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第四章微生物遺傳與變異第四章微生物遺傳與變異遺傳:親代與子代相似變異:親代與子代、子代間不同個(gè)體不完全相同遺傳(inheritance)和變異(variation)是生命的最本質(zhì)特性之一遺傳型:表型(表現(xiàn)型):生物的全部遺傳因子及基因具有一定遺傳型的個(gè)體,在特定環(huán)境條件下通過生長(zhǎng)發(fā)育所表現(xiàn)出來(lái)的形態(tài)等生物學(xué)特征的總和。表型是由遺傳型所決定,但也和環(huán)境有關(guān)。遺傳:親代與子代相似變異:親代與子代、子代間不同個(gè)體不完全相表型飾變:表型的差異只與環(huán)境有關(guān)特點(diǎn):暫時(shí)性、不可遺傳性、表現(xiàn)為全部個(gè)體的行為橘生淮南則為橘,生于淮北則為枳。遺傳型變異(基因變異、基因突變):遺傳物質(zhì)改變,導(dǎo)致表型改變特點(diǎn):遺傳性、群體中極少數(shù)個(gè)體的行為(自發(fā)突變頻率通常為10-6-10-9)表型飾變:表型的差異只與環(huán)境有關(guān)橘生淮南則為橘,生于淮北則為第一節(jié)微生物的遺傳一、微生物遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)二、細(xì)胞中DNA的復(fù)制(自學(xué))三、RNA與遺傳表達(dá)四、微生物基因表達(dá)的調(diào)控第一節(jié)微生物的遺傳一、微生物遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)二、細(xì)胞中DN(一)遺傳物質(zhì)DNA的分子結(jié)構(gòu)及多樣性(自學(xué))(一)遺傳物質(zhì)DNA的分子結(jié)構(gòu)及多樣性(自學(xué))(二)遺傳物質(zhì)在微生物中的存在
1.遺傳物質(zhì)在微生物中存在的主要形式生物體內(nèi)的核酸通常都與蛋白質(zhì)結(jié)合形成復(fù)合物,以核蛋白(nucleoprotein)的形式存在。DNA分子十分巨大,與蛋白質(zhì)結(jié)合后被組裝到有限的空間中。(二)遺傳物質(zhì)在微生物中的存在1.遺傳物質(zhì)在微生物中存在的1.遺傳物質(zhì)存在的主要形式——染色體
組蛋白與DNA的結(jié)合核小體1.遺傳物質(zhì)存在的主要形式——染色體
組蛋白與DNA的結(jié)合核3.微生物中染色體外DNA存在的另一形式質(zhì)粒(plasmid):一種獨(dú)立于染色體外,能進(jìn)行自主復(fù)制的細(xì)胞質(zhì)遺傳因子,主要存在于各種微生物細(xì)胞中。轉(zhuǎn)座因子(transposableelement):位于染色體或質(zhì)粒上的一段能改變自身位置的DNA序列,廣泛分布于原核和真核細(xì)胞中。質(zhì)粒和轉(zhuǎn)座因子是細(xì)胞中除染色體以外的另外二類遺傳因子2.真核生物中染色體外的遺傳物質(zhì)——細(xì)胞器DNA3.微生物中染色體外DNA存在的另一形式質(zhì)粒(plasm質(zhì)粒的分子結(jié)構(gòu)通常以共價(jià)閉合環(huán)狀(covalentlyclosedcircle,簡(jiǎn)稱CCC)的超螺旋雙鏈DNA分子存在于細(xì)胞中;也發(fā)現(xiàn)有線型雙鏈DNA質(zhì)粒和RNA質(zhì)粒;質(zhì)粒分子的大小范圍從1kb左右到1000kb;(細(xì)菌質(zhì)粒多在10kb以內(nèi))質(zhì)粒的分子結(jié)構(gòu)通常以共價(jià)閉合環(huán)狀(covalentlycl質(zhì)粒與染色體的差異A大小不同B賴堿性不同C儲(chǔ)存的遺傳信息不同質(zhì)粒的特性
A可轉(zhuǎn)移性
B可整合性C可重組性
D可消除性質(zhì)粒與細(xì)胞器DNA的區(qū)別相同點(diǎn)A自主復(fù)制B消失后,后代細(xì)胞中不再出現(xiàn)C遺傳信息少不同點(diǎn)A質(zhì)粒結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單B質(zhì)粒功能多樣C質(zhì)??赊D(zhuǎn)移質(zhì)粒與染色體的差異質(zhì)粒的特性質(zhì)粒與細(xì)胞器DNA的區(qū)別不同點(diǎn)質(zhì)粒的主要類型質(zhì)粒所編碼的功能和賦予宿主的表型效應(yīng)致育因子(Fertilityfactor,F(xiàn)因子)抗性因子(Resistancefactor,R因子)產(chǎn)細(xì)菌素的質(zhì)粒(Bacteriocinproductionplasmid)毒性質(zhì)粒(virulenceplasmid)代謝質(zhì)粒(Metabolicplasmid)隱秘質(zhì)粒(crypticplasmid)質(zhì)粒的主要類型質(zhì)粒所編碼致育因子(Fertilityfac致育因子(Fertilityfactor,F(xiàn)因子)又稱F質(zhì)粒,其大小約100kb,這是最早發(fā)現(xiàn)的一種與大腸桿菌的有性生殖現(xiàn)象(接合作用)有關(guān)的質(zhì)粒。攜帶F質(zhì)粒的菌株稱為F+菌株(相當(dāng)于雄性),無(wú)F質(zhì)粒的菌株稱為F-菌株(相當(dāng)于雌性)。F因子能以游離狀態(tài)(F+)和以與染色體相結(jié)合的狀態(tài)(Hfr)存在于細(xì)胞中,所以又稱之為附加體(episome)。致育因子(Fertilityfactor,F(xiàn)因子)又稱F質(zhì)抗性因子(Resistancefactor,R因子)包括抗藥性和抗重金屬二大類,簡(jiǎn)稱R質(zhì)粒。R100質(zhì)粒(89kb)可使宿主對(duì)下列藥物及重金屬具有抗性:汞(mercuricion,mer)四環(huán)素(tetracycline,tet)鏈霉素(Streptomycin,Str)、磺胺(Sulfonamide,Su)、氯霉素(Chlorampenicol,Cm)夫西地酸(fusidicacid,fus)并且負(fù)責(zé)這些抗性的基因是成簇地存在于抗性質(zhì)粒上??剐再|(zhì)粒在細(xì)菌間的傳遞是細(xì)菌產(chǎn)生抗藥性的重要原因之一??剐砸蜃樱≧esistancefactor,R因子)包括抗產(chǎn)細(xì)菌素的質(zhì)粒(Bacteriocinproductionplasmid)細(xì)菌素結(jié)構(gòu)基因、涉及細(xì)菌素運(yùn)輸及發(fā)揮作用(processing)的蛋白質(zhì)的基因、賦予宿主對(duì)該細(xì)菌素具有“免疫力”的相關(guān)產(chǎn)物的基因一般都位于質(zhì)粒或轉(zhuǎn)座子上,因此,細(xì)菌素可以殺死同種但不攜帶該質(zhì)粒的菌株。產(chǎn)細(xì)菌素的質(zhì)粒(Bacteriocinproduction代謝質(zhì)粒(Metabolicplasmid)質(zhì)粒上攜帶有有利于微生物生存的基因,如能降解某些基質(zhì)的酶,進(jìn)行共生固氮,或產(chǎn)生抗生素(某些放線菌)等。將復(fù)雜的有機(jī)化合物降解成能被其作為碳源和能源利用的簡(jiǎn)單形式,環(huán)境保護(hù)方面具有重要的意義。假單胞菌:具有降解一些有毒化合物,如芳香簇化合物(苯)、農(nóng)藥(2,4dichlorophenoxyaceticacid)、辛烷和樟腦等的能力。降解質(zhì)粒:代謝質(zhì)粒(Metabolicplasmid)質(zhì)粒上攜帶有有細(xì)胞器核糖體:與胞質(zhì)中的存在明顯差異,并具不同形式。有時(shí)與細(xì)菌核糖體大小相當(dāng)(70%rRNA),有時(shí)僅60S(<30%rRNA)核糖體存在于每個(gè)進(jìn)行蛋白質(zhì)合成的細(xì)胞中。雖然在不同生物內(nèi)其大小有別,但組織結(jié)構(gòu)基本相同,而且執(zhí)行的功能也完全相同。1.rRNA三RNA與遺傳表達(dá)(一)RNA的結(jié)構(gòu)和功能細(xì)胞器核糖體:與胞質(zhì)中的存在明顯差異,并具不同形式
2mRNAEukaryoticmRNAProkaryoticmRNA將DNA上的遺傳信息攜帶到合成蛋白質(zhì)的場(chǎng)所2mRNAEukaryoticmRNAProkaryo3tRNAtRNA折疊為緊湊的L型三級(jí)結(jié)構(gòu)tRNAisanadaptor3tRNAtRNA折疊為緊湊的L型三級(jí)結(jié)構(gòu)tRNAistRNA的分類(1)起始tRNA和延伸tRNA:一類能特異識(shí)別mRNA模板上起始密碼子的tRNA叫起始tRNA;其它tRNA稱為延伸tRNA。(2)同工tRNA:
代表相同氨基酸的tRNA稱同工tRNA。(3)校正tRNA:通過tRNA中反密碼子改變來(lái)校正密碼子突變,使其在突變位點(diǎn)引入正確氨基酸。無(wú)義突變(nonsensemutation):指DNA上任何代表氨基酸的密碼子變?yōu)榻K止密碼子的改變。tRNA的分類(1)起始tRNA和延伸tRNA:
1轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)錄:從DNA到RNA的過程,基因表達(dá)的核心步驟。
翻譯:從RNA到蛋白質(zhì)的過程,基因表達(dá)的最終目的。1轉(zhuǎn)錄
◆信使RNA(messengerRNA,mRNA)
◆轉(zhuǎn)移RNA(transferRNA,tRNA)
◆核糖體RNA(ribosomalRNA,rRNA)
◆其他一些小RNA(smallRNA,sRNA)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物類型◆信使RNA(messengerRNA,mRNA)轉(zhuǎn)起始(Initiation)延伸(Elongation)終止(Termination)轉(zhuǎn)錄分三個(gè)階段進(jìn)行RNApolymerasecatalyzestranscription:起始(Initiation)轉(zhuǎn)錄分三個(gè)階段進(jìn)行RNApo2.翻譯過程1)氨基酸活化2)基本過程3)蛋白質(zhì)合成起始4)蛋白質(zhì)合成延伸5)蛋白質(zhì)合成終止2.翻譯過程1)氨基酸活化5.2.3蛋白質(zhì)合成的三個(gè)階段簡(jiǎn)介Initiation30SsubunitonmRNAbindingsiteisjoinedby50Ssubunitandaminoacyl-tRNAbindsElongationRibosomemovesalongmRNA,extendingproteinbytransferfrompeptidyl-tRNAtoaminoacyl-tRNATerminationPolypeptidechainisreleasedfromtRNA,andribosomedissociatesfrommRNA5.2.3蛋白質(zhì)合成的三個(gè)階段簡(jiǎn)介5.2.3蛋白質(zhì)合成的三個(gè)階段簡(jiǎn)介Initiation3一、微生物的變異與基因突變微生物變異:微生物子代的表型特征與親代的表型特征發(fā)生較大的差異,這種差異是由于子代的基因發(fā)生了突變所引起的穩(wěn)定的可遺傳的變化突變包括:基因突變和染色體畸變第二節(jié)微生物的變異一、微生物的變異與基因突變第二節(jié)微生物的變異二、突變的類型(一)形態(tài)突變型細(xì)胞形態(tài)或菌落形態(tài)的變異(二)生化突變型
1.營(yíng)養(yǎng)缺陷型2.抗性突變型
3.抗原突變型(三)致死突變型(四)條件致死突變型二、突變的類型(一)形態(tài)突變型1營(yíng)養(yǎng)缺陷型(auxotroph)一種缺乏合成其生存所必須的營(yíng)養(yǎng)物(包括氨基酸、維生素、堿基等)的突變型,只有從周圍環(huán)境或培養(yǎng)基中獲得這些營(yíng)養(yǎng)或其前體物(precursor)才能生長(zhǎng)。營(yíng)養(yǎng)缺陷型是微生物遺傳學(xué)研究中重要的選擇標(biāo)記和育種的重要手段表型判斷的標(biāo)準(zhǔn):在基本培養(yǎng)基上能否生長(zhǎng)1營(yíng)養(yǎng)缺陷型(auxotroph)一種缺乏合成其生存所必須1營(yíng)養(yǎng)缺陷型(auxotroph)特點(diǎn):在選擇培養(yǎng)基(一般為基本培養(yǎng)基)上不生長(zhǎng)負(fù)選擇標(biāo)記突變株不能通過選擇平板直接獲得1營(yíng)養(yǎng)缺陷型(auxotroph)特點(diǎn):在選擇培養(yǎng)基(一般1營(yíng)養(yǎng)缺陷型(auxotroph)影印平板(Replicaplating)法是Lederberg夫婦在1952年建立1營(yíng)養(yǎng)缺陷型(auxotroph)影印平板(Replica營(yíng)養(yǎng)缺陷型的表示方法:1營(yíng)養(yǎng)缺陷型(auxotroph)基因型:所需營(yíng)養(yǎng)物的前三個(gè)英文小寫斜體字母表示:hisC(組氨酸缺陷型,其中的大寫字母C同一表型中不同基因的突變)表型:同上,但第一個(gè)字母大寫,且不用斜體:HisC在具體使用時(shí)多用hisC-和hisC+,分別表示缺陷型和野生型。營(yíng)養(yǎng)缺陷型的表示方法:1營(yíng)養(yǎng)缺陷型(auxotroph)基因2抗藥性突變型(resistantmutant)基因突變使菌株對(duì)某種或某幾種藥物,特別是抗生素,產(chǎn)生抗性。特點(diǎn):正選擇標(biāo)記(突變株可直接從抗性平板上獲得-----在加有相應(yīng)抗生素的平板上,只有抗性突變能生長(zhǎng)。所以很容易分離得到。)表示方法:所抗藥物的前三個(gè)小寫斜體英文字母加上“r”表示strr和strs分別表示對(duì)鏈霉素的抗性和敏感性2抗藥性突變型(resistantmutant)基因突變3條件致死突變型(conditionallethalmutant)
在某一條件下具有致死效應(yīng),而在另一條件下沒有致死效應(yīng)的突變型。常用的條件致死突變是溫度敏感突變,用ts(temperaturesensitive)表示,這類突變?cè)诟邷叵拢ㄈ?2℃)是致死的,但可以在低溫(如25-30℃)下得到這種突變。特點(diǎn):負(fù)選擇標(biāo)記這類突變型常被用來(lái)分離生長(zhǎng)繁殖必需的突變基因3條件致死突變型(conditionallethalm4形態(tài)突變型(morphologicalmutant)造成形態(tài)改變的突變型特點(diǎn):非選擇性突變突變株和野生型菌株均可生長(zhǎng),但可從形態(tài)特征上進(jìn)行區(qū)分。舉例:產(chǎn)蛋白酶缺陷突變株的篩選菌落顏色變化β半乳糖苷酶基因的插入失活,使重組子菌落為白色而與蘭色的非重組子分開。細(xì)胞水平上的形態(tài)突變,突變株的檢出更加困難。4形態(tài)突變型(morphologicalmutant)造其它突變類型毒力、生產(chǎn)某種代謝產(chǎn)物的發(fā)酵能力的變化等在實(shí)際應(yīng)用中具有重要意義突變類型一般都不具有很明顯或可直接檢測(cè)到的表型。其突變株的獲得往往需要較大的工作量。其它突變類型毒力、生產(chǎn)某種代謝產(chǎn)物的發(fā)酵能力的一個(gè)基因內(nèi)部遺傳結(jié)構(gòu)或DNA序列的任何改變基因突變:三、基因突變的機(jī)理一個(gè)基因內(nèi)部遺傳結(jié)構(gòu)或DNA序列的任何改變基因突變:三、基因基因突變是重要的生物學(xué)現(xiàn)象,它是一切生物變化的根源,連同基因轉(zhuǎn)移、重組一起提供了推動(dòng)生物進(jìn)化的遺傳多變性?;蛲蛔僁NA損傷修復(fù)機(jī)制突變自發(fā)突變誘變環(huán)境因素的影響,DNA復(fù)制過程的偶然錯(cuò)誤等而導(dǎo)致,一般頻率較低,通常為10-6-10-9。某些物理、化學(xué)因素對(duì)生物體的DNA進(jìn)行直接作用,突變以較高的頻率產(chǎn)生。可以通過DNA復(fù)制而成為真正的突變,也可以重新變?yōu)樵瓉?lái)的結(jié)構(gòu),這取決于修復(fù)作用和其它多種因素。基因突變是重要的生物學(xué)現(xiàn)象,它是一切生物變化的根源,連同基因1)隨機(jī)性2)稀有性3)規(guī)律性4)獨(dú)立性5)遺傳和回復(fù)性6)可誘變性(一)自發(fā)突變1)隨機(jī)性(一)自發(fā)突變(二)誘發(fā)突變誘變劑的作用(1)堿基類似物摻入(2)堿基的化學(xué)修飾(3)染料的嵌入(4)物理因素--紫外線和電離輻射誘發(fā)突變類型(1)堿基置換(2)移碼突變(3)染色體畸變(二)誘發(fā)突變誘變劑的作用
DNA突變的類型
-T-C-G-G-C-T-G-T-A-C-G--A-G-C-C-G-A-C-A-T-G-C-轉(zhuǎn)換
-T-C-G-A-G-C-T-G-T-A-C-G--A-G-C-T-C-G-A-C-A-T-G-C-插入A
-T-C-G-C-T-G-T-A-C-G--A-G-C-G-A-C-A-T-G-C-缺失T野生型基因
-T-C-G-A-C-T-G-T-A-C-G--A-G-C-T-G-A-C-A-T-G-C-
-T-C-G-T-C-T-G-T-A-C-G--A-G-C-A-G-A-C-A-T-G-C-顛換堿基對(duì)的置換(substitution)移碼突變(framesshiftmutation)DNA突變的類型
-T-C-G-G-C-T-G-T-A-
(1)堿基類似物(baseanalog)
如5-溴尿嘧啶(BU)是T堿基的類似物,通常情況下它以酮式結(jié)構(gòu)存在,能與A配對(duì);但它有時(shí)以烯醇式結(jié)構(gòu)存在,與G配對(duì)。
2-氨基嘌呤(AP)是A的類似物,正常狀態(tài)下與T配對(duì),但以罕見的亞氨基狀態(tài)存在時(shí)卻與C配對(duì)。
Adenine
(A)Thymine(T)(1)堿基類似物(baseanalog)Aden(2)堿基修飾劑(basemodifier)
又如亞硝酸能脫去堿基上的氨基??墒笴氧化脫氨變成U;G脫氨后成為黃嘌呤(X),但它仍與C配對(duì);A脫氨后成為次黃嘌呤(I),I與C配對(duì),而不能和原來(lái)的T配對(duì)。Adenine
(A)Guanine(G)Cytosine(C)(2)堿基修飾劑(basemodifier)Adenin(3)嵌入染料(intercalationdye)
一些扁平的稠環(huán)分子,例如吖啶橙(acridine)、原黃素(proflavine)、溴化乙錠(ethidiumbromide,EB)等染料,可以插入到DNA的堿基對(duì)之間,引起新合成鏈堿基的插入或缺失。(3)嵌入染料(intercalationdye)
(4)物理因素--紫外線(ultraviolet)和電離輻射(ionizingradiation)
紫外線的高能量可以使相鄰嘧啶之間雙鍵打開形成二聚體,包括產(chǎn)生環(huán)丁烷結(jié)構(gòu)和6-4光產(chǎn)物。電離輻輻射的作用比較復(fù)雜。(4)物理因素--紫外線(ultraviolet)和電離(一)光復(fù)活作用
對(duì)紫外線引起的DNA損傷進(jìn)行修復(fù)。四、DNA損傷修復(fù)(一)光復(fù)活作用
對(duì)紫外線引起的DNA損傷進(jìn)行修復(fù)。DNA紫外線損傷的光復(fù)合酶修復(fù)1、形成嘧啶二聚體2、光復(fù)合酶結(jié)合于損傷部位3、酶被可見光激活4、修復(fù)后酶被釋放DNA紫外線損傷的光復(fù)合酶修復(fù)1、形成嘧啶二聚體2、光復(fù)合酶(二)切除修復(fù)
(excisionrepair)當(dāng)DNA鏈上相應(yīng)位置的核苷酸發(fā)生損傷,導(dǎo)致雙鏈之間無(wú)法形成氫鍵,在一系列酶的作用下,將DNA分子中受損傷部分切除掉,并以完整的那一條鏈為模板,合成出切去的部分,然后使DNA恢復(fù)正常結(jié)構(gòu)的過程。(二)切除修復(fù)
(excisionrepair)DNA的損傷和切除修復(fù)堿基丟失堿基缺陷或錯(cuò)配結(jié)構(gòu)缺陷切開核酸內(nèi)切酶核酸外切酶切除DNA聚合酶DNA連接酶AP核酸內(nèi)切酶核酸外切酶切開切除修復(fù)連接糖苷酶DNA的損傷和切除修復(fù)堿基丟失堿基缺陷或錯(cuò)配結(jié)構(gòu)缺陷切開核酸(三)重組修復(fù)
(Recombinationrepair)遺傳信息有缺損的子代DNA分子通過遺傳重組的方式加以彌補(bǔ),即從同源DNA的母鏈上將相應(yīng)核苷酸序列片段移至子鏈缺口處,然后用再合成的序列來(lái)補(bǔ)上母鏈的空缺。(三)重組修復(fù)
(RecombinationrepaDNA的重組修復(fù)胸腺嘧啶二聚體復(fù)制核酸酶及重組蛋白修復(fù)復(fù)制DNA聚合酶DNA連接酶重組DNA的重組修復(fù)胸腺嘧啶二聚體復(fù)制核酸酶及重組蛋白修復(fù)復(fù)制D(四)SOS反應(yīng)誘導(dǎo)的修復(fù)
SOSresponse&DNArepairSOS反應(yīng):是細(xì)胞DNA受到損傷或復(fù)制系統(tǒng)受到抑制的緊急情況下,為求得生存而出現(xiàn)的應(yīng)急效應(yīng)。SOS反應(yīng)誘導(dǎo)的修復(fù)系統(tǒng)包括避免差錯(cuò)修復(fù)(errorfreerepair)和易產(chǎn)生差錯(cuò)修復(fù)(error-pronerepair)(四)SOS反應(yīng)誘導(dǎo)的修復(fù)
SOSresponse第三節(jié)微生物基因重組細(xì)菌的三種水平基因轉(zhuǎn)移形式接合轉(zhuǎn)導(dǎo)自然轉(zhuǎn)化一、原核微生物基因重組第三節(jié)微生物基因重組細(xì)菌的三種水平基因轉(zhuǎn)移形式接合轉(zhuǎn)導(dǎo)自然一、細(xì)菌的接合作用(conjugation)通過細(xì)胞與細(xì)胞的直接接觸而產(chǎn)生的遺傳信息的轉(zhuǎn)移和重組過程一、細(xì)菌的接合作用(conjugation)通過細(xì)胞與細(xì)胞的2.機(jī)制(大腸桿菌的接合機(jī)制)接合作用是由一種被稱為F因子的質(zhì)粒介導(dǎo)F因子的分子量通常為5×107,上面有編碼細(xì)菌產(chǎn)生性菌毛(sexpili)及控制接合過程進(jìn)行的20多個(gè)基因。含有F因子的細(xì)胞:“雄性”菌株(F+),其細(xì)胞表面有性菌毛
不含F(xiàn)因子的細(xì)胞:“雌性”菌株(F-),細(xì)胞表面沒有性菌毛2.機(jī)制(大腸桿菌的接合機(jī)制)接合作用是由一種被稱為F因子F因子為附加體質(zhì)粒既可以脫離染色體在細(xì)胞內(nèi)獨(dú)立存在,也可插入(整合)到染色體上F因子為附加體質(zhì)粒(二)細(xì)菌的轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction)由噬菌體介導(dǎo)的細(xì)菌細(xì)胞間進(jìn)行遺傳交換的一種方式:一個(gè)細(xì)胞的DNA通過病毒載體的感染轉(zhuǎn)移到另一個(gè)細(xì)胞中能將一個(gè)細(xì)菌宿主的部分染色體或質(zhì)粒DNA帶到另一個(gè)細(xì)菌的噬菌體稱為轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體細(xì)菌轉(zhuǎn)導(dǎo)的二種類型:普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)(二)細(xì)菌的轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction)由噬菌體介導(dǎo)的1、普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)(generalizedtransduction)噬菌體可以轉(zhuǎn)導(dǎo)給體染色體的任何部分到受體細(xì)胞中的轉(zhuǎn)導(dǎo)過程(1)意外的發(fā)現(xiàn)1951年,JoshuaLederberg和NortonZinder為了證實(shí)大腸桿菌以外的其它菌種是否也存在接合作用,用二株具不同的多重營(yíng)養(yǎng)缺陷型的鼠傷寒沙門氏菌進(jìn)行類似的實(shí)驗(yàn):用“U”型管進(jìn)行同樣的實(shí)驗(yàn)時(shí),在給體和受體細(xì)胞不接觸的情況下,同樣出現(xiàn)原養(yǎng)型細(xì)菌!1、普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)(generalizedtransducti形成轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的噬菌體可以是溫和的也可以是烈性的,但必須具有能偶爾識(shí)別宿主DNA的包裝機(jī)制并在宿主基因組完全降解以前進(jìn)行包裝。普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)的基本要求:形成轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的噬菌體可以是溫和的也可以是烈性的,普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)的三種后果:進(jìn)入受體的外源DNA通過與細(xì)胞染色體的重組交換而形成穩(wěn)定的轉(zhuǎn)導(dǎo)子流產(chǎn)轉(zhuǎn)導(dǎo)(abortivetransduction)轉(zhuǎn)導(dǎo)DNA不能進(jìn)行重組和復(fù)制,但其攜帶的基因可經(jīng)過轉(zhuǎn)錄而得到表達(dá)。外源DNA被降解,轉(zhuǎn)導(dǎo)失敗。DNA不能復(fù)制,因此群體中僅一個(gè)細(xì)胞含有DNA,而其它細(xì)胞只能得到其基因產(chǎn)物,形成微小菌落。普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)的三種后果:進(jìn)入受體的外源DNA通過與細(xì)胞染色體流2、局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)(specializedtransduction)溫和噬菌體感染整合到細(xì)菌染色體的特定位點(diǎn)上宿主細(xì)胞發(fā)生溶源化溶源菌因誘導(dǎo)而發(fā)生裂解時(shí),在前噬菌體二側(cè)的少數(shù)宿主基因因偶爾發(fā)生的不正常切割而連在噬菌體DNA上部分缺陷的溫和噬菌體把供體菌的少數(shù)特定基因轉(zhuǎn)移到受體菌中2、局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)(specializedtransducti2、局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)(specializedtransduction)溫和噬菌體λ裂解時(shí)的不正常切割:包含gal或bio基因(幾率一般僅有10-6)缺陷噬菌體在宿主細(xì)胞內(nèi)能夠象正常的λDNA分子一樣進(jìn)行復(fù)制、包裝,提供所需要的裂解功能,形成轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒。但沒有正常噬菌體的溶源性和增殖能力,感染受體細(xì)胞后,通過DNA整合進(jìn)宿主染色體而形成穩(wěn)定的轉(zhuǎn)導(dǎo)子。2、局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)(specializedtransducti局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)與普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)的主要區(qū)別:a)被轉(zhuǎn)導(dǎo)的基因共價(jià)地與噬菌體DNA連接,與噬菌體DNA一起進(jìn)行復(fù)制、包裝以及被導(dǎo)入受體細(xì)胞中。而普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)包裝的可能全部是宿主菌的基因。b)局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒攜帶特定的染色體片段并將固定的個(gè)別基因?qū)胧荏w,故稱為局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)。而普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)攜帶的宿主基因具有隨機(jī)性。2、局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)(specializedtransduction)(參見P219)局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)與普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)的主要區(qū)別:a)被轉(zhuǎn)導(dǎo)的基因共價(jià)地與噬(三)細(xì)菌的遺傳轉(zhuǎn)化(genetictransformation)定義:同源或異源的游離DNA分子(質(zhì)粒和染色體DNA)被自然或人工感受態(tài)細(xì)胞攝取,并得到表達(dá)的水平方向的基因轉(zhuǎn)移過程自然遺傳轉(zhuǎn)化(naturalgenetictransformation)人工轉(zhuǎn)化(artificialtransformation)感受態(tài)細(xì)胞:具有攝取外源DNA能力的細(xì)胞(competentcell)(三)細(xì)菌的遺傳轉(zhuǎn)化(genetictransformat自然轉(zhuǎn)化過程的特點(diǎn):a)對(duì)核酸酶敏感;c)轉(zhuǎn)化是否成功及轉(zhuǎn)化效率的高低主要取決于轉(zhuǎn)化(DNA)
給體菌株和轉(zhuǎn)化受體菌株之間的親源關(guān)系;d)通常情況下質(zhì)粒的自然轉(zhuǎn)化效率要低得多;提高質(zhì)粒的自然轉(zhuǎn)化效率的二種方法:1)使質(zhì)粒形成多聚體,這樣進(jìn)入細(xì)胞后重新組合成有活性的質(zhì)粒的幾率大大提高;2)在質(zhì)粒上插入受體菌染色體的部分片段,或?qū)①|(zhì)粒轉(zhuǎn)化進(jìn)含有與該質(zhì)粒具有同源區(qū)段的質(zhì)粒的受體菌-------重組獲救b)不需要活的DNA給體細(xì)胞;自然轉(zhuǎn)化過程的特點(diǎn):a)對(duì)核酸酶敏感;c)轉(zhuǎn)化是否成功及轉(zhuǎn)化第四節(jié)人工構(gòu)建新菌株遺傳工程是70年代初發(fā)展起來(lái)的生物技術(shù)。定義:對(duì)遺傳物質(zhì)進(jìn)行改造(人工干預(yù)下的雜交、轉(zhuǎn)化、接合、轉(zhuǎn)導(dǎo))的技術(shù)。工程:類似工程設(shè)計(jì)那樣有很高的預(yù)見性、精確性與嚴(yán)密性。第四節(jié)人工構(gòu)建新菌株遺傳工程是70年代初發(fā)展起來(lái)的生物技術(shù)遺傳工程方法包括兩個(gè)水平的研究:一種是細(xì)胞水平;另一種是基因水平。所以,又可把它分為細(xì)胞工程和基因工程。細(xì)胞工程——兩個(gè)細(xì)胞原生質(zhì)體融合體外切割導(dǎo)入遺傳物質(zhì)基因片段受體細(xì)胞基因工程——兩個(gè)細(xì)胞DNA片段剪接拼接狹義的講,遺傳工程就是基因工程。原理:限制性核酸內(nèi)切酶遺傳工程方法包括兩個(gè)水平的研究:一種是細(xì)胞水平;另一種是基因一、育變育種育變育種:利用物理、化學(xué)或生物學(xué)方法處理均勻而分散的微生物細(xì)胞,使遺傳物質(zhì)發(fā)生變異,采用簡(jiǎn)便、快速和高效的篩選方法,從中篩選目的突變株。誘變方法:物理、化學(xué)、生物試劑誘變步驟:純化、誘變、篩選、鑒定注意問題:出發(fā)株的選擇,誘導(dǎo)方法的采用,劑量的控制,變異株的篩選。一、育變育種育變育種:利用物理、化學(xué)或生物學(xué)方法處理均勻而分二、原生質(zhì)體的融合原生質(zhì)體的融合:通過人為的方法,使遺傳性狀不同的兩個(gè)個(gè)體細(xì)胞的原生質(zhì)體發(fā)生融合,產(chǎn)生重組細(xì)胞的過程原生質(zhì)體的制備原生質(zhì)體的融合融合細(xì)胞的篩選二、原生質(zhì)體的融合原生質(zhì)體的融合:通過人為的方法,使遺傳性狀在特殊培養(yǎng)基上(如含有青霉素)篩選目的細(xì)菌質(zhì)粒載體(具有抗性基因)如抵抗青霉素長(zhǎng)出必然是重組成功的細(xì)菌外源基因片段在特殊培養(yǎng)基上(如含有青霉素)篩選目的細(xì)菌質(zhì)粒載體(具有抗性Ⅰ.降解石油的工程細(xì)菌
70年代美國(guó)生物學(xué)家查克巴蒂(Chakrabarty)查氏將能降解脂(含質(zhì)粒A)的一種假單胞菌作受體細(xì)菌,分別將能降解芳烴(質(zhì)粒B)、芳烴(質(zhì)粒C)和多環(huán)芳烴(質(zhì)粒D)的質(zhì)粒,用遺傳工程方法人工轉(zhuǎn)入受體細(xì)菌,獲得多質(zhì)?!俺?jí)細(xì)菌”,可除去原油中2/3的烴。浮油在一般條件下降解需一年以上時(shí)間,用“超級(jí)細(xì)菌”只需幾小時(shí)即可把浮油去除,速度快效率高。Ⅰ.降解石油的工程細(xì)菌Ⅱ.耐汞工程菌
日本水俁事件及瑞典鳥類汞中毒事件后,日本和瑞典對(duì)汞在自然界轉(zhuǎn)化做了大量研究工作,提出了汞化合物轉(zhuǎn)化的途徑,主要是某些微生物使水體汞元素甲基化形成甲基汞,使人及生物中毒。另一面自然界中存在一些耐汞的微生物,它們的耐汞基因在質(zhì)粒R因子上。例如,惡臭假單胞菌一般在超過2ug/ml汞濃度中即將中毒死,查克拉巴蒂用質(zhì)粒轉(zhuǎn)移技術(shù),把嗜油假單胞菌的耐汞質(zhì)粒(MER質(zhì)粒)轉(zhuǎn)移到惡臭假單胞菌中去,后者獲得MER質(zhì)粒,可在50~70ug/ml氯化汞中生長(zhǎng)。Ⅱ.耐汞工程菌思考題什么是微生物的遺傳和變異?遺傳變異的物質(zhì)基礎(chǔ)是什么?如何得以證明?微生物的遺傳信息如何傳遞?微生物變異的實(shí)質(zhì)是什么?微生物變異的類型有幾種?變異表現(xiàn)在那些方面?DNA損傷修復(fù)有幾種形式?各自如何修復(fù)?什么是轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)導(dǎo)和接合轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)導(dǎo)有哪幾種方式?分別是如何實(shí)現(xiàn)的?微生物重組過程中,遺傳物質(zhì)是如何轉(zhuǎn)移的?有何應(yīng)用價(jià)值?什么是質(zhì)粒?根據(jù)其功能可分為哪幾種類型?思考題什么是微生物的遺傳和變異?遺傳變異的物質(zhì)基礎(chǔ)是什么?如第四章微生物遺傳與變異第四章微生物遺傳與變異遺傳:親代與子代相似變異:親代與子代、子代間不同個(gè)體不完全相同遺傳(inheritance)和變異(variation)是生命的最本質(zhì)特性之一遺傳型:表型(表現(xiàn)型):生物的全部遺傳因子及基因具有一定遺傳型的個(gè)體,在特定環(huán)境條件下通過生長(zhǎng)發(fā)育所表現(xiàn)出來(lái)的形態(tài)等生物學(xué)特征的總和。表型是由遺傳型所決定,但也和環(huán)境有關(guān)。遺傳:親代與子代相似變異:親代與子代、子代間不同個(gè)體不完全相表型飾變:表型的差異只與環(huán)境有關(guān)特點(diǎn):暫時(shí)性、不可遺傳性、表現(xiàn)為全部個(gè)體的行為橘生淮南則為橘,生于淮北則為枳。遺傳型變異(基因變異、基因突變):遺傳物質(zhì)改變,導(dǎo)致表型改變特點(diǎn):遺傳性、群體中極少數(shù)個(gè)體的行為(自發(fā)突變頻率通常為10-6-10-9)表型飾變:表型的差異只與環(huán)境有關(guān)橘生淮南則為橘,生于淮北則為第一節(jié)微生物的遺傳一、微生物遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)二、細(xì)胞中DNA的復(fù)制(自學(xué))三、RNA與遺傳表達(dá)四、微生物基因表達(dá)的調(diào)控第一節(jié)微生物的遺傳一、微生物遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)二、細(xì)胞中DN(一)遺傳物質(zhì)DNA的分子結(jié)構(gòu)及多樣性(自學(xué))(一)遺傳物質(zhì)DNA的分子結(jié)構(gòu)及多樣性(自學(xué))(二)遺傳物質(zhì)在微生物中的存在
1.遺傳物質(zhì)在微生物中存在的主要形式生物體內(nèi)的核酸通常都與蛋白質(zhì)結(jié)合形成復(fù)合物,以核蛋白(nucleoprotein)的形式存在。DNA分子十分巨大,與蛋白質(zhì)結(jié)合后被組裝到有限的空間中。(二)遺傳物質(zhì)在微生物中的存在1.遺傳物質(zhì)在微生物中存在的1.遺傳物質(zhì)存在的主要形式——染色體
組蛋白與DNA的結(jié)合核小體1.遺傳物質(zhì)存在的主要形式——染色體
組蛋白與DNA的結(jié)合核3.微生物中染色體外DNA存在的另一形式質(zhì)粒(plasmid):一種獨(dú)立于染色體外,能進(jìn)行自主復(fù)制的細(xì)胞質(zhì)遺傳因子,主要存在于各種微生物細(xì)胞中。轉(zhuǎn)座因子(transposableelement):位于染色體或質(zhì)粒上的一段能改變自身位置的DNA序列,廣泛分布于原核和真核細(xì)胞中。質(zhì)粒和轉(zhuǎn)座因子是細(xì)胞中除染色體以外的另外二類遺傳因子2.真核生物中染色體外的遺傳物質(zhì)——細(xì)胞器DNA3.微生物中染色體外DNA存在的另一形式質(zhì)粒(plasm質(zhì)粒的分子結(jié)構(gòu)通常以共價(jià)閉合環(huán)狀(covalentlyclosedcircle,簡(jiǎn)稱CCC)的超螺旋雙鏈DNA分子存在于細(xì)胞中;也發(fā)現(xiàn)有線型雙鏈DNA質(zhì)粒和RNA質(zhì)粒;質(zhì)粒分子的大小范圍從1kb左右到1000kb;(細(xì)菌質(zhì)粒多在10kb以內(nèi))質(zhì)粒的分子結(jié)構(gòu)通常以共價(jià)閉合環(huán)狀(covalentlycl質(zhì)粒與染色體的差異A大小不同B賴堿性不同C儲(chǔ)存的遺傳信息不同質(zhì)粒的特性
A可轉(zhuǎn)移性
B可整合性C可重組性
D可消除性質(zhì)粒與細(xì)胞器DNA的區(qū)別相同點(diǎn)A自主復(fù)制B消失后,后代細(xì)胞中不再出現(xiàn)C遺傳信息少不同點(diǎn)A質(zhì)粒結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單B質(zhì)粒功能多樣C質(zhì)粒可轉(zhuǎn)移質(zhì)粒與染色體的差異質(zhì)粒的特性質(zhì)粒與細(xì)胞器DNA的區(qū)別不同點(diǎn)質(zhì)粒的主要類型質(zhì)粒所編碼的功能和賦予宿主的表型效應(yīng)致育因子(Fertilityfactor,F(xiàn)因子)抗性因子(Resistancefactor,R因子)產(chǎn)細(xì)菌素的質(zhì)粒(Bacteriocinproductionplasmid)毒性質(zhì)粒(virulenceplasmid)代謝質(zhì)粒(Metabolicplasmid)隱秘質(zhì)粒(crypticplasmid)質(zhì)粒的主要類型質(zhì)粒所編碼致育因子(Fertilityfac致育因子(Fertilityfactor,F(xiàn)因子)又稱F質(zhì)粒,其大小約100kb,這是最早發(fā)現(xiàn)的一種與大腸桿菌的有性生殖現(xiàn)象(接合作用)有關(guān)的質(zhì)粒。攜帶F質(zhì)粒的菌株稱為F+菌株(相當(dāng)于雄性),無(wú)F質(zhì)粒的菌株稱為F-菌株(相當(dāng)于雌性)。F因子能以游離狀態(tài)(F+)和以與染色體相結(jié)合的狀態(tài)(Hfr)存在于細(xì)胞中,所以又稱之為附加體(episome)。致育因子(Fertilityfactor,F(xiàn)因子)又稱F質(zhì)抗性因子(Resistancefactor,R因子)包括抗藥性和抗重金屬二大類,簡(jiǎn)稱R質(zhì)粒。R100質(zhì)粒(89kb)可使宿主對(duì)下列藥物及重金屬具有抗性:汞(mercuricion,mer)四環(huán)素(tetracycline,tet)鏈霉素(Streptomycin,Str)、磺胺(Sulfonamide,Su)、氯霉素(Chlorampenicol,Cm)夫西地酸(fusidicacid,fus)并且負(fù)責(zé)這些抗性的基因是成簇地存在于抗性質(zhì)粒上。抗性質(zhì)粒在細(xì)菌間的傳遞是細(xì)菌產(chǎn)生抗藥性的重要原因之一??剐砸蜃樱≧esistancefactor,R因子)包括抗產(chǎn)細(xì)菌素的質(zhì)粒(Bacteriocinproductionplasmid)細(xì)菌素結(jié)構(gòu)基因、涉及細(xì)菌素運(yùn)輸及發(fā)揮作用(processing)的蛋白質(zhì)的基因、賦予宿主對(duì)該細(xì)菌素具有“免疫力”的相關(guān)產(chǎn)物的基因一般都位于質(zhì)?;蜣D(zhuǎn)座子上,因此,細(xì)菌素可以殺死同種但不攜帶該質(zhì)粒的菌株。產(chǎn)細(xì)菌素的質(zhì)粒(Bacteriocinproduction代謝質(zhì)粒(Metabolicplasmid)質(zhì)粒上攜帶有有利于微生物生存的基因,如能降解某些基質(zhì)的酶,進(jìn)行共生固氮,或產(chǎn)生抗生素(某些放線菌)等。將復(fù)雜的有機(jī)化合物降解成能被其作為碳源和能源利用的簡(jiǎn)單形式,環(huán)境保護(hù)方面具有重要的意義。假單胞菌:具有降解一些有毒化合物,如芳香簇化合物(苯)、農(nóng)藥(2,4dichlorophenoxyaceticacid)、辛烷和樟腦等的能力。降解質(zhì)粒:代謝質(zhì)粒(Metabolicplasmid)質(zhì)粒上攜帶有有細(xì)胞器核糖體:與胞質(zhì)中的存在明顯差異,并具不同形式。有時(shí)與細(xì)菌核糖體大小相當(dāng)(70%rRNA),有時(shí)僅60S(<30%rRNA)核糖體存在于每個(gè)進(jìn)行蛋白質(zhì)合成的細(xì)胞中。雖然在不同生物內(nèi)其大小有別,但組織結(jié)構(gòu)基本相同,而且執(zhí)行的功能也完全相同。1.rRNA三RNA與遺傳表達(dá)(一)RNA的結(jié)構(gòu)和功能細(xì)胞器核糖體:與胞質(zhì)中的存在明顯差異,并具不同形式
2mRNAEukaryoticmRNAProkaryoticmRNA將DNA上的遺傳信息攜帶到合成蛋白質(zhì)的場(chǎng)所2mRNAEukaryoticmRNAProkaryo3tRNAtRNA折疊為緊湊的L型三級(jí)結(jié)構(gòu)tRNAisanadaptor3tRNAtRNA折疊為緊湊的L型三級(jí)結(jié)構(gòu)tRNAistRNA的分類(1)起始tRNA和延伸tRNA:一類能特異識(shí)別mRNA模板上起始密碼子的tRNA叫起始tRNA;其它tRNA稱為延伸tRNA。(2)同工tRNA:
代表相同氨基酸的tRNA稱同工tRNA。(3)校正tRNA:通過tRNA中反密碼子改變來(lái)校正密碼子突變,使其在突變位點(diǎn)引入正確氨基酸。無(wú)義突變(nonsensemutation):指DNA上任何代表氨基酸的密碼子變?yōu)榻K止密碼子的改變。tRNA的分類(1)起始tRNA和延伸tRNA:
1轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)錄:從DNA到RNA的過程,基因表達(dá)的核心步驟。
翻譯:從RNA到蛋白質(zhì)的過程,基因表達(dá)的最終目的。1轉(zhuǎn)錄
◆信使RNA(messengerRNA,mRNA)
◆轉(zhuǎn)移RNA(transferRNA,tRNA)
◆核糖體RNA(ribosomalRNA,rRNA)
◆其他一些小RNA(smallRNA,sRNA)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物類型◆信使RNA(messengerRNA,mRNA)轉(zhuǎn)起始(Initiation)延伸(Elongation)終止(Termination)轉(zhuǎn)錄分三個(gè)階段進(jìn)行RNApolymerasecatalyzestranscription:起始(Initiation)轉(zhuǎn)錄分三個(gè)階段進(jìn)行RNApo2.翻譯過程1)氨基酸活化2)基本過程3)蛋白質(zhì)合成起始4)蛋白質(zhì)合成延伸5)蛋白質(zhì)合成終止2.翻譯過程1)氨基酸活化5.2.3蛋白質(zhì)合成的三個(gè)階段簡(jiǎn)介Initiation30SsubunitonmRNAbindingsiteisjoinedby50Ssubunitandaminoacyl-tRNAbindsElongationRibosomemovesalongmRNA,extendingproteinbytransferfrompeptidyl-tRNAtoaminoacyl-tRNATerminationPolypeptidechainisreleasedfromtRNA,andribosomedissociatesfrommRNA5.2.3蛋白質(zhì)合成的三個(gè)階段簡(jiǎn)介5.2.3蛋白質(zhì)合成的三個(gè)階段簡(jiǎn)介Initiation3一、微生物的變異與基因突變微生物變異:微生物子代的表型特征與親代的表型特征發(fā)生較大的差異,這種差異是由于子代的基因發(fā)生了突變所引起的穩(wěn)定的可遺傳的變化突變包括:基因突變和染色體畸變第二節(jié)微生物的變異一、微生物的變異與基因突變第二節(jié)微生物的變異二、突變的類型(一)形態(tài)突變型細(xì)胞形態(tài)或菌落形態(tài)的變異(二)生化突變型
1.營(yíng)養(yǎng)缺陷型2.抗性突變型
3.抗原突變型(三)致死突變型(四)條件致死突變型二、突變的類型(一)形態(tài)突變型1營(yíng)養(yǎng)缺陷型(auxotroph)一種缺乏合成其生存所必須的營(yíng)養(yǎng)物(包括氨基酸、維生素、堿基等)的突變型,只有從周圍環(huán)境或培養(yǎng)基中獲得這些營(yíng)養(yǎng)或其前體物(precursor)才能生長(zhǎng)。營(yíng)養(yǎng)缺陷型是微生物遺傳學(xué)研究中重要的選擇標(biāo)記和育種的重要手段表型判斷的標(biāo)準(zhǔn):在基本培養(yǎng)基上能否生長(zhǎng)1營(yíng)養(yǎng)缺陷型(auxotroph)一種缺乏合成其生存所必須1營(yíng)養(yǎng)缺陷型(auxotroph)特點(diǎn):在選擇培養(yǎng)基(一般為基本培養(yǎng)基)上不生長(zhǎng)負(fù)選擇標(biāo)記突變株不能通過選擇平板直接獲得1營(yíng)養(yǎng)缺陷型(auxotroph)特點(diǎn):在選擇培養(yǎng)基(一般1營(yíng)養(yǎng)缺陷型(auxotroph)影印平板(Replicaplating)法是Lederberg夫婦在1952年建立1營(yíng)養(yǎng)缺陷型(auxotroph)影印平板(Replica營(yíng)養(yǎng)缺陷型的表示方法:1營(yíng)養(yǎng)缺陷型(auxotroph)基因型:所需營(yíng)養(yǎng)物的前三個(gè)英文小寫斜體字母表示:hisC(組氨酸缺陷型,其中的大寫字母C同一表型中不同基因的突變)表型:同上,但第一個(gè)字母大寫,且不用斜體:HisC在具體使用時(shí)多用hisC-和hisC+,分別表示缺陷型和野生型。營(yíng)養(yǎng)缺陷型的表示方法:1營(yíng)養(yǎng)缺陷型(auxotroph)基因2抗藥性突變型(resistantmutant)基因突變使菌株對(duì)某種或某幾種藥物,特別是抗生素,產(chǎn)生抗性。特點(diǎn):正選擇標(biāo)記(突變株可直接從抗性平板上獲得-----在加有相應(yīng)抗生素的平板上,只有抗性突變能生長(zhǎng)。所以很容易分離得到。)表示方法:所抗藥物的前三個(gè)小寫斜體英文字母加上“r”表示strr和strs分別表示對(duì)鏈霉素的抗性和敏感性2抗藥性突變型(resistantmutant)基因突變3條件致死突變型(conditionallethalmutant)
在某一條件下具有致死效應(yīng),而在另一條件下沒有致死效應(yīng)的突變型。常用的條件致死突變是溫度敏感突變,用ts(temperaturesensitive)表示,這類突變?cè)诟邷叵拢ㄈ?2℃)是致死的,但可以在低溫(如25-30℃)下得到這種突變。特點(diǎn):負(fù)選擇標(biāo)記這類突變型常被用來(lái)分離生長(zhǎng)繁殖必需的突變基因3條件致死突變型(conditionallethalm4形態(tài)突變型(morphologicalmutant)造成形態(tài)改變的突變型特點(diǎn):非選擇性突變突變株和野生型菌株均可生長(zhǎng),但可從形態(tài)特征上進(jìn)行區(qū)分。舉例:產(chǎn)蛋白酶缺陷突變株的篩選菌落顏色變化β半乳糖苷酶基因的插入失活,使重組子菌落為白色而與蘭色的非重組子分開。細(xì)胞水平上的形態(tài)突變,突變株的檢出更加困難。4形態(tài)突變型(morphologicalmutant)造其它突變類型毒力、生產(chǎn)某種代謝產(chǎn)物的發(fā)酵能力的變化等在實(shí)際應(yīng)用中具有重要意義突變類型一般都不具有很明顯或可直接檢測(cè)到的表型。其突變株的獲得往往需要較大的工作量。其它突變類型毒力、生產(chǎn)某種代謝產(chǎn)物的發(fā)酵能力的一個(gè)基因內(nèi)部遺傳結(jié)構(gòu)或DNA序列的任何改變基因突變:三、基因突變的機(jī)理一個(gè)基因內(nèi)部遺傳結(jié)構(gòu)或DNA序列的任何改變基因突變:三、基因基因突變是重要的生物學(xué)現(xiàn)象,它是一切生物變化的根源,連同基因轉(zhuǎn)移、重組一起提供了推動(dòng)生物進(jìn)化的遺傳多變性?;蛲蛔僁NA損傷修復(fù)機(jī)制突變自發(fā)突變誘變環(huán)境因素的影響,DNA復(fù)制過程的偶然錯(cuò)誤等而導(dǎo)致,一般頻率較低,通常為10-6-10-9。某些物理、化學(xué)因素對(duì)生物體的DNA進(jìn)行直接作用,突變以較高的頻率產(chǎn)生??梢酝ㄟ^DNA復(fù)制而成為真正的突變,也可以重新變?yōu)樵瓉?lái)的結(jié)構(gòu),這取決于修復(fù)作用和其它多種因素?;蛲蛔兪侵匾纳飳W(xué)現(xiàn)象,它是一切生物變化的根源,連同基因1)隨機(jī)性2)稀有性3)規(guī)律性4)獨(dú)立性5)遺傳和回復(fù)性6)可誘變性(一)自發(fā)突變1)隨機(jī)性(一)自發(fā)突變(二)誘發(fā)突變誘變劑的作用(1)堿基類似物摻入(2)堿基的化學(xué)修飾(3)染料的嵌入(4)物理因素--紫外線和電離輻射誘發(fā)突變類型(1)堿基置換(2)移碼突變(3)染色體畸變(二)誘發(fā)突變誘變劑的作用
DNA突變的類型
-T-C-G-G-C-T-G-T-A-C-G--A-G-C-C-G-A-C-A-T-G-C-轉(zhuǎn)換
-T-C-G-A-G-C-T-G-T-A-C-G--A-G-C-T-C-G-A-C-A-T-G-C-插入A
-T-C-G-C-T-G-T-A-C-G--A-G-C-G-A-C-A-T-G-C-缺失T野生型基因
-T-C-G-A-C-T-G-T-A-C-G--A-G-C-T-G-A-C-A-T-G-C-
-T-C-G-T-C-T-G-T-A-C-G--A-G-C-A-G-A-C-A-T-G-C-顛換堿基對(duì)的置換(substitution)移碼突變(framesshiftmutation)DNA突變的類型
-T-C-G-G-C-T-G-T-A-
(1)堿基類似物(baseanalog)
如5-溴尿嘧啶(BU)是T堿基的類似物,通常情況下它以酮式結(jié)構(gòu)存在,能與A配對(duì);但它有時(shí)以烯醇式結(jié)構(gòu)存在,與G配對(duì)。
2-氨基嘌呤(AP)是A的類似物,正常狀態(tài)下與T配對(duì),但以罕見的亞氨基狀態(tài)存在時(shí)卻與C配對(duì)。
Adenine
(A)Thymine(T)(1)堿基類似物(baseanalog)Aden(2)堿基修飾劑(basemodifier)
又如亞硝酸能脫去堿基上的氨基??墒笴氧化脫氨變成U;G脫氨后成為黃嘌呤(X),但它仍與C配對(duì);A脫氨后成為次黃嘌呤(I),I與C配對(duì),而不能和原來(lái)的T配對(duì)。Adenine
(A)Guanine(G)Cytosine(C)(2)堿基修飾劑(basemodifier)Adenin(3)嵌入染料(intercalationdye)
一些扁平的稠環(huán)分子,例如吖啶橙(acridine)、原黃素(proflavine)、溴化乙錠(ethidiumbromide,EB)等染料,可以插入到DNA的堿基對(duì)之間,引起新合成鏈堿基的插入或缺失。(3)嵌入染料(intercalationdye)
(4)物理因素--紫外線(ultraviolet)和電離輻射(ionizingradiation)
紫外線的高能量可以使相鄰嘧啶之間雙鍵打開形成二聚體,包括產(chǎn)生環(huán)丁烷結(jié)構(gòu)和6-4光產(chǎn)物。電離輻輻射的作用比較復(fù)雜。(4)物理因素--紫外線(ultraviolet)和電離(一)光復(fù)活作用
對(duì)紫外線引起的DNA損傷進(jìn)行修復(fù)。四、DNA損傷修復(fù)(一)光復(fù)活作用
對(duì)紫外線引起的DNA損傷進(jìn)行修復(fù)。DNA紫外線損傷的光復(fù)合酶修復(fù)1、形成嘧啶二聚體2、光復(fù)合酶結(jié)合于損傷部位3、酶被可見光激活4、修復(fù)后酶被釋放DNA紫外線損傷的光復(fù)合酶修復(fù)1、形成嘧啶二聚體2、光復(fù)合酶(二)切除修復(fù)
(excisionrepair)當(dāng)DNA鏈上相應(yīng)位置的核苷酸發(fā)生損傷,導(dǎo)致雙鏈之間無(wú)法形成氫鍵,在一系列酶的作用下,將DNA分子中受損傷部分切除掉,并以完整的那一條鏈為模板,合成出切去的部分,然后使DNA恢復(fù)正常結(jié)構(gòu)的過程。(二)切除修復(fù)
(excisionrepair)DNA的損傷和切除修復(fù)堿基丟失堿基缺陷或錯(cuò)配結(jié)構(gòu)缺陷切開核酸內(nèi)切酶核酸外切酶切除DNA聚合酶DNA連接酶AP核酸內(nèi)切酶核酸外切酶切開切除修復(fù)連接糖苷酶DNA的損傷和切除修復(fù)堿基丟失堿基缺陷或錯(cuò)配結(jié)構(gòu)缺陷切開核酸(三)重組修復(fù)
(Recombinationrepair)遺傳信息有缺損的子代DNA分子通過遺傳重組的方式加以彌補(bǔ),即從同源DNA的母鏈上將相應(yīng)核苷酸序列片段移至子鏈缺口處,然后用再合成的序列來(lái)補(bǔ)上母鏈的空缺。(三)重組修復(fù)
(RecombinationrepaDNA的重組修復(fù)胸腺嘧啶二聚體復(fù)制核酸酶及重組蛋白修復(fù)復(fù)制DNA聚合酶DNA連接酶重組DNA的重組修復(fù)胸腺嘧啶二聚體復(fù)制核酸酶及重組蛋白修復(fù)復(fù)制D(四)SOS反應(yīng)誘導(dǎo)的修復(fù)
SOSresponse&DNArepairSOS反應(yīng):是細(xì)胞DNA受到損傷或復(fù)制系統(tǒng)受到抑制的緊急情況下,為求得生存而出現(xiàn)的應(yīng)急效應(yīng)。SOS反應(yīng)誘導(dǎo)的修復(fù)系統(tǒng)包括避免差錯(cuò)修復(fù)(errorfreerepair)和易產(chǎn)生差錯(cuò)修復(fù)(error-pronerepair)(四)SOS反應(yīng)誘導(dǎo)的修復(fù)
SOSresponse第三節(jié)微生物基因重組細(xì)菌的三種水平基因轉(zhuǎn)移形式接合轉(zhuǎn)導(dǎo)自然轉(zhuǎn)化一、原核微生物基因重組第三節(jié)微生物基因重組細(xì)菌的三種水平基因轉(zhuǎn)移形式接合轉(zhuǎn)導(dǎo)自然一、細(xì)菌的接合作用(conjugation)通過細(xì)胞與細(xì)胞的直接接觸而產(chǎn)生的遺傳信息的轉(zhuǎn)移和重組過程一、細(xì)菌的接合作用(conjugation)通過細(xì)胞與細(xì)胞的2.機(jī)制(大腸桿菌的接合機(jī)制)接合作用是由一種被稱為F因子的質(zhì)粒介導(dǎo)F因子的分子量通常為5×107,上面有編碼細(xì)菌產(chǎn)生性菌毛(sexpili)及控制接合過程進(jìn)行的20多個(gè)基因。含有F因子的細(xì)胞:“雄性”菌株(F+),其細(xì)胞表面有性菌毛
不含F(xiàn)因子的細(xì)胞:“雌性”菌株(F-),細(xì)胞表面沒有性菌毛2.機(jī)制(大腸桿菌的接合機(jī)制)接合作用是由一種被稱為F因子F因子為附加體質(zhì)粒既可以脫離染色體在細(xì)胞內(nèi)獨(dú)立存在,也可插入(整合)到染色體上F因子為附加體質(zhì)粒(二)細(xì)菌的轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction)由噬菌體介導(dǎo)的細(xì)菌細(xì)胞間進(jìn)行遺傳交換的一種方式:一個(gè)細(xì)胞的DNA通過病毒載體的感染轉(zhuǎn)移到另一個(gè)細(xì)胞中能將一個(gè)細(xì)菌宿主的部分染色體或質(zhì)粒DNA帶到另一個(gè)細(xì)菌的噬菌體稱為轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體細(xì)菌轉(zhuǎn)導(dǎo)的二種類型:普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)(二)細(xì)菌的轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction)由噬菌體介導(dǎo)的1、普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)(generalizedtransduction)噬菌體可以轉(zhuǎn)導(dǎo)給體染色體的任何部分到受體細(xì)胞中的轉(zhuǎn)導(dǎo)過程(1)意外的發(fā)現(xiàn)1951年,JoshuaLederberg和NortonZinder為了證實(shí)大腸桿菌以外的其它菌種是否也存在接合作用,用二株具不同的多重營(yíng)養(yǎng)缺陷型的鼠傷寒沙門氏菌進(jìn)行類似的實(shí)驗(yàn):用“U”型管進(jìn)行同樣的實(shí)驗(yàn)時(shí),在給體和受體細(xì)胞不接觸的情況下,同樣出現(xiàn)原養(yǎng)型細(xì)菌!1、普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)(generalizedtransducti形成轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的噬菌體可以是溫和的也可以是烈性的,但必須具有能偶爾識(shí)別宿主DNA的包裝機(jī)制并在宿主基因組完全降解以前進(jìn)行包裝。普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)的基本要求:形成轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的噬菌體可以是溫和的也可以是烈性的,普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)的三種后果:進(jìn)入受體的外源DNA通過與細(xì)胞染色體的重組交換而形成穩(wěn)定的轉(zhuǎn)導(dǎo)子流產(chǎn)轉(zhuǎn)導(dǎo)(abortivetransduction)轉(zhuǎn)導(dǎo)DNA不能進(jìn)行重組和復(fù)制,但其攜帶的基因可經(jīng)過轉(zhuǎn)錄而得到表達(dá)。外源DNA被降解,轉(zhuǎn)導(dǎo)失敗。DNA不能復(fù)制,因此群體中僅一個(gè)細(xì)胞含有DNA,而其它細(xì)胞只能得到其基因產(chǎn)物,形成微小菌落。普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)的三種后果:進(jìn)入受體的外源DNA通過與細(xì)胞染色體流2、局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)(specializedtransduction)溫和噬菌體感染整合到細(xì)菌染色體的特定位點(diǎn)上宿主細(xì)胞發(fā)生溶源化溶源菌因誘導(dǎo)而發(fā)生裂解時(shí),在前噬菌體二側(cè)的少數(shù)宿主基因因偶爾發(fā)生的不正常切割而連在噬菌體DNA上部分缺陷的溫和噬菌體把供體菌的少數(shù)特定基因轉(zhuǎn)移到受體菌中2、局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)(specializedtransducti2、局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)(specializedtransducti
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