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rna的生物合成和加工課件rna的生物合成和加工課件一、轉(zhuǎn)錄——DNA指導(dǎo)下RNA的合成12/26/20222一、轉(zhuǎn)錄——DNA指導(dǎo)下RNA的合成12/18/20222DNA復(fù)制:以DNA為模板合成DNA,遺傳信息自上一代細(xì)胞向下一代細(xì)胞傳遞轉(zhuǎn)錄:以DNA為模板合成RNA,遺傳信息自DNA轉(zhuǎn)錄至RNA分子翻譯:以mRNA為模板合成蛋白質(zhì),遺傳信息表達(dá)至蛋白質(zhì)反轉(zhuǎn)錄:以RNA為模板合成DNA(RNA病毒、真核細(xì)胞的端粒酶)RNA復(fù)制:以RNA為模板合成RNA(RNA病毒)12/26/20223DNA復(fù)制:以DNA為模板合成DNA,遺傳信息自上一代細(xì)胞向(一)模板1、轉(zhuǎn)錄模板兩股DNA單鏈中只有一股可轉(zhuǎn)錄可作為模板轉(zhuǎn)錄成RNA的一股DNA鏈——模板鏈對(duì)應(yīng)的一股DNA鏈——編碼鏈能轉(zhuǎn)錄出mRNA,指導(dǎo)蛋白質(zhì)合成的部分——結(jié)構(gòu)基因其余的DNA可能轉(zhuǎn)錄(rRNA,tRNA),也可能不轉(zhuǎn)錄12/26/20224(一)模板1、轉(zhuǎn)錄模板兩股DNA單鏈中只有一股可轉(zhuǎn)錄122、不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄在一個(gè)包含許多基因的雙鏈DNA分子中,各個(gè)基因的模板鏈不一定是同一條,對(duì)于某些基因以某一條鏈為模板進(jìn)行轉(zhuǎn)錄,而對(duì)另一些基因則可由另一鏈為模板鏈。12/26/202252、不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄在一個(gè)包含許多基因的雙鏈DNA分子中,各個(gè)基因1.模板:DNA2.合成方向:5′→3′3.酶:均依賴DNA4.堿基互補(bǔ)配對(duì)原則5.產(chǎn)物:多聚核苷酸鏈復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的異同點(diǎn)相同點(diǎn):12/26/202261.模板:DNA復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的異同點(diǎn)相同點(diǎn):12/18/202不同點(diǎn):復(fù)制轉(zhuǎn)錄模板兩股鏈均作為模板模板鏈作為模板原料dNTPNTP聚合酶DNA聚合酶RNA聚合酶產(chǎn)物子代DNA雙鏈mRNA;tRNA;rRNA配對(duì)A-T;G-CA-U;T-A;G-C引物RNA引物不需要引物方式(特點(diǎn))半保留復(fù)制不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄12/26/20227不同點(diǎn):復(fù)制轉(zhuǎn)錄模板兩股鏈均作為模板模(二)參與轉(zhuǎn)錄的酶1.原核細(xì)胞的RNA聚合酶σ因子為起始因子2.真核細(xì)胞的RNA聚合酶Ⅰ(核仁):催化rRNA前體的合成;Ⅱ:催化mRNA的合成;Ⅲ:催化小分子RNA的合成12/26/20228(二)參與轉(zhuǎn)錄的酶1.原核細(xì)胞的RNA聚合酶σ因子為起始Mw:465~480kD亞基組成:α2ββ′σ(全酶)
α2ββ′(核心酶)1、原核生物的RNA聚合酶(大腸桿菌)σ:起始因子,識(shí)別DNA模板上的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)前的特異堿基序列,引導(dǎo)RNA聚合酶結(jié)合到DNA的啟動(dòng)子,開始轉(zhuǎn)錄不同菌種σ因子大小差別很大轉(zhuǎn)錄開始后,σ脫離聚合酶,核心酶催化RNA的延長(zhǎng)12/26/20229Mw:465~480kD1、原核生物的RNA聚合酶(大腸桿菌RNA鏈的轉(zhuǎn)錄起始于DNA模板的一個(gè)特定位點(diǎn),其上游有特異的堿基序列,為啟動(dòng)子(promoter)并在另一位點(diǎn)處終止(終止子terminator)此轉(zhuǎn)錄區(qū)域稱為轉(zhuǎn)錄單位(DNA)轉(zhuǎn)錄單位:轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)12/26/202210RNA鏈的轉(zhuǎn)錄起始于DNA模板的一個(gè)特定位點(diǎn),轉(zhuǎn)錄單位:轉(zhuǎn)錄大腸桿菌的RNA聚合酶全酶由5種亞基α2ββ’σ組成,σ因子與其它部分的結(jié)合不是十分緊密,它易于與β’βα2分離,沒有σ亞基的酶稱為核心酶——只催化鏈的延長(zhǎng),對(duì)起始無(wú)作用。四種亞基的功能分別為:
α亞基:與啟動(dòng)子結(jié)合功能。
β亞基:含催化部位,起催化作用,催化形成磷酸二酯鍵。
β’亞基:與DNA模板結(jié)合功能。
σ亞基:識(shí)別起始位點(diǎn)。
12/26/202211大腸桿菌的RNA聚合酶12/18/202211RNA聚合酶:Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ專一地轉(zhuǎn)錄不同的基因轉(zhuǎn)錄過(guò)程、產(chǎn)物不同對(duì)鵝膏蕈堿的敏感性不同2、真核生物的RNA聚合酶加工產(chǎn)生5.8SrRNA,18SrRNA、28SrRNA12/26/202212RNA聚合酶:Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ2、真核生物的RNA聚合酶加工產(chǎn)生58~14個(gè)亞基,Mw500KD左右無(wú)σ識(shí)別亞基轉(zhuǎn)錄:起始復(fù)合體(轉(zhuǎn)錄因子、啟動(dòng)子、RNA聚合酶)線粒體、葉綠體RNA聚合酶類似于原核生物mRNA不穩(wěn)定,壽命短,RNA聚合酶Ⅱ最重要12/26/2022138~14個(gè)亞基,Mw500KD左右12/18/20221(三)轉(zhuǎn)錄過(guò)程:起始、延長(zhǎng)、終止σ因子辨認(rèn)啟動(dòng)子RNA聚合酶結(jié)合到DNA的啟動(dòng)子,開始轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)子具有共有的序列——保守序列或一致性序列:在-10bp處有-TATAAT-,Pribnow盒;-35bp處有-TTGACA-,辨認(rèn)點(diǎn)1、模板的識(shí)別:12/26/202214(三)轉(zhuǎn)錄過(guò)程:起始、延長(zhǎng)、終止σ因子辨認(rèn)啟動(dòng)子1、模板的σ識(shí)別正確的啟動(dòng)位點(diǎn),啟動(dòng)子的結(jié)構(gòu)至少由三部分組成:-35序列提供了RNA聚合酶全酶識(shí)別的信號(hào);-10序列是酶的緊密結(jié)合位點(diǎn)(富含AT堿基,利于雙鏈打開);第三部分是RNA合成的起始點(diǎn)。3’5’+1轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)AACTGTATATTATTGACATATAAT5’3’-35序列
Sextama框-10序列Pribnow框12/26/202215σ識(shí)別正確的啟動(dòng)位點(diǎn),啟動(dòng)子的結(jié)構(gòu)至少由三部分組成:3’5’
單獨(dú)的核心酶與DNA隨機(jī)疏松結(jié)合(低親和力),不能區(qū)分啟動(dòng)子和一般序列全酶:與啟動(dòng)子結(jié)合牢固(高親和力),并開始轉(zhuǎn)錄全酶通過(guò)擴(kuò)散作用與DNA隨機(jī)結(jié)合與酶結(jié)合的DNA迅速被置換全酶不斷改變與DNA的結(jié)合部位,直到啟動(dòng)子,轉(zhuǎn)變?yōu)榫o密結(jié)合12/26/202216單獨(dú)的核心酶全酶:與啟動(dòng)子結(jié)合牢固(高親和力),并開始轉(zhuǎn)錄
真核生物:轉(zhuǎn)錄因子識(shí)別啟動(dòng)子RNA聚合酶在起點(diǎn)處形成起始復(fù)合體-25bp(Hogness盒)CAATGCTATAmRNA轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)增強(qiáng)子,增強(qiáng)啟動(dòng)子活性,增強(qiáng)子序列可以遠(yuǎn)離啟動(dòng)子幾千bp,位于上游或者下游,位于模板鏈或編碼鏈,均能發(fā)揮作用12/26/202217真核生物:轉(zhuǎn)錄因子識(shí)別啟動(dòng)子mRNA轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)增強(qiáng)子,增強(qiáng)啟動(dòng)子和轉(zhuǎn)錄因子啟動(dòng)子:與基因表達(dá)相關(guān)的特定的DNA序列(順式作用元件)RNA聚合酶與之特異結(jié)合,基因轉(zhuǎn)錄的開始部位強(qiáng)啟動(dòng)子2秒鐘啟動(dòng)依次一次轉(zhuǎn)錄弱啟動(dòng)子10分鐘一次轉(zhuǎn)錄因子:RNA聚合酶起始轉(zhuǎn)錄需要的輔助因子(蛋白質(zhì))與順式作用元件結(jié)合(反式作用因子)識(shí)別啟動(dòng)子12/26/202218啟動(dòng)子和轉(zhuǎn)錄因子啟動(dòng)子:與基因表達(dá)相關(guān)的特定的DNA序列(2、轉(zhuǎn)錄的起始在模板鏈上通過(guò)堿基配對(duì)合成最初的RNA鏈加入的第一個(gè)核苷三磷酸常是GTP或ATP。所形成的啟動(dòng)子、全酶和核苷三磷酸復(fù)合物稱為三元起始復(fù)合物,第一個(gè)核苷三磷酸一旦摻入到轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn),σ亞基就會(huì)被釋放脫離核心酶。12/26/2022192、轉(zhuǎn)錄的起始在模板鏈上通過(guò)堿基配對(duì)合成最初的RNA鏈加入3、轉(zhuǎn)錄的延伸σ因子脫離,核心酶向前移動(dòng),RNA鏈延長(zhǎng)原核、真核生物基本相同,不需要引物σ因子脫落,核心酶構(gòu)象變松弛RNA的5′端伸展在轉(zhuǎn)錄空泡之外模板為A,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物相應(yīng)為U原核生物:轉(zhuǎn)錄、翻譯同時(shí)進(jìn)行12/26/2022203、轉(zhuǎn)錄的延伸σ因子脫離,核心酶向前移動(dòng),RNA鏈延長(zhǎng)原核第一個(gè)堿基總是G或A12/26/202221第一個(gè)堿基總是G或A12/18/2022214、轉(zhuǎn)錄的終止RNA聚合酶到達(dá)基因轉(zhuǎn)錄終點(diǎn)RNA、RNA聚合酶自DNA脫離不依賴ρ因子:模板鏈終止區(qū)的堿基形成特殊結(jié)構(gòu)RNA3′端形成莖環(huán)結(jié)構(gòu)和一串寡聚U依賴ρ因子(ρ因子與RNA結(jié)合,具ATP酶、解鏈酶活性)1)原核生物轉(zhuǎn)錄終止:終止子:能夠使轉(zhuǎn)錄終止的DNA序列終止因子:協(xié)助RNA聚合酶識(shí)別終止信號(hào)的輔助蛋白質(zhì)因子抗終止因子:能夠使轉(zhuǎn)錄酶越過(guò)終止子繼續(xù)轉(zhuǎn)錄蛋白質(zhì)因子12/26/2022224、轉(zhuǎn)錄的終止RNA聚合酶到達(dá)基因轉(zhuǎn)錄終點(diǎn)不依賴ρ因子:模不依賴ρ因子12/26/202223不依賴ρ因子12/18/20222312/26/20222412/18/2022242)真核生物的轉(zhuǎn)錄終止
編碼鏈:mRNA合成一段AAUAAA,在此處酶將其切斷。
mRNA:polyA尾巴12/26/2022252)真核生物的轉(zhuǎn)錄終止編碼鏈:mRNA合成一段AAUAA二、轉(zhuǎn)錄后加工轉(zhuǎn)錄生成的RNA——初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物(前體RNA,RNA前體)無(wú)論是原核、真核生物,初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物必須經(jīng)過(guò)一定程度的加工、修飾,才能體現(xiàn)生物學(xué)功能——轉(zhuǎn)錄后加工常見形式:去除或添加核苷酸、剪切拼接等12/26/202226二、轉(zhuǎn)錄后加工轉(zhuǎn)錄生成的RNA——初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物(前體RNA原核生物轉(zhuǎn)錄后加工相對(duì)簡(jiǎn)單
mRNA:轉(zhuǎn)錄、翻譯同時(shí)進(jìn)行,一般不進(jìn)行加工修飾
tRNA、rRNA:加工,剪切和修飾真核生物轉(zhuǎn)錄后加工較復(fù)雜RNA轉(zhuǎn)錄在細(xì)胞核、翻譯在細(xì)胞質(zhì),因此先轉(zhuǎn)錄,后翻譯hnRNA經(jīng)加帽、切尾,切除內(nèi)含子、拼接外顯子形成mRNARNA通過(guò)不同的加工方式,表達(dá)不同的信息12/26/202227原核生物轉(zhuǎn)錄后加工相對(duì)簡(jiǎn)單mRNA:轉(zhuǎn)錄、翻譯同時(shí)進(jìn)行,一(一)原核生物的rRNA加工E.Coli:7個(gè)rRNA的轉(zhuǎn)錄單位轉(zhuǎn)錄單位:16S、23S、5SRNA、若干tRNA基因組成16S、23S之間常由tRNA隔開12/26/202228(一)原核生物的rRNA加工E.Coli:7個(gè)rRNA的轉(zhuǎn)(二)原核生物的tRNA加工1)5‘切割2)3’切割3)3’加CCA-OH4)堿基修飾成稀有堿基(甲基化堿基、假尿苷)5)拼接(RNA酶P)12/26/202229(二)原核生物的tRNA加工1)5‘切割12/18/202212/26/20223012/18/202230真核mRNA的剪輯真核生物的結(jié)構(gòu)基因通常是斷裂的斷裂基因(Splitgeneorinterruptedgene)表達(dá)蛋白質(zhì)的基因中間被一些不能表達(dá)蛋白質(zhì)的核苷酸序列(插入序列或內(nèi)含子)隔開,致使一個(gè)結(jié)構(gòu)基因被斷裂成若干部分,這樣的基因~(二)真核細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄后加工12/26/202231真核mRNA的剪輯真核生物的結(jié)構(gòu)基因通常是斷裂的斷裂基因(S外顯子(exon)DNA分子中編碼mRNA某一部分序列的區(qū)域;真核細(xì)胞中,結(jié)構(gòu)基因一般被若干插入順序(內(nèi)含子)隔開被隔開的每一部分均稱為外顯子內(nèi)含子(intron)基因中能被轉(zhuǎn)錄成前體轉(zhuǎn)錄物,卻不能成為mRNA組成成分的序列(插入序列,居間序列;interveningsequence)原核基因中一般(除少數(shù)外)不含內(nèi)含子真核基因均含數(shù)量不等、大小不一的內(nèi)含子12/26/202232外顯子(exon)DNA分子中編碼mRNA某一部分序列的區(qū)12/26/20223312/18/20223312/26/20223412/18/202234真核mRNA剪接:切除內(nèi)含子、拼接外顯子12/26/202235真核mRNA剪接:切除內(nèi)含子、拼接外顯子12/18/202212/26/20223612/18/20223612/26/20223712/18/20223712/26/20223812/18/202238原核細(xì)胞基因表達(dá)轉(zhuǎn)錄調(diào)控方式基因表達(dá)調(diào)控概述:特定的基因在特定的時(shí)間和部位進(jìn)行特定量的表達(dá)原核生物以操縱子為單元進(jìn)行表達(dá)和調(diào)控,特異的阻遏蛋白是控制原核啟動(dòng)序列活性的重要因素。操作子:由幾個(gè)功能相關(guān)的調(diào)控結(jié)構(gòu)基因及其調(diào)控區(qū)組成一個(gè)基因表達(dá)的協(xié)同單位。啟動(dòng)子:結(jié)合RNA聚合酶操縱區(qū):控制RNA聚合酶能否通過(guò)的“開關(guān)”阻遏基因:位于調(diào)控區(qū)上游,能夠轉(zhuǎn)錄為阻遏物12/26/202239原核細(xì)胞基因表達(dá)轉(zhuǎn)錄調(diào)控方式基因表達(dá)調(diào)控概述:特定的基因在特原核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)節(jié)——操縱子學(xué)說(shuō)乳糖操縱子(誘導(dǎo)操縱子)的調(diào)節(jié)機(jī)制色氨酸操縱子(阻遏操縱子)的調(diào)節(jié)機(jī)制12/26/202240原核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)節(jié)——操縱子學(xué)說(shuō)乳糖操縱子(誘導(dǎo)操縱子)乳糖操縱子(lacoperon)調(diào)控區(qū)阻遏基因啟動(dòng)子操縱區(qū)結(jié)構(gòu)基因Z:β-半乳糖苷酶Y:透酶A:乙?;D(zhuǎn)移酶ZYAOPDNAI12/26/202241乳糖操縱子(lacoperon)調(diào)控區(qū)阻遏基因啟動(dòng)子操縱阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)
當(dāng)無(wú)誘導(dǎo)物乳糖存在時(shí),調(diào)節(jié)基因編碼的阻遏蛋白(repressorprotein)處于活性狀態(tài),阻止RNA聚合酶與啟動(dòng)基因的結(jié)合,則無(wú)法啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄。當(dāng)有乳糖存在時(shí),乳糖進(jìn)入細(xì)胞,經(jīng)β-半乳糖苷酶催化,轉(zhuǎn)變?yōu)榘肴樘恰:笳咦鳛橐环N誘導(dǎo)劑分子結(jié)合阻遏蛋白,使蛋白構(gòu)象變化,導(dǎo)致阻遏蛋白與O序列解離、轉(zhuǎn)錄發(fā)生。12/26/202242阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)12/18/202242mRNA阻遏蛋白IDNAZYAOPpol沒有乳糖存在時(shí)阻遏基因與操縱區(qū)結(jié)合,RNA聚合酶則不起作用,不轉(zhuǎn)錄乳糖操縱子:乳糖可作為誘導(dǎo)物,誘導(dǎo)分解利用乳糖的酶的基因轉(zhuǎn)錄12/26/202243mRNA阻遏蛋白IDNAZYAOPpol沒有乳糖存在時(shí)阻遏基mRNA阻遏蛋白有乳糖存在時(shí)IDNAZYAOPpol啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄mRNA乳糖半乳糖β-半乳糖苷酶12/26/202244mRNA阻遏蛋白有乳糖存在時(shí)IDNAZYAOPpol啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄CAP(分解代謝基因活化蛋白)的正性調(diào)節(jié)
當(dāng)沒有葡萄糖及cAMP濃度較高時(shí),cAMP與CAP結(jié)合,可刺激RNA轉(zhuǎn)錄活性。葡萄糖的分解代謝產(chǎn)物能降低cAMP的濃度,CAP不能被活化形成CAP-cAMP復(fù)合物,則不能轉(zhuǎn)錄。lac阻遏蛋白負(fù)性調(diào)節(jié)與CAP正性調(diào)節(jié)兩種機(jī)制協(xié)調(diào)合作:當(dāng)Lac阻遏蛋白封閉轉(zhuǎn)錄時(shí),CAP對(duì)該系統(tǒng)不能發(fā)揮作用;但是如果沒有CAP存在來(lái)加強(qiáng)轉(zhuǎn)錄活性,即使阻遏蛋白從操縱序列上解聚仍幾無(wú)轉(zhuǎn)錄活性。
lac操縱子強(qiáng)的誘導(dǎo)作用既需要乳糖存在又需缺乏葡萄糖。12/26/202245CAP(分解代謝基因活化蛋白)的正性調(diào)節(jié)12/18/202阻遏蛋白操縱區(qū)結(jié)構(gòu)基因調(diào)節(jié)基因mRNA酶蛋白阻遏蛋白不能與操縱區(qū)結(jié)合,所以通常結(jié)構(gòu)基因表達(dá)。酶代謝產(chǎn)物一旦大量積累阻遏蛋白被產(chǎn)物激活,結(jié)構(gòu)基因不表達(dá)。原核生物基因主要是轉(zhuǎn)錄控制。Trp操縱子----產(chǎn)物阻遏常規(guī)酶的合成12/26/202246阻遏蛋白操縱區(qū)結(jié)構(gòu)基因調(diào)節(jié)基因mRNA酶蛋白阻遏蛋白不能與操真核細(xì)胞基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控順式作用元件(cis-actingelements)
真核基因的順式調(diào)控元件是基因周圍能與特異轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合而影響轉(zhuǎn)錄的DNA序列。其中主要是起正性調(diào)控作用的順式作用元件,包括啟動(dòng)子(promoter)、增強(qiáng)子(enhancer)。12/26/202247真核細(xì)胞基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控順式作用元件(cis-actinge反式作用因子(trans-actingfactors)與順式作用元件進(jìn)行特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)因子TBP(TATAboxbindingprotein)是唯一能識(shí)別TATA盒并與其結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子,是三種RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄時(shí)都需要的;不同基因由不同的上游啟動(dòng)子元件組成,能與不同的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合,這些轉(zhuǎn)錄因子通過(guò)與基礎(chǔ)的轉(zhuǎn)錄復(fù)合體作用而影響轉(zhuǎn)錄的效率。同一DNA序列可被不同的蛋白因子所識(shí)別;能直接結(jié)合DNA序列的蛋白因子是少數(shù),但不同的蛋白因子間可以相互作用,因而多數(shù)轉(zhuǎn)錄因子是通過(guò)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)間作用與DNA序列聯(lián)系并影響轉(zhuǎn)錄效率的12/26/202248反式作用因子(trans-actingfactors)12蛋白質(zhì)的鋅指結(jié)構(gòu)
轉(zhuǎn)錄調(diào)控的實(shí)質(zhì)在于蛋白質(zhì)與DNA、蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)之間的相互作用
堿性亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu)及其與DNA的結(jié)合
12/26/202249蛋白質(zhì)的鋅指結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)錄調(diào)控的實(shí)質(zhì)在于蛋白質(zhì)與DNA、蛋白質(zhì)與逆轉(zhuǎn)錄:以RNA為模板合成DNA以病毒RNA為模板,以dNTP為原料,由逆轉(zhuǎn)錄酶催化,按堿基配對(duì)規(guī)律合成DNA的過(guò)程逆轉(zhuǎn)錄酶:依賴于RNA模板,具有催化合成DNA的活性——依賴RNA的DNA聚合酶RNA單鏈DNA(cDNA)雙鏈DNA插入寄主DNA逆轉(zhuǎn)錄酶:RNA病毒——潛在的致癌可能12/26/202250逆轉(zhuǎn)錄:以RNA為模板合成DNA以病毒RNA為模板,12/26/20225112/18/202251啟動(dòng)子是指()A.DNA分子中能轉(zhuǎn)錄的序列B.轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)時(shí)RNA聚合酶識(shí)別與結(jié)合的DNA序列C.與阻遏蛋白結(jié)合的DNA序列D.含有轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)的DNA序列E.與反式作用因子結(jié)合的RNA序列12/26/202252啟動(dòng)子是指()12/18/202252下列酶中哪一種酶需要引物?ARNA聚合酶;BDNA聚合酶;C引物酶;DDNA連接酶。12/26/202253下列酶中哪一種酶需要引物?12/18/202253增強(qiáng)子的特點(diǎn)的是()A.增強(qiáng)子單獨(dú)存在可以啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄B.增強(qiáng)子的方向?qū)ζ涔δ苡休^大的影響C.增強(qiáng)子不能位于結(jié)構(gòu)基因內(nèi)D.增強(qiáng)子增加啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄活性E.增強(qiáng)子不能位于啟動(dòng)子內(nèi)12/26/202254增強(qiáng)子的特點(diǎn)的是()12/18/202254原核生物參與轉(zhuǎn)錄起始的酶是A、引物酶B、RNA聚合酶ⅢC、RNA聚合酶核心酶D、RNA聚合酶全酶12/26/202255原核生物參與轉(zhuǎn)錄起始的酶是12/18/202255在真核生物中tRNA和5SrRNA的轉(zhuǎn)錄是由下列哪種酶催化的A、RNA聚合酶ⅠB、逆轉(zhuǎn)錄酶C、RNA聚合酶ⅡD、RNA聚合酶Ⅲ12/26/202256在真核生物中tRNA和5SrRNA的轉(zhuǎn)錄是由下列哪種酶催化的rna的生物合成和加工課件rna的生物合成和加工課件一、轉(zhuǎn)錄——DNA指導(dǎo)下RNA的合成12/26/202258一、轉(zhuǎn)錄——DNA指導(dǎo)下RNA的合成12/18/20222DNA復(fù)制:以DNA為模板合成DNA,遺傳信息自上一代細(xì)胞向下一代細(xì)胞傳遞轉(zhuǎn)錄:以DNA為模板合成RNA,遺傳信息自DNA轉(zhuǎn)錄至RNA分子翻譯:以mRNA為模板合成蛋白質(zhì),遺傳信息表達(dá)至蛋白質(zhì)反轉(zhuǎn)錄:以RNA為模板合成DNA(RNA病毒、真核細(xì)胞的端粒酶)RNA復(fù)制:以RNA為模板合成RNA(RNA病毒)12/26/202259DNA復(fù)制:以DNA為模板合成DNA,遺傳信息自上一代細(xì)胞向(一)模板1、轉(zhuǎn)錄模板兩股DNA單鏈中只有一股可轉(zhuǎn)錄可作為模板轉(zhuǎn)錄成RNA的一股DNA鏈——模板鏈對(duì)應(yīng)的一股DNA鏈——編碼鏈能轉(zhuǎn)錄出mRNA,指導(dǎo)蛋白質(zhì)合成的部分——結(jié)構(gòu)基因其余的DNA可能轉(zhuǎn)錄(rRNA,tRNA),也可能不轉(zhuǎn)錄12/26/202260(一)模板1、轉(zhuǎn)錄模板兩股DNA單鏈中只有一股可轉(zhuǎn)錄122、不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄在一個(gè)包含許多基因的雙鏈DNA分子中,各個(gè)基因的模板鏈不一定是同一條,對(duì)于某些基因以某一條鏈為模板進(jìn)行轉(zhuǎn)錄,而對(duì)另一些基因則可由另一鏈為模板鏈。12/26/2022612、不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄在一個(gè)包含許多基因的雙鏈DNA分子中,各個(gè)基因1.模板:DNA2.合成方向:5′→3′3.酶:均依賴DNA4.堿基互補(bǔ)配對(duì)原則5.產(chǎn)物:多聚核苷酸鏈復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的異同點(diǎn)相同點(diǎn):12/26/2022621.模板:DNA復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的異同點(diǎn)相同點(diǎn):12/18/202不同點(diǎn):復(fù)制轉(zhuǎn)錄模板兩股鏈均作為模板模板鏈作為模板原料dNTPNTP聚合酶DNA聚合酶RNA聚合酶產(chǎn)物子代DNA雙鏈mRNA;tRNA;rRNA配對(duì)A-T;G-CA-U;T-A;G-C引物RNA引物不需要引物方式(特點(diǎn))半保留復(fù)制不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄12/26/202263不同點(diǎn):復(fù)制轉(zhuǎn)錄模板兩股鏈均作為模板模(二)參與轉(zhuǎn)錄的酶1.原核細(xì)胞的RNA聚合酶σ因子為起始因子2.真核細(xì)胞的RNA聚合酶Ⅰ(核仁):催化rRNA前體的合成;Ⅱ:催化mRNA的合成;Ⅲ:催化小分子RNA的合成12/26/202264(二)參與轉(zhuǎn)錄的酶1.原核細(xì)胞的RNA聚合酶σ因子為起始Mw:465~480kD亞基組成:α2ββ′σ(全酶)
α2ββ′(核心酶)1、原核生物的RNA聚合酶(大腸桿菌)σ:起始因子,識(shí)別DNA模板上的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)前的特異堿基序列,引導(dǎo)RNA聚合酶結(jié)合到DNA的啟動(dòng)子,開始轉(zhuǎn)錄不同菌種σ因子大小差別很大轉(zhuǎn)錄開始后,σ脫離聚合酶,核心酶催化RNA的延長(zhǎng)12/26/202265Mw:465~480kD1、原核生物的RNA聚合酶(大腸桿菌RNA鏈的轉(zhuǎn)錄起始于DNA模板的一個(gè)特定位點(diǎn),其上游有特異的堿基序列,為啟動(dòng)子(promoter)并在另一位點(diǎn)處終止(終止子terminator)此轉(zhuǎn)錄區(qū)域稱為轉(zhuǎn)錄單位(DNA)轉(zhuǎn)錄單位:轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)12/26/202266RNA鏈的轉(zhuǎn)錄起始于DNA模板的一個(gè)特定位點(diǎn),轉(zhuǎn)錄單位:轉(zhuǎn)錄大腸桿菌的RNA聚合酶全酶由5種亞基α2ββ’σ組成,σ因子與其它部分的結(jié)合不是十分緊密,它易于與β’βα2分離,沒有σ亞基的酶稱為核心酶——只催化鏈的延長(zhǎng),對(duì)起始無(wú)作用。四種亞基的功能分別為:
α亞基:與啟動(dòng)子結(jié)合功能。
β亞基:含催化部位,起催化作用,催化形成磷酸二酯鍵。
β’亞基:與DNA模板結(jié)合功能。
σ亞基:識(shí)別起始位點(diǎn)。
12/26/202267大腸桿菌的RNA聚合酶12/18/202211RNA聚合酶:Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ專一地轉(zhuǎn)錄不同的基因轉(zhuǎn)錄過(guò)程、產(chǎn)物不同對(duì)鵝膏蕈堿的敏感性不同2、真核生物的RNA聚合酶加工產(chǎn)生5.8SrRNA,18SrRNA、28SrRNA12/26/202268RNA聚合酶:Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ2、真核生物的RNA聚合酶加工產(chǎn)生58~14個(gè)亞基,Mw500KD左右無(wú)σ識(shí)別亞基轉(zhuǎn)錄:起始復(fù)合體(轉(zhuǎn)錄因子、啟動(dòng)子、RNA聚合酶)線粒體、葉綠體RNA聚合酶類似于原核生物mRNA不穩(wěn)定,壽命短,RNA聚合酶Ⅱ最重要12/26/2022698~14個(gè)亞基,Mw500KD左右12/18/20221(三)轉(zhuǎn)錄過(guò)程:起始、延長(zhǎng)、終止σ因子辨認(rèn)啟動(dòng)子RNA聚合酶結(jié)合到DNA的啟動(dòng)子,開始轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)子具有共有的序列——保守序列或一致性序列:在-10bp處有-TATAAT-,Pribnow盒;-35bp處有-TTGACA-,辨認(rèn)點(diǎn)1、模板的識(shí)別:12/26/202270(三)轉(zhuǎn)錄過(guò)程:起始、延長(zhǎng)、終止σ因子辨認(rèn)啟動(dòng)子1、模板的σ識(shí)別正確的啟動(dòng)位點(diǎn),啟動(dòng)子的結(jié)構(gòu)至少由三部分組成:-35序列提供了RNA聚合酶全酶識(shí)別的信號(hào);-10序列是酶的緊密結(jié)合位點(diǎn)(富含AT堿基,利于雙鏈打開);第三部分是RNA合成的起始點(diǎn)。3’5’+1轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)AACTGTATATTATTGACATATAAT5’3’-35序列
Sextama框-10序列Pribnow框12/26/202271σ識(shí)別正確的啟動(dòng)位點(diǎn),啟動(dòng)子的結(jié)構(gòu)至少由三部分組成:3’5’
單獨(dú)的核心酶與DNA隨機(jī)疏松結(jié)合(低親和力),不能區(qū)分啟動(dòng)子和一般序列全酶:與啟動(dòng)子結(jié)合牢固(高親和力),并開始轉(zhuǎn)錄全酶通過(guò)擴(kuò)散作用與DNA隨機(jī)結(jié)合與酶結(jié)合的DNA迅速被置換全酶不斷改變與DNA的結(jié)合部位,直到啟動(dòng)子,轉(zhuǎn)變?yōu)榫o密結(jié)合12/26/202272單獨(dú)的核心酶全酶:與啟動(dòng)子結(jié)合牢固(高親和力),并開始轉(zhuǎn)錄
真核生物:轉(zhuǎn)錄因子識(shí)別啟動(dòng)子RNA聚合酶在起點(diǎn)處形成起始復(fù)合體-25bp(Hogness盒)CAATGCTATAmRNA轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)增強(qiáng)子,增強(qiáng)啟動(dòng)子活性,增強(qiáng)子序列可以遠(yuǎn)離啟動(dòng)子幾千bp,位于上游或者下游,位于模板鏈或編碼鏈,均能發(fā)揮作用12/26/202273真核生物:轉(zhuǎn)錄因子識(shí)別啟動(dòng)子mRNA轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)增強(qiáng)子,增強(qiáng)啟動(dòng)子和轉(zhuǎn)錄因子啟動(dòng)子:與基因表達(dá)相關(guān)的特定的DNA序列(順式作用元件)RNA聚合酶與之特異結(jié)合,基因轉(zhuǎn)錄的開始部位強(qiáng)啟動(dòng)子2秒鐘啟動(dòng)依次一次轉(zhuǎn)錄弱啟動(dòng)子10分鐘一次轉(zhuǎn)錄因子:RNA聚合酶起始轉(zhuǎn)錄需要的輔助因子(蛋白質(zhì))與順式作用元件結(jié)合(反式作用因子)識(shí)別啟動(dòng)子12/26/202274啟動(dòng)子和轉(zhuǎn)錄因子啟動(dòng)子:與基因表達(dá)相關(guān)的特定的DNA序列(2、轉(zhuǎn)錄的起始在模板鏈上通過(guò)堿基配對(duì)合成最初的RNA鏈加入的第一個(gè)核苷三磷酸常是GTP或ATP。所形成的啟動(dòng)子、全酶和核苷三磷酸復(fù)合物稱為三元起始復(fù)合物,第一個(gè)核苷三磷酸一旦摻入到轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn),σ亞基就會(huì)被釋放脫離核心酶。12/26/2022752、轉(zhuǎn)錄的起始在模板鏈上通過(guò)堿基配對(duì)合成最初的RNA鏈加入3、轉(zhuǎn)錄的延伸σ因子脫離,核心酶向前移動(dòng),RNA鏈延長(zhǎng)原核、真核生物基本相同,不需要引物σ因子脫落,核心酶構(gòu)象變松弛RNA的5′端伸展在轉(zhuǎn)錄空泡之外模板為A,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物相應(yīng)為U原核生物:轉(zhuǎn)錄、翻譯同時(shí)進(jìn)行12/26/2022763、轉(zhuǎn)錄的延伸σ因子脫離,核心酶向前移動(dòng),RNA鏈延長(zhǎng)原核第一個(gè)堿基總是G或A12/26/202277第一個(gè)堿基總是G或A12/18/2022214、轉(zhuǎn)錄的終止RNA聚合酶到達(dá)基因轉(zhuǎn)錄終點(diǎn)RNA、RNA聚合酶自DNA脫離不依賴ρ因子:模板鏈終止區(qū)的堿基形成特殊結(jié)構(gòu)RNA3′端形成莖環(huán)結(jié)構(gòu)和一串寡聚U依賴ρ因子(ρ因子與RNA結(jié)合,具ATP酶、解鏈酶活性)1)原核生物轉(zhuǎn)錄終止:終止子:能夠使轉(zhuǎn)錄終止的DNA序列終止因子:協(xié)助RNA聚合酶識(shí)別終止信號(hào)的輔助蛋白質(zhì)因子抗終止因子:能夠使轉(zhuǎn)錄酶越過(guò)終止子繼續(xù)轉(zhuǎn)錄蛋白質(zhì)因子12/26/2022784、轉(zhuǎn)錄的終止RNA聚合酶到達(dá)基因轉(zhuǎn)錄終點(diǎn)不依賴ρ因子:模不依賴ρ因子12/26/202279不依賴ρ因子12/18/20222312/26/20228012/18/2022242)真核生物的轉(zhuǎn)錄終止
編碼鏈:mRNA合成一段AAUAAA,在此處酶將其切斷。
mRNA:polyA尾巴12/26/2022812)真核生物的轉(zhuǎn)錄終止編碼鏈:mRNA合成一段AAUAA二、轉(zhuǎn)錄后加工轉(zhuǎn)錄生成的RNA——初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物(前體RNA,RNA前體)無(wú)論是原核、真核生物,初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物必須經(jīng)過(guò)一定程度的加工、修飾,才能體現(xiàn)生物學(xué)功能——轉(zhuǎn)錄后加工常見形式:去除或添加核苷酸、剪切拼接等12/26/202282二、轉(zhuǎn)錄后加工轉(zhuǎn)錄生成的RNA——初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物(前體RNA原核生物轉(zhuǎn)錄后加工相對(duì)簡(jiǎn)單
mRNA:轉(zhuǎn)錄、翻譯同時(shí)進(jìn)行,一般不進(jìn)行加工修飾
tRNA、rRNA:加工,剪切和修飾真核生物轉(zhuǎn)錄后加工較復(fù)雜RNA轉(zhuǎn)錄在細(xì)胞核、翻譯在細(xì)胞質(zhì),因此先轉(zhuǎn)錄,后翻譯hnRNA經(jīng)加帽、切尾,切除內(nèi)含子、拼接外顯子形成mRNARNA通過(guò)不同的加工方式,表達(dá)不同的信息12/26/202283原核生物轉(zhuǎn)錄后加工相對(duì)簡(jiǎn)單mRNA:轉(zhuǎn)錄、翻譯同時(shí)進(jìn)行,一(一)原核生物的rRNA加工E.Coli:7個(gè)rRNA的轉(zhuǎn)錄單位轉(zhuǎn)錄單位:16S、23S、5SRNA、若干tRNA基因組成16S、23S之間常由tRNA隔開12/26/202284(一)原核生物的rRNA加工E.Coli:7個(gè)rRNA的轉(zhuǎn)(二)原核生物的tRNA加工1)5‘切割2)3’切割3)3’加CCA-OH4)堿基修飾成稀有堿基(甲基化堿基、假尿苷)5)拼接(RNA酶P)12/26/202285(二)原核生物的tRNA加工1)5‘切割12/18/202212/26/20228612/18/202230真核mRNA的剪輯真核生物的結(jié)構(gòu)基因通常是斷裂的斷裂基因(Splitgeneorinterruptedgene)表達(dá)蛋白質(zhì)的基因中間被一些不能表達(dá)蛋白質(zhì)的核苷酸序列(插入序列或內(nèi)含子)隔開,致使一個(gè)結(jié)構(gòu)基因被斷裂成若干部分,這樣的基因~(二)真核細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄后加工12/26/202287真核mRNA的剪輯真核生物的結(jié)構(gòu)基因通常是斷裂的斷裂基因(S外顯子(exon)DNA分子中編碼mRNA某一部分序列的區(qū)域;真核細(xì)胞中,結(jié)構(gòu)基因一般被若干插入順序(內(nèi)含子)隔開被隔開的每一部分均稱為外顯子內(nèi)含子(intron)基因中能被轉(zhuǎn)錄成前體轉(zhuǎn)錄物,卻不能成為mRNA組成成分的序列(插入序列,居間序列;interveningsequence)原核基因中一般(除少數(shù)外)不含內(nèi)含子真核基因均含數(shù)量不等、大小不一的內(nèi)含子12/26/202288外顯子(exon)DNA分子中編碼mRNA某一部分序列的區(qū)12/26/20228912/18/20223312/26/20229012/18/202234真核mRNA剪接:切除內(nèi)含子、拼接外顯子12/26/202291真核mRNA剪接:切除內(nèi)含子、拼接外顯子12/18/202212/26/20229212/18/20223612/26/20229312/18/20223712/26/20229412/18/202238原核細(xì)胞基因表達(dá)轉(zhuǎn)錄調(diào)控方式基因表達(dá)調(diào)控概述:特定的基因在特定的時(shí)間和部位進(jìn)行特定量的表達(dá)原核生物以操縱子為單元進(jìn)行表達(dá)和調(diào)控,特異的阻遏蛋白是控制原核啟動(dòng)序列活性的重要因素。操作子:由幾個(gè)功能相關(guān)的調(diào)控結(jié)構(gòu)基因及其調(diào)控區(qū)組成一個(gè)基因表達(dá)的協(xié)同單位。啟動(dòng)子:結(jié)合RNA聚合酶操縱區(qū):控制RNA聚合酶能否通過(guò)的“開關(guān)”阻遏基因:位于調(diào)控區(qū)上游,能夠轉(zhuǎn)錄為阻遏物12/26/202295原核細(xì)胞基因表達(dá)轉(zhuǎn)錄調(diào)控方式基因表達(dá)調(diào)控概述:特定的基因在特原核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)節(jié)——操縱子學(xué)說(shuō)乳糖操縱子(誘導(dǎo)操縱子)的調(diào)節(jié)機(jī)制色氨酸操縱子(阻遏操縱子)的調(diào)節(jié)機(jī)制12/26/202296原核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)節(jié)——操縱子學(xué)說(shuō)乳糖操縱子(誘導(dǎo)操縱子)乳糖操縱子(lacoperon)調(diào)控區(qū)阻遏基因啟動(dòng)子操縱區(qū)結(jié)構(gòu)基因Z:β-半乳糖苷酶Y:透酶A:乙酰基轉(zhuǎn)移酶ZYAOPDNAI12/26/202297乳糖操縱子(lacoperon)調(diào)控區(qū)阻遏基因啟動(dòng)子操縱阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)
當(dāng)無(wú)誘導(dǎo)物乳糖存在時(shí),調(diào)節(jié)基因編碼的阻遏蛋白(repressorprotein)處于活性狀態(tài),阻止RNA聚合酶與啟動(dòng)基因的結(jié)合,則無(wú)法啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄。當(dāng)有乳糖存在時(shí),乳糖進(jìn)入細(xì)胞,經(jīng)β-半乳糖苷酶催化,轉(zhuǎn)變?yōu)榘肴樘?。后者作為一種誘導(dǎo)劑分子結(jié)合阻遏蛋白,使蛋白構(gòu)象變化,導(dǎo)致阻遏蛋白與O序列解離、轉(zhuǎn)錄發(fā)生。12/26/202298阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)12/18/202242mRNA阻遏蛋白IDNAZYAOPpol沒有乳糖存在時(shí)阻遏基因與操縱區(qū)結(jié)合,RNA聚合酶則不起作用,不轉(zhuǎn)錄乳糖操縱子:乳糖可作為誘導(dǎo)物,誘導(dǎo)分解利用乳糖的酶的基因轉(zhuǎn)錄12/26/202299mRNA阻遏蛋白IDNAZYAOPpol沒有乳糖存在時(shí)阻遏基mRNA阻遏蛋白有乳糖存在時(shí)IDNAZYAOPpol啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄mRNA乳糖半乳糖β-半乳糖苷酶12/26/2022100mRNA阻遏蛋白有乳糖存在時(shí)IDNAZYAOPpol啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄CAP(分解代謝基因活化蛋白)的正性調(diào)節(jié)
當(dāng)沒有葡萄糖及cAMP濃度較高時(shí),cAMP與CAP結(jié)合,可刺激RNA轉(zhuǎn)錄活性。葡萄糖的分解代謝產(chǎn)物能降低cAMP的濃度,CAP不能被活化形成CAP-cAMP復(fù)合物,則不能轉(zhuǎn)錄。lac阻遏蛋白負(fù)性調(diào)節(jié)與CAP正性調(diào)節(jié)兩種機(jī)制協(xié)調(diào)合作:當(dāng)Lac阻遏蛋白封閉轉(zhuǎn)錄時(shí),CAP對(duì)該系統(tǒng)不能發(fā)揮作用;但是如果沒有CAP存在來(lái)加強(qiáng)轉(zhuǎn)錄活性,即使阻遏蛋白從操縱序列上解聚仍幾無(wú)轉(zhuǎn)錄活性。
lac操縱子強(qiáng)的誘導(dǎo)作用既需要乳糖存在又需缺乏葡萄糖。12/26/2022101CAP(分解代謝基因活化蛋白)的正性調(diào)節(jié)12/18/202阻遏蛋白操縱區(qū)結(jié)構(gòu)基因調(diào)節(jié)基因mRNA酶蛋白阻遏蛋白
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