生態(tài)和進化基因組學，其主要研究內(nèi)容如何？研究環(huán)境條件與基因組結(jié)構(gòu)、功能、動態(tài)及進化相互關(guān)系的學科。什么是親緣地理學，其研究內(nèi)容是什么？研究調(diào)控系譜世系的地理分布的原理和過程的科學。什么是數(shù)量性狀？數(shù)量性狀有那些類型？到環(huán)境的影響。在足夠大的群體中，數(shù)量性狀的分布基本符合正態(tài)規(guī)律。數(shù)量性狀的類型：連續(xù)型、閾值型、間斷型（或離散型）性狀基本符合正態(tài)分布，如：身高、體重、奶牛產(chǎn)奶量等。低或最高閾值，例如：生物的性成熟年齡，疾病的易感率等。物每胎產(chǎn)仔個數(shù)、果蠅足上的剛毛數(shù)等。影響種群等位基因頻率變化的進化過程有哪些？種群進化的主要動力有：突變、遺傳漂變、選擇、基因的遷移（基因流動有等位基因喪失。其明顯。制的形狀不能使生物較好地適應生存環(huán)境，自然選擇就會逐步淘汰這些等位基因。布的不均衡現(xiàn)象，有利于提高種群等位基因多樣性。什么叫選擇掃蕩？是如何產(chǎn)生的？AselectivesweepisthereductionoreliminationofvariationamongthenucleotidesinneighboringDNAofamutationastheresultofrecentstrongpositivenaturalselection.實用文檔Aselectivesweepcanoccurwhenanewmutationoccursthatincreasesfitnessofthecarrierrelativetoothermembersofthepopulation.Naturalselectionwillfavourindividualsthathaveahigherfitnessandwithtimethenewlymutatedvariant(allele)willincreaseinfrequencyrelativetootheralleles.Asitsprevalenceincreases,neutralandnearlyneutralgeneticvariationlinkedtothenewmutationwillalsobecomemoreprevalent.Thisphenomenoniscalledgenetichitchhiking.Astrongselectivesweepresultsinaregionofthegenomewherethepositivelyselectedhaplotype(themutatedalleleanditsneighbours)isessentiallytheonlyonethatexistsinthepopulation,resultinginalargereductionofthetotalgeneticvariationinthatchromosomeregion.（即有利變異什么是瓶頸效應？產(chǎn)生瓶頸效應的原因有哪些？喪失而同時導致的種群遺傳多樣性的損失卻再也無法恢復。導致瓶頸效應產(chǎn)生的原因：破壞性自然災害、傳染病、大規(guī)模捕殺或采集、棲息地的破壞等均可造成種群數(shù)量急劇減少，從而導致瓶頸效應。FSTFSTFST是用于衡量種群分化程度的F-統(tǒng)計方法所用的統(tǒng)計量之一，定義為：HF 1ST

S ，其中：HS，HTHT它反映的是一個大種群內(nèi)部各個亞種群之間的分化程度。FST取值范圍為：0≤FST＜1若FST=0，則有HS=HT，原種群無分化現(xiàn)象；若FST→1，則有HS→0，表示亞種群雜合度極低，原種群已發(fā)生高度分化。常用分子標記有：RFLP(Restrictionfragmentlengthpolymorphism)限制性片段長度多態(tài)性實用文檔SSLP(Simplesequencelengthpolymorphism)簡單序列長度多態(tài)性AFLP(Amplifiedfragmentlengthpolymorphism)擴增片段長度多態(tài)性RAPD(RandomamplificationofpolymorphicVNTR(Variablenumbertandemrepeat)可變數(shù)目串聯(lián)重復序列Microsatellitepolymorphism,SSR(Simplesequencerepeat)簡單重復序列多態(tài)性（微衛(wèi)星）SNP(Singlenucleotidepolymorphism)簡單核苷酸多態(tài)性STR(Shorttandemrepeat)短串聯(lián)重復序列SFP(Singlefeaturepolymorphism)單一特征多態(tài)性DArT(DiversityArraysTechnology)多樣性陣列技術(shù)RADmarkers(RestrictionsiteassociatedDNAmarkersDNA限制性位點分子標記分子標記的應用：研究動植物交配機制、遺傳漂變、親緣地理學、種群生態(tài)學、保護生物學、宏基因組學研究（例如微生物群落組成與功能的研究）等。分子標記的特點：似性（區(qū)分同源性與相似性；此外，分子標記還是基因組學分析的重要工具。什么叫適應，適應性狀有哪些特點？定義：使生物個體對其生境適應性提高的現(xiàn)象。響較明顯。補充：群體很大時，數(shù)量性狀的表型分布規(guī)律基本為正態(tài)的。分布基因型與表性關(guān)系涉及等位基因位點數(shù)環(huán)境效應描述參數(shù)舉例連續(xù)或離散復雜較多通常明顯遺傳力等生長率、身高、繁殖適合度什么叫突變？突變有那些種類？象。突變種類：按突變發(fā)生機制，可以分為堿基替換(Substitution)、插入與刪除(Indels)堿基替換：又稱錯誤配對。分為轉(zhuǎn)換（一種嘌呤替換為另一種嘌呤，或一種嘧啶替換為另一種嘧啶）和顛換（嘌呤和嘧啶之間的替換）、錯義突變（對應氨基酸改變、無義突變（應的密碼子變?yōu)榻K止子，使轉(zhuǎn)錄停止。DNA實用文檔化，又稱為移碼突變。按突變發(fā)生場所，亦可分為體細胞突變與生殖細胞突變。分子生態(tài)學論述題回答參考思路經(jīng)典生態(tài)學的研究層次：個體、種群、群落、生態(tài)系統(tǒng)。個體生態(tài)學：個體的形態(tài)結(jié)構(gòu)、生理功能、生態(tài)習性多樣性及分布；種群生態(tài)學：種群組成與結(jié)構(gòu)、種群動態(tài)（出生與死亡、遷移、種群行為（交配機制、種間關(guān)系等；群落生態(tài)學：群落的物種組成與結(jié)構(gòu)、群落動態(tài)（群落演替生態(tài)系統(tǒng)生態(tài)學：生態(tài)系統(tǒng)的組成與結(jié)構(gòu)（生產(chǎn)者、消費者、分解者、生態(tài)過程（物質(zhì)循環(huán)、能量流動、信息傳遞）※分子生態(tài)學的直接研究對象是生物大分子（如核酸序列、蛋白質(zhì)。用分子生物學原理和技術(shù)手段，上述研究方向，哪些可以應用？？局限性：起步相對較晚，缺乏原始數(shù)據(jù)（沒有建立完善的數(shù)據(jù)庫行基礎性研究仍存在一定