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一、 填空1)蛋白質(zhì)的形成分兩個(gè)階段,第一階段是:第二階段是,其中第二階段目前尚不清楚其機(jī)制。2)蛋白質(zhì)修飾的化學(xué)途徑包括和。3)蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)分為基于及全新蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)或蛋白質(zhì)從頭設(shè)計(jì)。4) 定位突變可以在蛋白質(zhì)中??梢赃M(jìn)行3類突變:,,替換或取代一個(gè)或多個(gè)氨基酸殘基。5)設(shè)計(jì)一個(gè)新奇的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的中心問(wèn)題是。要達(dá)到這個(gè)目標(biāo)需要克服的基本障礙是線性聚合鏈的構(gòu)象熵。可以采用不同的策略達(dá)到這個(gè)目標(biāo)。最主要是使相互作用的強(qiáng)度與數(shù)目達(dá)到最大。另一個(gè)策略是通過(guò)共價(jià)交叉連接減小折疊的構(gòu)象熵。6)根據(jù)基因突變技術(shù)待點(diǎn),可將基因突變分為兩大類:和。位點(diǎn)特異性突變又可大體分為三種類型:一類是通過(guò)寡核苷酸介導(dǎo)的基因突變;第二類是盒式突變或片段取代突變;第三類是。7)在基因水平上對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行改造,按改造的規(guī)模和程度可以分為三種:,即個(gè)別氨基酸的改變和一整段氨基酸序列的刪除、置換或插入;,即蛋白質(zhì)分子的剪裁,如結(jié)構(gòu)域的拼接;從頭設(shè)計(jì)合成新型蛋白質(zhì)。8)蛋白質(zhì)修飾的化學(xué)途徑包括功能基團(tuán)的特異性修飾、 。9)按照結(jié)構(gòu)域分類,將蛋白質(zhì)的域結(jié)構(gòu)劃分為、、、a+p型結(jié)構(gòu)、無(wú)規(guī)型/富含二硫鍵和金屬離子型。10) 蛋白質(zhì)工程的化學(xué)方法通常是產(chǎn)生半合成的結(jié)構(gòu).在此結(jié)構(gòu)中一個(gè)天然的多肽與一個(gè)人造(或化學(xué)修飾)的多肽相締合。產(chǎn)生這種締合的方法主要有、產(chǎn)生二硫鍵、、產(chǎn)生非天然型的共價(jià)鍵連接。二、 名詞解釋1) 蛋白質(zhì)工程2) 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域三、 判斷1)由于空間排斥較小,蛋白質(zhì)的重疊構(gòu)象比交錯(cuò)構(gòu)象穩(wěn)定。()2) 二硫鍵的形成需要一個(gè)氧化環(huán)境,因此它一般并不存在于細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)中,其形成可以穩(wěn)定蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)。()3) 許多蛋白質(zhì)作為完整的活性分子,是兩條以上的多肽鏈組成,它們各自以獨(dú)特的一級(jí)、二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu)域相互以非共價(jià)作用聯(lián)結(jié),共同構(gòu)成完整的蛋白質(zhì)分子。()4) 蛋白質(zhì)中的螺旋結(jié)構(gòu)有a螺旋、P螺旋、3]0螺旋和k螺旋()5) 計(jì)算蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)包括能量表達(dá)、能量?jī)?yōu)化、殘基分類、側(cè)鏈構(gòu)象的離散化、功能位點(diǎn)設(shè)計(jì)、專一性、穩(wěn)定性及序列空間的穩(wěn)健性預(yù)測(cè)等方面內(nèi)容。()6) 熱力學(xué)分析可以用于測(cè)量突變蛋白質(zhì)的熱穩(wěn)定性及化學(xué)變化自由能,并可作為構(gòu)象整體性的檢測(cè)。X射線品體學(xué)及NMR譜可以直接提供突變蛋白的高分辨率結(jié)構(gòu)及評(píng)估結(jié)構(gòu)整體性。()7) 根據(jù)基因突變技術(shù)待點(diǎn),可將基因突變分為兩大類:位點(diǎn)特異性突變和隨機(jī)突變。()8) 設(shè)計(jì)一個(gè)新奇的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的中心問(wèn)題是設(shè)計(jì)一個(gè)具有穩(wěn)定及獨(dú)特的三維結(jié)構(gòu)的序列。要達(dá)到這個(gè)目標(biāo)需要克服的基本障礙是線性聚合鏈的構(gòu)象熵。可以采用不同的策略達(dá)到這個(gè)目標(biāo)。最主要是使相互作用的強(qiáng)度與數(shù)目達(dá)到最小。另一個(gè)策略是通過(guò)共價(jià)交叉連接增大折疊的構(gòu)象熵。()四、選擇1)下列( )不是蛋白質(zhì)功能殘基的鑒定方法。根據(jù)結(jié)構(gòu)信息確定殘基的突變隨機(jī)突變、刪除分析等實(shí)驗(yàn)方法可用于鑒定功能殘基利用蛋白質(zhì)同源性鑒定功能殘基應(yīng)用氣相色譜技術(shù)鑒定功能殘基2)按照結(jié)構(gòu)域分類,將蛋白質(zhì)的域結(jié)構(gòu)劃分為( )等。A.a型結(jié)構(gòu)B.p型結(jié)構(gòu)C.a/p型結(jié)構(gòu)D.a+。型結(jié)構(gòu)無(wú)規(guī)型/富含二硫鍵和金屬離子型3) 在蛋白質(zhì)的各種分離方法中利用其帶電性質(zhì)及帶電荷多少的不同分離的方法有( )。A.離子交換色譜 B.電泳技術(shù)C.疏水色譜 。.雙水相萃取E.親和色譜)。4)在多肽鏈折疊形成蛋白質(zhì)的天然結(jié)構(gòu)中的非共價(jià)作用力有(

)。B.氫鍵DB.氫鍵D.肽鍵C.離子相互作用E.疏水效應(yīng)5)蛋白質(zhì)工程的化學(xué)方法通常是產(chǎn)生半合成的結(jié)構(gòu).在此結(jié)構(gòu)中一個(gè)天然的多肽與一個(gè)人造(或化學(xué)修飾)的多肽相締合。產(chǎn)生這種締合的方法主要有( ):A-非共價(jià)締合 B.產(chǎn)生二硫鍵。.形成肽鍵 D.產(chǎn)生非天然型的共價(jià)鍵連接。E.酶解反應(yīng)五、問(wèn)答思考題1) 蛋白質(zhì)突變體的設(shè)計(jì)包括哪幾個(gè)步驟?請(qǐng)簡(jiǎn)述蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)原理。2) 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的從頭設(shè)計(jì)方法主要有哪些?3) 蛋白質(zhì)工程改造的策略有哪些?請(qǐng)總結(jié)至少三點(diǎn)4) 重組蛋白的表達(dá)系統(tǒng)有哪些組成?5) 原核表達(dá)系統(tǒng)有什么優(yōu)點(diǎn)和缺點(diǎn)?真核表達(dá)系統(tǒng)的必要性及優(yōu)勢(shì)有哪些?6) 蛋白質(zhì)工程自問(wèn)世以來(lái),短短十幾年的時(shí)間,已取得了引人矚目的進(jìn)展。請(qǐng)結(jié)合你的理解,舉例說(shuō)明什么是蛋白質(zhì)工程?7) 蛋白質(zhì)工程的基本步驟可以分為哪五步?一定要對(duì)經(jīng)過(guò)改造的蛋白質(zhì)進(jìn)行功能性測(cè)定嗎?8) 蛋白質(zhì)分離純化的原則有哪些?主要的分離純化技術(shù)及其依據(jù)是什么?9) 葡萄糖異構(gòu)酶最適pH為堿性,在80°C穩(wěn)定,而在堿性條件下,80°C時(shí)使高果糖漿焦化產(chǎn)生有害物質(zhì),反應(yīng)只能在60C進(jìn)行。如果將葡萄糖異構(gòu)酶分子中酸性氨基酸(Glu或Asp)集中的區(qū)域置換為堿性氨基酸(Arg或Lys),就可使葡萄糖異構(gòu)酶的最適pH值變?yōu)樗嵝?,即可在高溫下進(jìn)行反應(yīng)。請(qǐng)結(jié)合蛋白質(zhì)工程,分析如何可以完成此項(xiàng)突變工

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