PubMed 醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索

PubMed醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索第1頁(yè)/共56頁(yè)P(yáng)ubMed系統(tǒng)是用于檢索MEDLINE、PreMED-LINE數(shù)據(jù)庫(kù)的網(wǎng)上檢索系統(tǒng)。MEDLINE是美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書(shū)館最重要的書(shū)目文摘數(shù)據(jù)庫(kù)，內(nèi)容涉及醫(yī)學(xué)、護(hù)理學(xué)、牙科學(xué)、獸醫(yī)學(xué)、衛(wèi)生保健和基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)。收錄了全世界70多個(gè)國(guó)家和地區(qū)的4500余種生物醫(yī)學(xué)期刊，現(xiàn)有書(shū)目文摘條目1700萬(wàn)余條，時(shí)間起自1950s。

PubMed網(wǎng)上更新速度是每周一次。PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)收錄的文獻(xiàn)大多數(shù)原始語(yǔ)種也是英語(yǔ)，或有英文摘要，但1975年以前的文獻(xiàn)無(wú)英文摘要。第2頁(yè)/共56頁(yè)第3頁(yè)/共56頁(yè)一、輔助檢索功能

輔助檢索功能包括條件限定【Limits】、預(yù)覽/索引【Preview/Index】、檢索史【History】和粘貼板【Clipboard】4種功能設(shè)置。

第4頁(yè)/共56頁(yè)1、條件限定【Limits】的用法：點(diǎn)擊【Limits】按鈕，系統(tǒng)顯示多種限定條件供用戶選擇。其中，“AddedtoPubMedintheLast”指錄入系統(tǒng)的日期；“PublishedintheLast”指出版日期；“Linkstofulltext,Linkstofreefulltext,Abstracts”

（1975年前出版的文章的記錄中沒(méi)有文摘）；“Subsets”指只檢索PubMed下屬的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)（MEDLINE、PreMEDLINE，Publisher和AIDS數(shù)據(jù)庫(kù)）。

第5頁(yè)/共56頁(yè)第6頁(yè)/共56頁(yè)第7頁(yè)/共56頁(yè)第8頁(yè)/共56頁(yè)第9頁(yè)/共56頁(yè)第10頁(yè)/共56頁(yè)第11頁(yè)/共56頁(yè)2預(yù)覽/索引【Preview/Index】預(yù)覽/索引（Preview/Index）按鈕的用法及功能特征是：（1）在顯示檢索記錄之前先預(yù)覽檢索策略和檢索結(jié)果的記錄條數(shù)：在檢索輸入框內(nèi)鍵入檢索詞后，點(diǎn)擊【Preview/Index】按鈕后，顯示檢索策略和檢索結(jié)果的記錄數(shù)。點(diǎn)擊記錄數(shù)【Result】鏈接，系統(tǒng)顯示檢索結(jié)果。第12頁(yè)/共56頁(yè)（2）修改檢索策略：在“AllFields”，下拉菜單中選擇一個(gè)檢索字段，然后在提問(wèn)框內(nèi)增加檢索詞，點(diǎn)擊【Preview】按鈕，系統(tǒng)顯示新一次檢索結(jié)果的記錄數(shù)。這樣反復(fù)進(jìn)行，直到檢索結(jié)果記錄數(shù)量令人滿意為止。第13頁(yè)/共56頁(yè)第14頁(yè)/共56頁(yè)第15頁(yè)/共56頁(yè)從索引表中選詞檢索：在“AllFields”下拉菜單（PullDownMenu）中選擇一個(gè)檢索字段，然后在提問(wèn)框內(nèi)鍵入與選定字段相對(duì)應(yīng)的檢索詞語(yǔ)，點(diǎn)擊【Index】按鈕，系統(tǒng)顯示相應(yīng)字段的索引詞表（見(jiàn)上圖）。用鼠標(biāo)點(diǎn)亮其中一個(gè)檢索詞，然后，點(diǎn)擊合適的邏輯運(yùn)算符（AND、OR或NOT），被點(diǎn)亮的詞會(huì)自動(dòng)加進(jìn)檢索提問(wèn)框中。然后再點(diǎn)擊Preview鍵，系統(tǒng)顯示新檢索結(jié)果數(shù)。第16頁(yè)/共56頁(yè)3檢索史【History】【History】按鈕主要用于查看檢索策略，也可用于查看檢索結(jié)果記錄數(shù)量。點(diǎn)擊【History】，顯示檢索歷史：檢索序號(hào)、檢索式、檢索時(shí)間和檢索記錄數(shù)。要查看檢索到的記錄，直接點(diǎn)擊檢索結(jié)果數(shù)（Result）按鈕即可。在【History】狀態(tài)下，可以將檢索式用邏輯運(yùn)算符連接起來(lái)后再檢索。如在提問(wèn)框中鍵入#1AND#2，然后點(diǎn)擊【GO】。要清除檢索史，請(qǐng)點(diǎn)擊ClearHistory鍵。注意事項(xiàng)：

PuMed最多可保留100個(gè)檢索式，超過(guò)100個(gè)時(shí)自動(dòng)刪除最早的檢索式；進(jìn)行布爾邏輯運(yùn)算“AND”、“OR”、“NOT”運(yùn)算。第17頁(yè)/共56頁(yè)第18頁(yè)/共56頁(yè)4、粘貼板【Clipboard】的用法【Clipboard】是在檢索過(guò)程中存放檢索結(jié)果的地方，以便于集中存盤、打印或訂購(gòu)原文時(shí)使用。粘貼板最多能存放500條記錄。只要粘貼板中有記錄，就可點(diǎn)擊【Clipboard】查看其中的記錄（記錄為Summary格式）。粘貼板按記錄存放的先后順序顯示記錄題錄。要把檢索全部結(jié)果存入粘貼板，只需直接點(diǎn)擊SendtoClipboard鍵。如果把部分檢索結(jié)果存放在粘貼板，需要點(diǎn)擊該記錄左上角的選擇框作標(biāo)記后，再點(diǎn)擊SendtoClipboard鍵。粘貼板上的記錄序號(hào)顏色均變綠。第19頁(yè)/共56頁(yè)第20頁(yè)/共56頁(yè)二、單篇文獻(xiàn)匹配第21頁(yè)/共56頁(yè)單篇引文匹配檢索是具體到特定的單篇引文檢索，

PubMed提供的“單篇引文檢索”是一個(gè)填空表格，項(xiàng)目有雜志名稱、出版時(shí)間（可根據(jù)需要精確到年、月、日）、卷、期、起始頁(yè)碼、作者，用戶可以選擇性地將已知的相關(guān)信息填入表中，進(jìn)行檢索。出版時(shí)間（Date）輸入格式為：yy/mm/dd，月、日可以省略。適合于一次性查找大量特定記錄，用戶須按以下格式輸入其查詢請(qǐng)求：期刊名稱│出版年限│卷│論文起始頁(yè)碼│作者│用戶給該組論文命名│

第22頁(yè)/共56頁(yè)三、批量文獻(xiàn)匹配第23頁(yè)/共56頁(yè)四、詞匯自動(dòng)轉(zhuǎn)換功能

（AutomaticTermMapping）在PubMed主頁(yè)的檢索提問(wèn)框中鍵入檢索詞，系統(tǒng)將按順序使用如下4種表或索引，對(duì)檢索詞進(jìn)行轉(zhuǎn)換后再檢索。

（1）MeSH轉(zhuǎn)換表（MeSHTranslationTable），包括MeSH詞、參見(jiàn)詞、副主題詞等。如果系統(tǒng)在該表中發(fā)現(xiàn)了與檢索詞相匹配的詞，就會(huì)自動(dòng)將其轉(zhuǎn)換為相應(yīng)的MeSH詞和TextWord詞（題名詞和文摘詞）進(jìn)行檢索。例如：鍵入“Pancreaticcancer”，系統(tǒng)將其轉(zhuǎn)換成“PanreaticNeoplasms[MeSHTerms]ORPancreaticcancer[Textword]”后進(jìn)行檢索。

第24頁(yè)/共56頁(yè)第25頁(yè)/共56頁(yè)（2）刊名轉(zhuǎn)換表（JournalTanslationTable）包括刊名全稱、MEDLINE形式的縮寫和ISSN號(hào)。該轉(zhuǎn)換表能把鍵入的刊名全稱轉(zhuǎn)換為“MEDLINE縮寫[JournalName]”后進(jìn)行檢索。如：在檢索提問(wèn)框中鍵入：“newEnglandjournalofmedicine”,PubMed將其轉(zhuǎn)換為“NEnglJMed[JournalName]”后進(jìn)行檢索。

（3）短語(yǔ)表（4）作者索引第26頁(yè)/共56頁(yè)第27頁(yè)/共56頁(yè)五、強(qiáng)制檢索功能

在PubMed主頁(yè)的檢索提問(wèn)框中鍵入一個(gè)短語(yǔ)后點(diǎn)擊“Go”，系統(tǒng)會(huì)高速用自動(dòng)轉(zhuǎn)換功能查找到相應(yīng)的匹配詞后再進(jìn)行檢索；但是，當(dāng)鍵入的詞語(yǔ)無(wú)匹配詞時(shí)，PubMed就會(huì)將鍵入的詞語(yǔ)斷開(kāi)后再重復(fù)上述自動(dòng)詞匯轉(zhuǎn)換過(guò)程，若仍然沒(méi)有匹配詞，系統(tǒng)就將短語(yǔ)分解成單詞，再用AND聯(lián)在一起在全部字段中檢索。很明顯，這樣檢索的結(jié)果是不符合用戶要求的。因此，PubMed允許使用雙引號(hào)（“”）來(lái)強(qiáng)制系統(tǒng)進(jìn)行短語(yǔ)檢索。例如，在PubMed主頁(yè)的檢索提問(wèn)框中鍵入“Singlecell”，并用雙引號(hào)引起來(lái)，然后點(diǎn)擊“Go”，系統(tǒng)會(huì)將其作為一個(gè)不可分割的詞組在數(shù)據(jù)庫(kù)的全部字段中進(jìn)行檢索。

使用雙引號(hào)檢索，會(huì)自動(dòng)關(guān)閉詞匯轉(zhuǎn)換功能。

第28頁(yè)/共56頁(yè)第29頁(yè)/共56頁(yè)第30頁(yè)/共56頁(yè)

六、鏈接功能

1相關(guān)文獻(xiàn)鏈接

PubMed系統(tǒng)中的每一條文獻(xiàn)記錄均有一個(gè)相關(guān)文獻(xiàn)鏈接，在檢索結(jié)果的顯示狀態(tài)下，每條記錄的右邊均有【RelatedArticles，Links】鏈接，比較整個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中所有記錄與指定記錄的相似性，并將超過(guò)某一閥值的記錄按與指定記錄相似性高低程度排序輸出。點(diǎn)擊該鏈接按鈕，系統(tǒng)按文獻(xiàn)的相關(guān)度從高到低顯示。利用此超鏈可擴(kuò)大檢索范圍，獲得與所選記錄相關(guān)的文獻(xiàn)。第31頁(yè)/共56頁(yè)第32頁(yè)/共56頁(yè)第33頁(yè)/共56頁(yè)2全文鏈接

PubMed系統(tǒng)在以“Abstract”格式顯示檢索結(jié)果時(shí)，為每條能聯(lián)機(jī)獲取全文的記錄都設(shè)置了【FullTextArticle】的相關(guān)超級(jí)鏈接(多數(shù)為期刊名稱鏈接)。

第34頁(yè)/共56頁(yè)第35頁(yè)/共56頁(yè)第36頁(yè)/共56頁(yè)第37頁(yè)/共56頁(yè)第38頁(yè)/共56頁(yè)P(yáng)ubMed數(shù)據(jù)庫(kù)可使用的運(yùn)算符號(hào)

1截詞符*

PubMed允許使用“*”號(hào)作為截詞符進(jìn)行截詞檢索。如：鍵入“physi*”，系統(tǒng)會(huì)找到那些前一部分是physi的單詞（如phsics，physical，physiology等），并對(duì)其分別進(jìn)行檢索。如果這種詞少于150個(gè)，PuMed會(huì)逐個(gè)詞檢索，若超過(guò)150個(gè)（如：med*），pubMed將顯示如下警告信息：“Wildcardsearchfor‘term*’usedonlythefirst150variations.Lengthentherootwordtosearchforallendings.”。截詞功能只限于單詞，對(duì)詞組無(wú)效。使用截詞檢索功能時(shí)，PubMed系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)關(guān)閉詞匯轉(zhuǎn)換功能。

第39頁(yè)/共56頁(yè)2、強(qiáng)制檢索符“

”.3、布爾邏輯運(yùn)算符PuMed檢索系統(tǒng)允許使用布爾邏輯檢索，但要在提問(wèn)框中鍵入布爾邏輯運(yùn)算符（AND，OR或NOT）。如：#1AND#2。而且運(yùn)算符號(hào)AND、OR、NOT第40頁(yè)/共56頁(yè)P(yáng)ubMed檢索途徑和方法

1、詞語(yǔ)（主題）檢索

2著者檢索3刊名檢索

第41頁(yè)/共56頁(yè)八、檢索結(jié)果輸出功能

1顯示檢索結(jié)果（Displaying）其默認(rèn)Summary格式。命中記錄按該記錄被輸入pubMed時(shí)間排序輸出,最新的排在最前面。每頁(yè)顯示記錄數(shù)默認(rèn)值為20,“Show”功能鍵所帶的下拉菜單可以更改每頁(yè)顯示記錄數(shù),可選項(xiàng)從5條到500條不等。2、保存檢索結(jié)果（Saving）

PuMed系統(tǒng)允許最多可保存5000條記錄。存盤時(shí)PubMed默認(rèn)文件名為“query.fcgi”。該文件名可以修改，文件格式也可在“.Fcgi”和“.txt”中選擇。選擇.txt格式，便于用文字處理軟件和文本編輯器打開(kāi)所存文件。如果想存為超文本格式，則需要使用Web瀏覽器的“另存為...”功能，并選擇“.html”格式后再存盤。第42頁(yè)/共56頁(yè)第43頁(yè)/共56頁(yè)第44頁(yè)/共56頁(yè)第45頁(yè)/共56頁(yè)第46頁(yè)/共56頁(yè)第47頁(yè)/共56頁(yè)第48頁(yè)/共56頁(yè)3、打印檢索結(jié)果（printing）

4、訂閱文獻(xiàn)全文（Ordering）

點(diǎn)擊【Order】按鈕，即可訂閱全部檢索記錄的文獻(xiàn)全文；要訂閱部分記錄的文獻(xiàn)全文時(shí)，對(duì)選定的記錄予以標(biāo)記后，再點(diǎn)擊【Order】按鈕。如果檢索過(guò)程中已進(jìn)行過(guò)多次檢索，可將每次檢索結(jié)果添加到粘貼板后，再?gòu)恼迟N板中集中訂取文獻(xiàn)全文。該項(xiàng)服務(wù)為收費(fèi)項(xiàng)目。第49頁(yè)/共56頁(yè)第50頁(yè)/共56頁(yè)第51頁(yè)/共56頁(yè)九、其它功能臨床咨詢（Clinicalqueries）

臨床咨詢（Clinicalqueries）是pubMed設(shè)立的一個(gè)專供臨床醫(yī)生查找與臨床有關(guān)的數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)。PubMed采用過(guò)濾器（filters）技術(shù)，當(dāng)輸入一個(gè)檢索提問(wèn)詞時(shí)，系統(tǒng)只檢索與有關(guān)該提問(wèn)詞的治療（Therapy）、診斷（Diagnosis）、病因（etiology）、預(yù)后（Prognosis）和clinicalpredictionguides（臨床預(yù)測(cè)指南）等5個(gè)方面與臨床密切相關(guān)的文獻(xiàn)，用戶只能在這五方面進(jìn)行選擇檢索。第