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文檔簡(jiǎn)介

DNA重組及重組DNA技術(shù)演示文稿771現(xiàn)在是1頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日DNA重組及重組DNA技術(shù)現(xiàn)在是2頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日DNA重組(DNArecombination)是指不同DNA分子斷裂和連接而產(chǎn)生DNA片段的交換并重新組合形成新DNA分子的過(guò)程。重組DNA技術(shù)(recombinantDNAtechnology)是指在體外將兩個(gè)或兩個(gè)以上DNA分子重新組合并在適當(dāng)細(xì)胞中增殖形成新DNA分子的過(guò)程。廣義上,任何造成基因型變化的基因交流過(guò)程

773現(xiàn)在是3頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日DNA重組的意義發(fā)生在生物體內(nèi)基因的交換或重新組合是生物遺傳變異的一種機(jī)制。在進(jìn)化、繁殖、病毒感染、基因表達(dá)以及致癌基因激活等過(guò)程中,基因重組都起重要作用?;蛑亟M也歸類為自然突變現(xiàn)象。774現(xiàn)在是4頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日第一節(jié)

自然界DNA重組和基因轉(zhuǎn)移是經(jīng)常發(fā)生的

DNARecombinationandGeneTransferOccurFrequently

inNature775現(xiàn)在是5頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日DNA重組接合作用(conjugation)轉(zhuǎn)化作用(transformation)轉(zhuǎn)導(dǎo)作用

(transduction)轉(zhuǎn)座

(transposition)同源重組

(homologousrecombination)位點(diǎn)特異的重組(site-specificrecombination)異常重組776現(xiàn)在是6頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日發(fā)生在同源序列間的重組稱為同源重組(homologousrecombination),又稱基本重組(generalrecombination)。是最基本的DNA重組方式,通過(guò)鏈的斷裂和再連接,在兩個(gè)DNA分子同源序列間進(jìn)行單鏈或雙鏈片段的交換。以E.coli的同源重組為例,了解同源重組機(jī)制的Holliday模型。一、同源重組是最基本的DNA重組方式777現(xiàn)在是7頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日Holliday模型的4個(gè)關(guān)鍵步驟:兩個(gè)同源染色體DNA排列整齊;片段重組體(patchrecombinant)拼接重組體(splicerecombinant)一個(gè)DNA的一條鏈斷裂、并與另一個(gè)DNA對(duì)應(yīng)的鏈連接,形成Holliday中間體;通過(guò)分支移動(dòng)產(chǎn)生異源雙鏈DNA;Holliday中間體切開并修復(fù),形成兩個(gè)雙鏈重組體DNA,分別為:778現(xiàn)在是8頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日片段重組體(見模型圖左邊產(chǎn)物):

切開的鏈與原來(lái)斷裂的是同一條鏈,重組體含有一段異源雙鏈區(qū),其兩側(cè)來(lái)自同一親本DNA。拼接重組體(見模型圖右邊產(chǎn)物):

切開的鏈并非原來(lái)斷裂的鏈,重組體異源雙鏈區(qū)的兩側(cè)來(lái)自不同親本DNA。

779現(xiàn)在是9頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日

內(nèi)切酶

(recBCD)DNA侵?jǐn)_(recA)分支遷移

(recA)

內(nèi)切酶(recBCD)

DNA

連接酶5′3′5′3′5′3′5′3′5′3′5′3′5′3′5′3′5′3′5′3′5′3′5′3′5′3′5′3′3′3′5′3′5′3′3′5′5′3′5′3′5′3′Holiday中間體5′3′5′3′5′3′5′3′7710現(xiàn)在是10頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日Holiday中間體5′3′5′3′5′3′5′3′5′5′3′5′5′3′3′3′3′5′5′5′5′3′3′3′3′5′5′5′5′3′3′3′5′5′5′5′3′3′3′3′5′5′5′5′3′3′3′3′內(nèi)切酶(ruvC)內(nèi)切酶(ruvC)DNA連接酶DNA連接酶片段重組體拼接重組體7711現(xiàn)在是11頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日DNA重組接合作用(conjugation)轉(zhuǎn)化作用(transformation)轉(zhuǎn)導(dǎo)作用

(transduction)轉(zhuǎn)座

(transposition)同源重組

(homologousrecombination)位點(diǎn)特異的重組(site-specificrecombination)7712現(xiàn)在是12頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日第二節(jié)

重組DNA技術(shù)

又稱DNA克隆或分子克隆

DNARecombinationTechniqueisalsoCalledDNACloningorMolecularClone7713現(xiàn)在是13頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日重組DNA技術(shù)的發(fā)展史1865年G.J.Mendel的豌豆雜交試驗(yàn)。1944年O.T.Avery的肺炎球菌轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)。1973年美國(guó)斯坦福大學(xué)的科學(xué)家構(gòu)建第一個(gè)重組DNA分子。1977年美國(guó)南舊金山由博耶和斯旺森建立世界上第一家遺傳工程公司,專門應(yīng)用重組DNA技術(shù)制造醫(yī)學(xué)上重要的藥物。1980年開始建造第一家應(yīng)用重組DNA技術(shù)生產(chǎn)胰島素的工廠。1997年英國(guó)羅林研究所成功的克隆了多莉。7714現(xiàn)在是14頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日7715現(xiàn)在是15頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日相關(guān)概念

DNA克隆工具酶目的基因基因載體基本原理重組DNA技術(shù)與醫(yī)學(xué)的關(guān)系本節(jié)主要內(nèi)容:7716現(xiàn)在是16頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日一、重組DNA技術(shù)相關(guān)概念克隆(clone):來(lái)自同一始祖的相同副本或拷貝的集合。獲取同一拷貝的過(guò)程稱為克隆化(cloning),即無(wú)性繁殖。(一)DNA克隆7717現(xiàn)在是17頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日技術(shù)水平:分子克隆(molecularclone)

(即DNA克?。?/p>

細(xì)胞克隆個(gè)體克隆(動(dòng)物或植物)

7718現(xiàn)在是18頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日應(yīng)用酶學(xué)的方法,在體外將各種來(lái)源的遺傳物質(zhì)(同源的或異源的、原核的或真核的、天然的或人工的DNA)與載體DNA接合成一具有自我復(fù)制能力的DNA分子——復(fù)制子(replicon),繼而通過(guò)轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)染宿主細(xì)胞,篩選出含有目的基因的轉(zhuǎn)化子細(xì)胞,再進(jìn)行擴(kuò)增提取獲得大量同一DNA分子,也稱基因克隆或重組DNA(recombinantDNA)

。

DNA克隆7719現(xiàn)在是19頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日生物技術(shù)工程:

基因工程、蛋白質(zhì)工程、酶工程、細(xì)胞工程等

目的:①分離獲得某一感興趣的基因或DNA②獲得感興趣基因的表達(dá)產(chǎn)物(蛋白質(zhì))基因工程(geneticengineering)

——實(shí)現(xiàn)基因克隆所用的方法及相關(guān)的工作稱基因工程,又稱重組DNA工藝學(xué)。7720現(xiàn)在是20頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日(二)工具酶

限制性核酸內(nèi)切酶

DNA聚合酶Ⅰ

逆轉(zhuǎn)錄酶

T4DNA連接酶堿性磷酸酶末端轉(zhuǎn)移酶

TaqDNA聚合酶7721現(xiàn)在是21頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日重組DNA技術(shù)中常用的工具酶工具酶功能限制性核酸內(nèi)切酶識(shí)別特異序列,切割DNADNA連接酶催化DNA中相鄰的5′磷酸基和3′羥基末端之間形成磷酸二酯鍵,使DNA切口封合或使兩個(gè)DNA分子或片段連接DNA聚合酶Ⅰ合成雙鏈cDNA分子或片段連接缺口平移制作高比活探針DNA序列分析填補(bǔ)3′末端Klenow片段又名DNA聚合酶I大片段,具有完整DNA聚合酶I的53聚合、35外切活性,而無(wú)53外切活性。常用于cDNA第二鏈合成,雙鏈DNA3末端標(biāo)記等反轉(zhuǎn)錄酶合成cDNA替代DNA聚合酶I進(jìn)行填補(bǔ),標(biāo)記或DNA序列分析多聚核苷酸激酶催化多聚核苷酸5′羥基末端磷酸化,或標(biāo)記探針末端轉(zhuǎn)移酶在3′羥基末端進(jìn)行同質(zhì)多聚物加尾堿性磷酸酶切除末端磷酸基7722現(xiàn)在是22頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日限制性核酸內(nèi)切酶(restrictionendonuclease)

限制性核酸內(nèi)切酶(restrictionendonuclease,RE)是識(shí)別DNA的特異序列,并在識(shí)別位點(diǎn)或其周圍切割雙鏈DNA的一類內(nèi)切酶。GGATCCCCTAGGGCCTAGGATCCG+BamHⅠ定義:7723現(xiàn)在是23頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日與甲基化酶共同構(gòu)成細(xì)菌的限制修飾系統(tǒng),限制外源DNA,保護(hù)自身DNA。Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ(基因工程技術(shù)中常用Ⅱ型)分類:酶的組成、所需因子及裂解DNA的方式作用:7724現(xiàn)在是24頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日第一個(gè)字母取自產(chǎn)生該酶的細(xì)菌屬名,用大寫;第二、第三個(gè)字母是該細(xì)菌的種名,用小寫;第四個(gè)字母代表株;用羅馬數(shù)字表示發(fā)現(xiàn)的先后次序。命名:Hin

dⅢ

株序Haemophilusinfluenzaed株流感嗜血桿菌d株的第三種酶7725現(xiàn)在是25頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日Ⅱ類酶識(shí)別序列特點(diǎn)——

回文結(jié)構(gòu)(palindrome)

切口:平端切口、粘端切口GGATCCCCTAGG7726現(xiàn)在是26頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日BamHⅠGTCCAGGCCTAGGATCCG+GGATCCCCTAGGHindⅡGTCGACCAGCTGGACCTG+平端切口粘端切口7727現(xiàn)在是27頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日(三)目的基因(targetgene)

cDNA(complementaryDNA)

指經(jīng)反轉(zhuǎn)錄合成的、與RNA(通常指mRNA或病毒RNA)互補(bǔ)的單鏈DNA。以單鏈cDNA為模板、經(jīng)聚合反應(yīng)可合成雙鏈cDNA。

基因組DNA(genomicDNA)

指代表一個(gè)細(xì)胞或生物體整套遺傳信息(染色體及線粒體)的所有DNA序列。

7728現(xiàn)在是28頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日(四)基因載體

定義為攜帶目的基因,實(shí)現(xiàn)其無(wú)性繁殖或表達(dá)有意義的蛋白質(zhì)所采用的一些DNA分子。

常用載體質(zhì)粒DNA噬菌體DNA病毒DNA7729現(xiàn)在是29頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日克隆載體(cloningvector)為使插入的外源DNA序列被擴(kuò)增而特意設(shè)計(jì)的載體稱為克隆載體。表達(dá)載體(expressionvector)為使插入的外源DNA序列可轉(zhuǎn)錄翻譯成多肽鏈而特意設(shè)計(jì)的載體稱為表達(dá)載體。7730現(xiàn)在是30頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日質(zhì)粒

(plasmid)特點(diǎn):能在宿主細(xì)胞內(nèi)獨(dú)立自主復(fù)制;帶有某些遺傳信息,會(huì)賦予宿主細(xì)胞一些遺傳性狀。7731現(xiàn)在是31頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日7732現(xiàn)在是32頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日

λ噬菌體DNA改造系統(tǒng)

λgt系列(插入型,適用cDNA克?。?/p>

EMBL系列(置換型,適用基因組克?。┦删w(phage)

M13噬菌體DNA改造系統(tǒng)(含lacZ基因)

M13mp系列

pUC系列7733現(xiàn)在是33頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日

酵母人工染色體

(yeastartificialchromosome,YAC)

細(xì)菌人工染色體

(bacterialartificialchromosome,BAC)

動(dòng)物病毒DNA改造的載體(如腺病毒,腺病毒相關(guān)病毒,逆轉(zhuǎn)錄病毒,桿狀病毒)其他7734現(xiàn)在是34頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日二、重組DNA技術(shù)基本原理基本原理目的基因的獲取DNA導(dǎo)入受體細(xì)胞外源基因與載體的連接克隆載體的選擇和構(gòu)建重組體的篩選克隆基因的表達(dá)

7735現(xiàn)在是35頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日重組DNA技術(shù)操作過(guò)程可形象歸納為:分分離目的基因切限制酶切目的基因與載體接拼接重組體

轉(zhuǎn)轉(zhuǎn)入受體細(xì)胞篩篩選重組體

7736現(xiàn)在是36頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日(一)目的基因的獲取化學(xué)合成法要求:已知目的基因的核苷酸序列或其產(chǎn)物的氨基酸序列?;蚪MDNA文庫(kù)(genomicDNAlibrary)cDNA文庫(kù)(cDNAlibrary)聚合酶鏈反應(yīng)(polymerasechainreaction,PCR)(見第22章)7737現(xiàn)在是37頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日化學(xué)合成法獲取目的基因由已知氨基酸序列推測(cè)可能的DNA序列。7738現(xiàn)在是38頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日組織或細(xì)胞染色體DNA基因片斷克隆載體重組DNA分子含重組分子的轉(zhuǎn)化菌限制性內(nèi)切酶受體菌基因組DNA文庫(kù)存在于轉(zhuǎn)化細(xì)胞內(nèi)由克隆載體所攜帶的所有基因組DNA的集合從基因組DNA文庫(kù)獲取目的基因7739現(xiàn)在是39頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日限制酶切位點(diǎn)限制酶消化除去中間片段cosLRcoscosL左臂Rcos右臂真核生物染色體DNA限制酶部分消化外源DNA與載體DNA混合連接反應(yīng)體外包裝用重組噬菌體感染大腸桿菌~20KbDNA片段cosLRcos~20Kb外源DNA片段基因文庫(kù)用隨機(jī)切割的真核生物染色體DNA片段構(gòu)建基因文庫(kù)7740現(xiàn)在是40頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日mRNAcDNA

雙鏈cDNA重組DNA分子cDNA文庫(kù)

反轉(zhuǎn)錄酶載體受體菌復(fù)制

從cDNA文庫(kù)獲取目的基因逆轉(zhuǎn)錄酶AAAA

TTTTAAAASI核酸酶

DNA聚合酶Ⅰ堿水解

TTTT7741現(xiàn)在是41頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日(二)克隆載體的選擇和構(gòu)建目的不同,操作基因的性質(zhì)不同,載體的選擇和改建方法也不同。7742現(xiàn)在是42頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日(三)外源基因與載體的連接粘性末端連接7743現(xiàn)在是43頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日BamHⅠ切割反應(yīng)

GGATCCCCTAGGT4

DNA連接酶15oCGATCCGGCCTAG+目的基因用BamHⅠ切割載體DNA用BamHⅠ切割重組體載體自連目的基因自連同一限制酶切位點(diǎn)連接7744現(xiàn)在是44頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日不同限制酶切位點(diǎn)(非配伍末端)的連接EcoRⅠ切割位點(diǎn)Bg

lⅡ切割位點(diǎn)+EcoRⅠ+Bg

lⅡ雙酶切EcoRⅠ+Bg

lⅡ雙酶切T4

DNA連接酶15oC重組體配伍末端的連接情況和同一限制酶切位點(diǎn)連接相似。7745現(xiàn)在是45頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日平端連接

7746現(xiàn)在是46頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日目的基因載體限制性內(nèi)切酶限制性內(nèi)切酶T4DNA連接酶15oC重組體載體自連目的基因自連7747現(xiàn)在是47頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日同聚物加尾連接7748現(xiàn)在是48頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日5′3′3′5′載體DNA5′3′3′5′目的基因限制酶或機(jī)械剪切限制酶5′3′3′5′5′3′T(T)nT

T(T)nT3′5′5′

3′3′5′3′A(A)nA

A(A)nA3′5′λ-核酸外切酶λ-核酸外切酶末端轉(zhuǎn)移酶+dATP末端轉(zhuǎn)移酶+dTTPT(T)nTA(A)nAA(A)nAT(T)nTT4

DNA連接酶15oC重組體5′7749現(xiàn)在是49頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日人工接頭(linker)連接7750現(xiàn)在是50頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日人工接頭及其應(yīng)用CCGAATTCGGGCTTAAGC5′-3′-EcoRⅠEcoRⅠEcoRⅠEcoRⅠ7751現(xiàn)在是51頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日受體菌條件:安全宿主菌限制酶和重組酶缺陷處于感受態(tài)(competent)

導(dǎo)入方式:轉(zhuǎn)化(transformation)轉(zhuǎn)染(transfection)感染(infection)(四)重組DNA導(dǎo)入受體菌7752現(xiàn)在是52頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日(五)重組體的篩選7753現(xiàn)在是53頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日(插入失活法)

抗藥性標(biāo)記選擇7754現(xiàn)在是54頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日α互補(bǔ)利用α互補(bǔ)原理篩選重組體pUC187755現(xiàn)在是55頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日重組DNA技術(shù)操作的主要步驟載體質(zhì)粒噬菌體病毒目的基因(外源基因)基因組DNA

cDNA人工合成PCR產(chǎn)物限制酶消化開環(huán)載體DNA目的基因連接酶重組體轉(zhuǎn)化體外包裝,轉(zhuǎn)染帶重組體的宿主篩選表型篩選酶切電泳鑒定菌落原位雜交7756現(xiàn)在是56頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日(六)克隆基因的表達(dá)7757現(xiàn)在是57頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日

標(biāo)準(zhǔn):選擇標(biāo)志 強(qiáng)啟動(dòng)子翻譯調(diào)控序列 多接頭克隆位點(diǎn)

E.coli表達(dá)體系的不足:不宜表達(dá)真核基因組DNA;不能加工表達(dá)的真核蛋白質(zhì);表達(dá)的蛋白質(zhì)常形成不溶性包涵體(inclusionbody)

;很難表達(dá)大量可溶性蛋白。1.原核表達(dá)體系(E.coli表達(dá)體系最為常用)7758現(xiàn)在是58頁(yè)\一共有64頁(yè)\編輯于星期日

優(yōu)點(diǎn):可表達(dá)克隆的cDNA及真核基因組DNA

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