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文檔簡介
關(guān)于蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能第一頁,共八十九頁,2022年,8月28日蛋白質(zhì)的概念蛋白質(zhì)(protein)是由許多氨基酸(aminoacid)通過肽鍵(peptidebond)相連形成的高分子含氮化合物。第二頁,共八十九頁,2022年,8月28日蛋白質(zhì)是生命活動的物質(zhì)基礎(chǔ)分布廣:所有器官、組織都含有蛋白質(zhì);細(xì)胞的各個部分都含有蛋白質(zhì)。含量高:蛋白質(zhì)是生物體中含量最豐富的生物大分子,約占人體固體成分的45%,而在細(xì)胞中可達(dá)細(xì)胞干重的70%以上。1.蛋白質(zhì)是生物體重要組成成分第三頁,共八十九頁,2022年,8月28日作為生物催化劑(酶)物質(zhì)的轉(zhuǎn)運和存儲凝血功能免疫保護作用運動與支持作用參與細(xì)胞間信息傳遞2.蛋白質(zhì)具有重要的生物學(xué)功能3.氧化供能蛋白質(zhì)是生命活動的物質(zhì)基礎(chǔ)第四頁,共八十九頁,2022年,8月28日
第一節(jié)蛋白質(zhì)的分子組成TheMolecularComponentofProtein第五頁,共八十九頁,2022年,8月28日蛋白質(zhì)的元素組成主要含有碳、氫、氧、氮及硫。有些蛋白質(zhì)還含有磷、鐵、銅、鋅、錳、鈷及鉬等。第六頁,共八十九頁,2022年,8月28日蛋白質(zhì)元素組成的特點蛋白質(zhì)的含氮量接近,平均為16%。測定生物樣品含氮量可推算出蛋白質(zhì)大致含量。
100克樣品中蛋白質(zhì)的含量(g%)=
每克樣品含氮克數(shù)×6.25×100第七頁,共八十九頁,2022年,8月28日一、蛋白質(zhì)的基本組成單位-氨基酸
氨基酸是蛋白質(zhì)的基本組成單位。自然界存在300余中氨基酸,組成蛋白質(zhì)的氨基酸僅有20種,且均為L-α-氨基酸
(除甘氨酸外)。第八頁,共八十九頁,2022年,8月28日H甘氨酸CH3丙氨酸L-氨基酸的通式RC+NH3COO-H第九頁,共八十九頁,2022年,8月28日
(一)氨基酸的分類
1.非極性脂肪族氨基酸
2.極性中性氨基酸
3.芳香族氨基酸
4.酸性氨基酸
5.堿性氨基酸第十頁,共八十九頁,2022年,8月28日1.非極性脂肪族氨基酸
第十一頁,共八十九頁,2022年,8月28日
2.中性極性氨基酸
第十二頁,共八十九頁,2022年,8月28日3.芳香族氨基酸
第十三頁,共八十九頁,2022年,8月28日4.酸性氨基酸
第十四頁,共八十九頁,2022年,8月28日5.堿性氨基酸第十五頁,共八十九頁,2022年,8月28日胱氨酸與二硫鍵第十六頁,共八十九頁,2022年,8月28日(二)氨基酸的理化性質(zhì)
1.兩性解離及等電點氨基酸是兩性電解質(zhì),其解離方式及帶電狀態(tài)取決于其所處溶液的酸堿度。
等電點(isoeletricpoint,pI)
在某一pH條件下,氨基酸解離成陽離子和陰離子的數(shù)量相等,分子呈電中性,此時溶液的pH稱為該氨基酸的等電點。第十七頁,共八十九頁,2022年,8月28日第十八頁,共八十九頁,2022年,8月28日2.氨基酸的紫外吸收酪氨酸、色氨酸含有共軛雙鍵,具有吸收紫外光的特性,在280nm處有最大吸收峰。蛋白質(zhì)在280nm處的紫外吸收與濃度成正比,可用于蛋白質(zhì)的定量分析。第十九頁,共八十九頁,2022年,8月28日第二十頁,共八十九頁,2022年,8月28日二、氨基酸與多肽氨基酸通過肽鍵(peptidebond)相連接的
形成多肽鏈(peptidechain)。(一)肽鍵(peptidebond)一分子氨基酸的α-羧基與另一分子的α-氨基,脫水縮合形成的酰胺鍵(-CO-NH-)稱為肽鍵。第二十一頁,共八十九頁,2022年,8月28日+-HOH甘氨酰甘氨酸肽鍵第二十二頁,共八十九頁,2022年,8月28日肽(peptide)是由氨基酸通過肽鍵縮合而形成的化合物。兩分子氨基酸縮合形成二肽,三分子氨基酸縮合則形成三肽……肽鏈中的氨基酸分子因為脫水縮合而基團不全,被稱為氨基酸殘基(residue)。由十個以內(nèi)氨基酸相連而成的肽稱為寡肽(oligopeptide),由更多的氨基酸相連形成的肽稱多肽(polypeptide)。第二十三頁,共八十九頁,2022年,8月28日N末端:多肽鏈中有游離α-氨基的一端C末端:多肽鏈中有游離α-羧基的一端多肽鏈有兩端:多肽鏈(polypeptidechain)是指許多氨基酸之間以肽鍵連接而成的一種結(jié)構(gòu)。第二十四頁,共八十九頁,2022年,8月28日N末端C末端牛核糖核酸酶第二十五頁,共八十九頁,2022年,8月28日(二)生物活性肽類由幾個至幾十個氨基酸殘基組成
谷胱甘肽(glutathione,GSH)
谷氨酸、半胱氨酸和甘氨酸組成,簡稱為谷胱甘肽。第二十六頁,共八十九頁,2022年,8月28日谷胱甘肽(glutathione,GSH)第二十七頁,共八十九頁,2022年,8月28日GSH過氧化物酶H2O22GSH2H2OGSSG
GSH還原酶NADPH+H+NADP+GSH與GSSG間的轉(zhuǎn)換第二十八頁,共八十九頁,2022年,8月28日
體內(nèi)許多激素屬寡肽或多肽
神經(jīng)肽(neuropeptide)多肽類激素及神經(jīng)肽第二十九頁,共八十九頁,2022年,8月28日三、蛋白質(zhì)的分類
1.根據(jù)蛋白質(zhì)分子的組成特點單純蛋白質(zhì)和結(jié)合蛋白質(zhì)2.根據(jù)分子形狀的不同球狀蛋白和纖維狀蛋白3.根據(jù)蛋白質(zhì)的主要功能功能活性蛋白質(zhì)和結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)。第三十頁,共八十九頁,2022年,8月28日第二節(jié)蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)TheMolecularStructureofProtein第三十一頁,共八十九頁,2022年,8月28日
蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)
一級結(jié)構(gòu)(primarystructure)二級結(jié)構(gòu)(secondarystructure)三級結(jié)構(gòu)(tertiarystructure)四級結(jié)構(gòu)(quaternarystructure)高級結(jié)構(gòu)第三十二頁,共八十九頁,2022年,8月28日
一、蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)從N端到C端氨基酸排列順序稱為蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)。一級結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)分子基本結(jié)構(gòu),決定蛋白質(zhì)空間構(gòu)象的基礎(chǔ)。蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象則是實現(xiàn)其生物學(xué)功能的基礎(chǔ)。一級結(jié)構(gòu)中的主要化學(xué)鍵是肽鍵。
第三十三頁,共八十九頁,2022年,8月28日牛胰島素的一級結(jié)構(gòu)一級結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)空間構(gòu)象和特異生物學(xué)功能的基礎(chǔ),但不是決定蛋白質(zhì)空間構(gòu)象的唯一因素。第三十四頁,共八十九頁,2022年,8月28日二、蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)在一級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,分子單鍵旋轉(zhuǎn)而盤曲、折疊形成特定空間構(gòu)象。蛋白質(zhì)的構(gòu)象包括主鏈構(gòu)象和側(cè)鏈構(gòu)象。蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)包括蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)和四級結(jié)構(gòu)。第三十五頁,共八十九頁,2022年,8月28日
(一)蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)
是指蛋白質(zhì)分子中某一肽鏈的局部空間結(jié)構(gòu),即多肽鏈中主鏈原子的相對空間排列分布,而不涉及氨基酸殘基側(cè)鏈的空間排布。穩(wěn)定因素:氫鍵第三十六頁,共八十九頁,2022年,8月28日肽平面
肽鍵具有部分雙鏈性質(zhì),因此肽鍵不能自由旋轉(zhuǎn),而使涉及肽鍵的6各原子共處于同一平面,稱為肽鍵平面,又稱肽單元。第三十七頁,共八十九頁,2022年,8月28日肽鍵平面示意圖肽鏈主鏈骨架原子即N(氨基氮)、Cα(α-碳原子)和Co(羰基碳)3個原子依次重復(fù)排列。第三十八頁,共八十九頁,2022年,8月28日2.蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的主要構(gòu)象形式
α-螺旋(α-helix)β-折疊(β-pleatedsheet)β-轉(zhuǎn)角(β-turn)
無規(guī)卷曲(randomcoil)第三十九頁,共八十九頁,2022年,8月28日(1)α-螺旋
多肽鏈中的主鏈圍繞中心軸有規(guī)律的螺旋式上升,螺旋的走向為順時針方向,稱右手螺旋。氫鍵是維持α-螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的主要化學(xué)鍵。第四十頁,共八十九頁,2022年,8月28日左手螺旋右手螺旋*第四十一頁,共八十九頁,2022年,8月28日α-螺旋結(jié)構(gòu)第四十二頁,共八十九頁,2022年,8月28日(1)肽單元圍繞中心軸呈有規(guī)律右手螺旋,每3.6個氨基酸殘基螺旋上升一圈,螺距為0.54nm;(2)α—螺旋的每個肽鍵的N—H與相鄰第四個肽鍵的羰基氧形成氫鍵(hydrogenbond),氫鍵的方向與螺旋長軸基本平行,是維持α—螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的主要次級鍵;(3)氨基酸側(cè)鏈伸向螺旋外側(cè),不參與α-螺旋的形成,但其形狀、大小及電荷量的多少均影響α—螺旋的形成。α-helix特點:第四十三頁,共八十九頁,2022年,8月28日(2)β-折疊
β-折疊呈折紙狀多肽鏈充分伸展,各個肽單元以Cα為旋轉(zhuǎn)點,依次折疊成鋸齒狀結(jié)構(gòu),氨基酸殘基側(cè)鏈交替地位于鋸齒狀結(jié)構(gòu)的上下方。第四十四頁,共八十九頁,2022年,8月28日第四十五頁,共八十九頁,2022年,8月28日β-折疊
第四十六頁,共八十九頁,2022年,8月28日β-pleatedsheets特點:1、多肽鏈充分伸展,各肽鍵平面之間折疊成鋸齒狀,側(cè)鏈
R基團位于鋸齒狀結(jié)構(gòu)的上下方;2、兩條以上肽鏈或一條肽鏈內(nèi)的若干肽段平行排列,其結(jié)
構(gòu)穩(wěn)定主要靠氫鍵維系(羰基上的氧和亞氨基上的氫),
氫鍵的方向與折疊的長軸垂直3、順平行折疊:兩條肽鏈走向相同;反平行折疊:兩條肽鏈走向相反;4、β—折疊涉及肽段一般比較短,只含5~10個氨基酸殘基。第四十七頁,共八十九頁,2022年,8月28日(3)β-轉(zhuǎn)角
出現(xiàn)于肽鏈進行180o回折時的轉(zhuǎn)角部位。由4個氨基酸殘基組成,由第一個殘基的羰基(O)與第四個殘基的氨基氧(H)形成氫鍵,以維持轉(zhuǎn)折結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定。第二個氨基酸殘基多為脯氨酸和甘氨酸。第四十八頁,共八十九頁,2022年,8月28日β-轉(zhuǎn)角
第四十九頁,共八十九頁,2022年,8月28日(4)無規(guī)卷曲
肽鏈為環(huán)或卷曲結(jié)構(gòu),沒有規(guī)律性排布,但是表現(xiàn)重要生物學(xué)功用,稱為“無規(guī)卷曲”。
第五十頁,共八十九頁,2022年,8月28日
3.二級結(jié)構(gòu)可組成蛋白質(zhì)分子中的模體在許多蛋白質(zhì)分子中,可發(fā)現(xiàn)二個或三個具有二級結(jié)構(gòu)的肽段,在空間上相互接近,形成一個有規(guī)則的二級結(jié)構(gòu)組合,被稱為超二級結(jié)構(gòu)或模體
(motif)
超二級結(jié)構(gòu)組合常見形式有3種:αα,βαβ,ββ。第五十一頁,共八十九頁,2022年,8月28日模體是具有特殊功能的超二級結(jié)構(gòu)。第五十二頁,共八十九頁,2022年,8月28日鈣結(jié)合蛋白中結(jié)合鈣離子的模體鋅指結(jié)構(gòu)模體常見的形式第五十三頁,共八十九頁,2022年,8月28日
(二)蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)是指整條肽鏈中全部氨基酸殘基的相對空間排布,即整條肽鏈所有原子在三維空間的排布位置。主要靠次級鍵,包括氫鍵、離子鍵(鹽鍵)、疏水作用、范德華力、二硫鍵等。第五十四頁,共八十九頁,2022年,8月28日第五十五頁,共八十九頁,2022年,8月28日肌紅蛋白N端C端第五十六頁,共八十九頁,2022年,8月28日結(jié)構(gòu)域(domain)
分子量較大的蛋白質(zhì)可折疊成多個結(jié)構(gòu)較為緊密的區(qū)域,并各行其功能,稱為結(jié)構(gòu)域。
結(jié)構(gòu)域含有序列上連續(xù)的100~200個氨基酸殘基,有較為獨立的三維結(jié)構(gòu)。第五十七頁,共八十九頁,2022年,8月28日3-磷酸甘油醛脫氫酶亞基的結(jié)構(gòu)示意圖第五十八頁,共八十九頁,2022年,8月28日
(三)蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)
每一條具有完整三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈,稱為亞基。各亞基之間以非共價鍵相互連接形成特定的三維空間構(gòu)象,稱為蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)。
維持四級結(jié)構(gòu)的作用力主要是疏水作用,包括氫鍵、離子鍵及范德華力等。第五十九頁,共八十九頁,2022年,8月28日血紅蛋白由2個α亞基和2個β亞基構(gòu)成的四聚體,每個亞基中都結(jié)合1個血紅素輔基。4亞基通過8個離子鍵相連,形成血紅蛋白的四聚體。完整的血紅蛋白分子具有運輸O2和CO2的功能。第六十頁,共八十九頁,2022年,8月28日蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)-血紅蛋白結(jié)構(gòu)第六十一頁,共八十九頁,2022年,8月28日由2個以上亞基組成的蛋白質(zhì)四級結(jié)構(gòu)中,若亞基分子結(jié)構(gòu)相同,稱之為同二聚體(homodimer),若亞基分子結(jié)構(gòu)不同,則稱之為異二聚體(heterodimer)。第六十二頁,共八十九頁,2022年,8月28日第三節(jié)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系TheRelationofStructureandFunctionofprotein第六十三頁,共八十九頁,2022年,8月28日
一、蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系
蛋白質(zhì)的功能是由其特定的構(gòu)象所決定的,一級結(jié)構(gòu)是空間構(gòu)象的基礎(chǔ)。某些肽段一級結(jié)構(gòu)(氨基酸組成)決定特定二級結(jié)構(gòu)(α-螺旋或β-折疊)的形成。
第六十四頁,共八十九頁,2022年,8月28日牛核糖核酸酶的一級結(jié)構(gòu)二硫鍵第六十五頁,共八十九頁,2022年,8月28日
天然狀態(tài),有催化活性
尿素、β-巰基乙醇
去除尿素、β-巰基乙醇非折疊狀態(tài),無活性第六十六頁,共八十九頁,2022年,8月28日哺乳類動物胰島素氨基酸序列的差異第六十七頁,共八十九頁,2022年,8月28日
蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)中起關(guān)鍵作用的氨基酸殘基缺失或被替代,可通過影響空間構(gòu)象而影響其生理功能。
例如血紅蛋白β亞基的第6位谷氨酸被纈氨酸替代,可導(dǎo)致鐮刀形貧血。第六十八頁,共八十九頁,2022年,8月28日例:鐮刀形紅細(xì)胞貧血N-Val·His·Leu·Thr·Pro·Glu·Glu·····C(146)HbSβ肽鏈HbAβ肽鏈N-Val·His·Leu·Thr·Pro·Val
·Glu·····C(146)
這種由蛋白質(zhì)分子發(fā)生變異所導(dǎo)致的疾病,稱為“分子病”第六十九頁,共八十九頁,2022年,8月28日二、蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系
蛋白質(zhì)多種多樣的功能與各種蛋白質(zhì)特定的空間構(gòu)象密切相關(guān),所以蛋白質(zhì)構(gòu)象是其生物活性的基礎(chǔ)。第七十頁,共八十九頁,2022年,8月28日肌紅蛋白和血紅蛋白的結(jié)構(gòu)肌紅蛋白與血紅蛋白都是含有血紅素輔基的蛋白質(zhì)。肌紅蛋白是一個只有三級結(jié)構(gòu)的單鏈蛋白質(zhì),它的三級結(jié)構(gòu)折疊方式使輔基血紅素能與O2結(jié)合與解散,發(fā)揮儲氧的功能。第七十一頁,共八十九頁,2022年,8月28日血紅素結(jié)構(gòu)第七十二頁,共八十九頁,2022年,8月28日血紅蛋白的構(gòu)象變化與運氧功能隨氧分壓增高,氧合Hb占總Hb的百分?jǐn)?shù)隨之增加,這一變化關(guān)系稱為氧解離曲線。第七十三頁,共八十九頁,2022年,8月28日肌紅蛋白(Mb)和血紅蛋白(Hb)的氧解離曲線第七十四頁,共八十九頁,2022年,8月28日第七十五頁,共八十九頁,2022年,8月28日蛋白質(zhì)構(gòu)象改變可引起疾病蛋白質(zhì)構(gòu)象疾?。喝舻鞍踪|(zhì)的折疊發(fā)生錯誤,盡管其一級結(jié)構(gòu)不變,但蛋白質(zhì)的構(gòu)象發(fā)生改變,仍可影響其功能,嚴(yán)重時可導(dǎo)致疾病發(fā)生。第七十六頁,共八十九頁,2022年,8月28日瘋牛病是由朊病毒蛋白(prionprotein,PrP)引起的一組人和動物神經(jīng)退行性病變。正常的PrP富含α-螺旋,稱為PrPc。PrPc在某種未知蛋白質(zhì)的作用下可轉(zhuǎn)變成全為β-折疊的PrPsc,從而致病。第七十七頁,共八十九頁,2022年,8月28日第四節(jié)蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)ThePhysicalandChemicalCharactersofProtein第七十八頁,共八十九頁,2022年,8月28日一、蛋白質(zhì)的兩性解離
蛋白質(zhì)分子在一定的溶液pH條件下可解離成帶負(fù)電荷或正電荷的基團。當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)溶液處于某一pH時,蛋白質(zhì)解離成正、負(fù)離子的趨勢相等,此時溶液的pH稱為蛋白質(zhì)的等電點。
利用蛋白質(zhì)兩性電離的性質(zhì),可通過電泳、離子交換層析、等電聚焦等技術(shù)分離蛋白質(zhì)。第七十九頁,共八十九頁,2022年,8月28日二、蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì)蛋白質(zhì)是高分子化合物
蛋白質(zhì)膠體穩(wěn)定性的因素:顆粒表面水化膜表面電荷除去上述兩個穩(wěn)定因素時,蛋白質(zhì)從溶液中析出。第八十頁,共八十九頁,2022年,8月28日+++++++帶正電荷的蛋白質(zhì)--------帶負(fù)電荷的蛋白質(zhì)在等電點的蛋白質(zhì)水化膜++++++++帶正電荷的蛋白質(zhì)--------帶負(fù)電荷的蛋白質(zhì)不穩(wěn)定的蛋白質(zhì)顆粒酸堿酸堿酸堿脫水作用脫水作用脫水作用溶液中蛋白質(zhì)的沉淀第八十一頁,共八十九頁,2022
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