




版權(quán)說(shuō)明:本文檔由用戶(hù)提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)
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1、western blot操作步驟2012版2012-02-03 00:00 來(lái)源:丁香園 點(diǎn)擊次數(shù): 4016 關(guān)鍵詞: western blot 操作步驟 分享到: 收藏夾 騰訊微博 新浪微博 開(kāi)心網(wǎng) 文轉(zhuǎn)載于丁香園站友dlzhangyu的論壇大作,點(diǎn)此查看詳情,感謝dlzhangyu站友的分享。2011年鄙人做western的時(shí)候,發(fā)現(xiàn)目前的資料都很老,網(wǎng)上的資料也大多互相傳抄,說(shuō)法各異,于是綜合了目前網(wǎng)上所能找到的資料和個(gè)人實(shí)際經(jīng)驗(yàn),編輯了這份western blot操作步驟2012版,內(nèi)容包括主要操作步驟和所需要注意的有用的細(xì)節(jié),并附上參考文獻(xiàn)(原諒我無(wú)法像
2、Endnote那樣一一注明文獻(xiàn)出處,只能大概標(biāo)注出引用的參考資料),希望對(duì)大家有幫助。鄙人按下文的步驟操作已經(jīng)做出來(lái)了穩(wěn)定可重復(fù)的、背景干凈的western條帶了,所以相信你也行。為了節(jié)省時(shí)間,鄙人總結(jié)了一下western blot Quick Guide和一天做出western的具體時(shí)間規(guī)劃,附在文末。初次發(fā)這么長(zhǎng)的帖子,難免有錯(cuò),歡迎批判指正。背景:蛋白質(zhì)印跡的發(fā)明者是斯坦福大學(xué)George Stark。Neal Burnette于1981年所著的AnalyticalBiochemistry中首次被稱(chēng)為Western Blot。最開(kāi)始做印跡的是一個(gè)叫Southern的科學(xué)家,但印跡的對(duì)象是
3、DNA鏈,他把這種技術(shù)稱(chēng)為Southern blot,后來(lái)出現(xiàn)了兩個(gè)過(guò)程相似,但是對(duì)象不同的印跡方法,一個(gè)針對(duì)RNA,一個(gè)對(duì)蛋白質(zhì),人們分別把這兩種技術(shù)的稱(chēng)為Northern和Western,與這兩個(gè)技術(shù)的發(fā)明人沒(méi)有關(guān)系了。一、蛋白質(zhì)的樣品制備:由于這一步方法各異,具體步驟請(qǐng)參考試劑盒的說(shuō)明書(shū)即可。蛋白質(zhì)的樣品制備是Western Blotting的第一步,樣品制備是關(guān)鍵步驟,要求盡可能的獲得所有蛋白質(zhì),應(yīng)注意以下問(wèn)題:> 在合適的鹽濃度下,應(yīng)保持蛋白質(zhì)的最大溶解性和可重復(fù)性。> 選擇合適的表面活性劑和還原劑,破壞所有非共價(jià)結(jié)合的蛋白質(zhì)復(fù)合物和共價(jià)鍵二硫鍵,使其形成一個(gè)各自多肽的溶
4、液。盡量去除核酸,多糖,脂類(lèi)等干擾分子。> 防止蛋白質(zhì)在樣品處理過(guò)程中的人為的修飾,制備過(guò)程應(yīng)在低溫下進(jìn)行,以避免細(xì)胞破碎釋放出的各種酶類(lèi)的修飾(加入合適的蛋白酶抑制劑)。> 樣品建議分裝成合適的量(比如分裝出20ul檢測(cè)蛋白質(zhì)定量用),然后保存與-20°或-80中長(zhǎng)期保存,但要注意不要反復(fù)凍融,因?yàn)闀?huì)使蛋白的抗原特性發(fā)生改變。> 若蛋白提取過(guò)程存在問(wèn)題或蛋白發(fā)生降解則很難進(jìn)行好之后的實(shí)驗(yàn),也就很難做出好的結(jié)果了。除此之外 loading buffer的作用也不容忽視,切莫使用不新鮮的上樣緩沖液,同時(shí)在處理時(shí)也應(yīng)注意將樣品與loading buffer混合均勻。二、
5、蛋白質(zhì)定量如果要定量的話(huà),一般選擇BCA或者Bradford方法,BCA要求檢測(cè)波長(zhǎng)為562nm,Bradford為595nm。具體方法見(jiàn)各試劑盒說(shuō)明書(shū)。為避免假陽(yáng)性結(jié)果,建議先把lysis buffer加入BCA工作液或考馬G250混合看是否產(chǎn)生顏色。測(cè)完蛋白含量后,計(jì)算含50100ug蛋白的溶液體積即為上樣量(一般8cm寬的迷你膠每個(gè)泳道最大能承載的蛋白質(zhì)量為150ug,所以如果從組織提取蛋白的話(huà)上樣量不宜過(guò)大)。網(wǎng)上有人喜歡等質(zhì)量上樣(即每個(gè)泳道的上樣體積不一但質(zhì)量一定),也有使用等體積上樣(即先把各個(gè)樣品稀釋到某一固定濃度,然后等體積等質(zhì)量上樣,計(jì)算上樣體積時(shí)需包含loading bu
6、ffer的體積)。按分子克隆的說(shuō)法,還是使用等體積上樣比較好。上樣總體積一般不超過(guò)15ul,加樣孔的最大限度可加20ul樣品。上樣前要將樣品置于燒杯內(nèi),將燒杯置于石棉網(wǎng)上用酒精燈加熱至沸騰,在沸水中煮35min使蛋白充分變性。也可以使用PCR儀95°加熱5min,效果佳,操作方便。之后樣品可以在4冰箱短時(shí)間保存,也可在-20°冰箱保存數(shù)月,但是反復(fù)凍融會(huì)使蛋白質(zhì)的抗原特性改變。三、SDSPAGE電泳1. 清洗玻璃板:蘸點(diǎn)洗潔精輕輕擦洗。兩面都擦洗過(guò)后用自來(lái)水沖,再用蒸餾水沖洗干凈后立在筐里晾干。若不繼續(xù)使用,需用無(wú)水乙醇擦拭后晾干再妥善收起來(lái),玻璃板之間墊玻璃紙隔開(kāi)。梳子應(yīng)
7、用水洗干凈,臨用前用無(wú)水乙醇擦拭晾干。2. 灌膠與上樣 玻璃板對(duì)齊后放入夾中卡緊。然后垂直卡在架子上準(zhǔn)備灌膠(操作前先往玻璃板間灌水,檢查是否漏)。 按配膠試劑盒說(shuō)明書(shū)選擇合適的分離膠濃度配置,最后加入TEMED,之后搖勻即可灌膠。配制凝膠時(shí)要充分混勻,此外應(yīng)保證試劑的新鮮,特別是過(guò)硫酸銨。灌膠時(shí)掌握好速度,避免氣泡產(chǎn)生(注意濃度越小的膠含水越多,凝固后膠體積縮小越多)。然后膠上加一層水,液封后的膠凝的更快(灌膠時(shí)開(kāi)始可快一些,膠面快到所需高度時(shí)要放慢速度。操作時(shí)膠一定要沿玻璃板流下,這樣膠中才不會(huì)有氣泡。加水液封時(shí)要很慢,否則膠會(huì)被沖變形)。未聚合的丙烯酰胺具有神經(jīng)毒性,
8、操作時(shí)應(yīng)該戴手套防護(hù)。梳子插入濃縮膠時(shí),應(yīng)確保沒(méi)有氣泡。注意給積層膠留出足夠的空間(分子克隆推薦長(zhǎng)度為插入的梳齒長(zhǎng)再加1cm)。 當(dāng)水和膠之間有一條折射線時(shí),說(shuō)明膠已凝了。再等幾分鐘覺(jué)得差不多的時(shí)候就可倒去膠上層水并用吸水紙將水吸干。聚合時(shí)間由AP以及TEMED決定,通常在30min左右,AP不新鮮會(huì)導(dǎo)致聚合變慢,氣溫較低時(shí)膠是會(huì)凝得慢一些,必要時(shí)可適當(dāng)增加AP以及TEMED的量,但通常不會(huì)超過(guò)1h,若超過(guò)1h甚至更長(zhǎng)仍未聚合,應(yīng)檢查配制的操作有無(wú)錯(cuò)誤。由于TEMED催化APS釋放相關(guān)化學(xué)基團(tuán),再由APS釋放的基團(tuán)催化Acr/Bis聚合,所以如果APS不新鮮的話(huà)加再多的TEMED效果
9、也不佳,這就是為什么推薦APS每周新鮮配置的原因。 按說(shuō)明書(shū)配積層膠,加入TEMED后立即搖勻即可灌膠。將剩余空間灌滿(mǎn)濃縮膠然后將梳子插入濃縮膠中。灌膠時(shí)也要使膠沿玻璃板流下以免膠中有氣泡產(chǎn)生。插梳子時(shí)要使梳子保持水平。由于膠凝固時(shí)體積會(huì)收縮減小,從而使加樣孔的上樣體積減小,所以在濃縮膠凝固前最好在兩邊補(bǔ)膠至剛剛冒頂。待到濃縮膠凝固后,兩手分別捏住梳子的兩邊豎直向上輕輕將其拔出。 趁積層膠聚合的這段時(shí)間,取適當(dāng)體積樣本混合1X SDS loading buffer(最好事前分裝好,每次從冰箱里取一管即可),95100°加熱5min,若有沉淀可用稍低溫度,比如455
10、5°加熱1h達(dá)到變性的目的。我一般習(xí)慣分裝20ul到PCR管里,先和loading buffer混合好,臨用前用PCR儀加熱95°C 5min,效果不錯(cuò)。 膠做好后連同玻璃板一起安裝到電泳槽上,加入電泳緩沖液后開(kāi)始準(zhǔn)備上樣(我們使用的是大連競(jìng)邁科技公司的MV-III型小型單垂直板電泳槽,電泳液至少要漫過(guò)內(nèi)測(cè)的小玻璃板,電泳槽下面不用倒太多電泳液)。加樣前可用5ml注射器或加樣器先沖洗一下加樣孔。用微量加樣器貼壁吸取樣品,將樣品吸出不要吸進(jìn)氣泡。將加樣器針頭插至加樣孔中緩慢加入樣品(加樣太快可使樣品沖出加樣孔,若有氣泡也可能使樣品溢出。加入下一個(gè)樣品時(shí),進(jìn)樣器需在外
11、槽電泳緩沖液中洗滌3次,以免交叉污染。目前我們做的mini膠上有10個(gè)上樣孔,一般在第一個(gè)孔加入marker(我用的是Fermentas預(yù)染marker),其余9個(gè)孔加入樣品,也可在頭尾孔內(nèi)加入marker,中間8個(gè)孔加樣品。加樣前樣品應(yīng)先離心,尤其是長(zhǎng)時(shí)間放置的樣品。在未加樣的孔中應(yīng)加入等量的樣品緩沖液。上樣時(shí),小心不要使樣品溢出而污染相臨加樣孔。也可使用10ul的槍頭就行,比用微量加樣器快很多,用槍頭時(shí)注意不要插得太深,容易把玻璃板撐開(kāi),樣品就落到膠和玻璃板之間的空隙了。3. 電泳電泳槽內(nèi)加入電泳緩沖液沖洗清除黏附在凝膠底部的氣和未聚合的丙烯酰胺,網(wǎng)上有資料建議低電壓短時(shí)間的預(yù)電泳,清除凝
12、膠內(nèi)的雜質(zhì),疏通凝膠孔徑以保證電泳過(guò)程中電泳的暢通,但是在分子克隆上卻反對(duì)這種做法,理由是會(huì)破壞緩沖系統(tǒng)pH的不連續(xù)性。請(qǐng)各位按照實(shí)際經(jīng)驗(yàn)來(lái)做即可。電泳時(shí)間和電壓說(shuō)法各異。按照各實(shí)驗(yàn)室的慣例或者電泳槽的使用說(shuō)明來(lái)操作。電泳至溴酚蘭剛跑出即可終止電泳,進(jìn)行轉(zhuǎn)膜。為減少蛋白質(zhì)條帶的擴(kuò)散,上樣后應(yīng)盡快進(jìn)行電泳,電泳結(jié)束后也應(yīng)直接或者轉(zhuǎn)印。四、轉(zhuǎn)膜我們實(shí)驗(yàn)室使用的是半干轉(zhuǎn)膜電泳槽。對(duì)于轉(zhuǎn)印90kd以下的蛋白,轉(zhuǎn)膜液都不用加SDS,如果是蛋白分子量大的話(huà)可以加入0.037%的SDS。1. 在電泳結(jié)束前20min開(kāi)始準(zhǔn)備轉(zhuǎn)膜所需的東西。轉(zhuǎn)一張膜需準(zhǔn)備6張的濾紙(長(zhǎng)一般為8.18.3cm,寬度根據(jù)裁的膠大小
13、實(shí)際測(cè)量,但膠一般會(huì)縮水,所以裁8cm就行)和1張PVDF膜。切濾紙和膜時(shí)一定要戴干凈手套,因?yàn)槭稚系牡鞍讜?huì)污染膜。PVDF膜使用前用無(wú)水甲醇中浸泡1min2min。目的是為了活化PVDF膜上面的正電基團(tuán),使它更容易跟帶負(fù)電的蛋白質(zhì)結(jié)合,做小分子的蛋白轉(zhuǎn)移時(shí)多加甲醇也是這個(gè)目的。2. 將玻璃板撬開(kāi)才可剝膠,撬的時(shí)候動(dòng)作要輕,要在兩個(gè)邊上輕輕的反復(fù)撬。撬一會(huì)兒玻璃板便開(kāi)始松動(dòng),直到撬去玻板(撬時(shí)一定要小心,玻板很脆弱,我用的是冰箱里附帶的塑料除霜鏟,效果出奇的好)。除去小玻璃板后,將濃縮膠輕輕刮去,要避免把分離膠刮破。也可取10ml注射器吸滿(mǎn)轉(zhuǎn)印緩沖液,往玻璃板與凝膠之間注水,使液體的壓力將兩者
14、自然分開(kāi)。取出凝膠后應(yīng)注意分清上下,可以在右上角裁一個(gè)小角。之后有兩種方法供選擇,一是按照marker指示,把含有自己感興趣的蛋白的膠裁下來(lái),二是把整張膠轉(zhuǎn)膜,前一種方法更加節(jié)約材料,但操作稍微麻煩了一點(diǎn)。在加有轉(zhuǎn)移液的培養(yǎng)皿里放入裁好的膠、浸過(guò)甲醇的PVDF膜和濾紙,平衡10min左右,也是為了除去濾紙和轉(zhuǎn)移膜中的氣泡以及膠上多余的SDS。3. 帶上手套,平放轉(zhuǎn)移槽的底座,依次在石墨電極上疊放3張浸泡過(guò)緩沖液的濾紙、PVDF膜(此時(shí)可在PVDF右上角減去一個(gè)角,以辨明轉(zhuǎn)膜后的蛋白面與非蛋白面)、剛剛完成電泳的凝膠和另外3張浸泡過(guò)緩沖液的濾紙。用槍頭或移液管在疊層的濾紙上滾動(dòng),除去氣泡。注意每
15、疊一層就要用玻璃棒或圓筒試管趕去氣泡,因?yàn)橐粋€(gè)氣泡的厚度對(duì)于蛋白來(lái)說(shuō)都是十萬(wàn)八千里的。用干凈紗布將疊層上面和周?chē)亩嘤嗑彌_液吸干(這一步很重要,寧可太干也不能太濕,太干容易燒胡,太濕的話(huà)多余的緩沖液會(huì)導(dǎo)致電流短路,大大降低轉(zhuǎn)移效率,如果同時(shí)轉(zhuǎn)好幾條膠的時(shí)候更要小心,有一個(gè)膠短路就會(huì)影響整體的轉(zhuǎn)移效率)。最后將轉(zhuǎn)移槽的上蓋扣上,接通電源開(kāi)始轉(zhuǎn)膜。由于設(shè)備昂貴,第一次操作應(yīng)向熟手請(qǐng)教,否則短路可能燒壞設(shè)備!轉(zhuǎn)完后立即清洗設(shè)備,特別是金屬上蓋,轉(zhuǎn)膜液特別容易在金屬上蓋上形成結(jié)痂,影響設(shè)備的正常使用,我們實(shí)驗(yàn)室今年做western的同志因?yàn)楹雎赃@一點(diǎn),轉(zhuǎn)膜儀燒壞了好幾次。4. 依據(jù)分子量大小電泳156
16、0min。如果初次轉(zhuǎn)膜,可以根據(jù)一般經(jīng)驗(yàn),即多少kD的蛋白就轉(zhuǎn)多少分鐘,再根據(jù)結(jié)果調(diào)整時(shí)間。之后斷開(kāi)電源,取出轉(zhuǎn)移膜進(jìn)行后繼實(shí)驗(yàn)。5. 為了便于觀察電泳效果和轉(zhuǎn)膜效果,以及判斷蛋白分子量大小,最好使用預(yù)染。傳統(tǒng)方法是將膜用1×麗春紅染液染5min(于脫色搖床上搖)。然后用水沖洗掉沒(méi)染上的染液就可看到膜上的蛋白。實(shí)際上更常用且簡(jiǎn)便的方法是先將膜晾干,然后浸入20%的甲醇,待完全浸濕后取出透光觀察即可看到蛋白條帶(此方法僅僅適合PVDF膜)。將膜晾干備用。使用預(yù)染marker話(huà)可以看見(jiàn)marker的顏色轉(zhuǎn)印到了膜上,但是憑借這個(gè)顏色來(lái)判斷是否轉(zhuǎn)印完全或轉(zhuǎn)印過(guò)頭是不可靠的。五、免疫雜交反應(yīng)
17、1. 將膜移至含有封閉液的平皿中,室溫下脫色搖床上搖動(dòng)封閉1h即可。如果是自己配置的封閉液,最好過(guò)濾一下以消除固體雜質(zhì)。實(shí)際經(jīng)驗(yàn)表明與其封閉過(guò)夜,不如一抗孵育過(guò)夜,具體原因可以參考這個(gè)帖子:2. 將一抗用封閉液稀釋?zhuān)ㄒ话阌梅忾]液稀釋即可,如果背景不高用TBST稀釋也可以,當(dāng)然熟練后還可以自由發(fā)揮,配制一些自己的復(fù)方稀釋液)至適當(dāng)濃度(可以在1.5mlEP管中配置工作液,常用稀釋倍數(shù)為1:200,1:500,1:1000,具體需要預(yù)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行摸索,用后可回收重復(fù)用23次,但回收重復(fù)利用的效果如何就要看抗體的質(zhì)量,分裝的抗體不推薦回收。稀釋后應(yīng)在23天內(nèi)使用,4度保存,避免反復(fù)凍融。);撕下適當(dāng)大小
18、的一塊兒保鮮膜鋪于實(shí)驗(yàn)臺(tái)面上,四角用水浸濕以使保鮮膜保持平整;將抗體溶液加到保鮮膜上;從封閉液中取出膜,用濾紙吸去殘留液后,將膜蛋白面朝下放于抗體液面上,掀動(dòng)膜四角以趕出殘留氣泡(也可使用手術(shù)室的病理袋,質(zhì)量不錯(cuò),減去下面的折疊部分,用封口器(4080元一個(gè))封上,不漏液即可)。37°孵育1h之后轉(zhuǎn)移到室溫下再孵育1h(或者4°孵育過(guò)夜),用TBST在室溫下脫色搖床上洗兩次,每次10min;再用TBS洗一次,10min。也可以多洗幾次,比如4次,每次5min。3. 在培養(yǎng)皿內(nèi)加入二抗稀釋液(10ml足夠了,一般1:1000甚至1:10000用TBST稀釋?zhuān)?,放在搖床上,室溫
19、下孵育12h后,用TBST在室溫下脫色搖床上洗兩次,每次10min;再用TBS洗一次,10min,進(jìn)行化學(xué)發(fā)光反應(yīng)。選擇好一個(gè)合適的條件不要輕易改變,另外相比一抗,二抗作用的時(shí)間應(yīng)嚴(yán)格控制,實(shí)踐證明一抗時(shí)間長(zhǎng)點(diǎn)可能沒(méi)什么關(guān)系,而二抗時(shí)間若過(guò)長(zhǎng)過(guò)短都將會(huì)直接影響結(jié)果。二抗孵育之后還要注意好好洗滌,否則顯影是背景可能臟。六、化學(xué)發(fā)光(ECL),顯影,定影1. 現(xiàn)在工作臺(tái)上鋪一張保鮮膜,將PVDF膜放在保鮮膜上。將ECL的A和B兩種試劑在EP管內(nèi)等體積混合(注意吸完A試劑后吸B試劑前要患槍頭),然后均勻滴在PVDF膜的蛋白面,反應(yīng)12min后,將PVDF膜上多余的ECL工作液吸干,之后轉(zhuǎn)移到在X片夾
20、中預(yù)先鋪好的保鮮膜上一側(cè),把另一側(cè)翻過(guò)來(lái)蓋在其上。用透明膠把保鮮膜固定在片夾上。2. 在暗室中,將1×顯影液和定影液分別到入塑料盤(pán)中;在紅燈下取出X光片,用切紙刀剪裁適當(dāng)大?。ū饶さ拈L(zhǎng)和寬均需大1cm);打開(kāi)X-光片夾,把X光片放在膜上,一旦放上,便不能移動(dòng),關(guān)上X-光片夾,開(kāi)始計(jì)時(shí);根據(jù)信號(hào)的強(qiáng)弱適當(dāng)調(diào)整曝光時(shí)間,一般為1min到2min,也可選擇不同時(shí)間多次壓片,以達(dá)最佳效果(也有人重疊壓好幾張片,固定曝光510分鐘,從這好幾張片中選出最合適的底片);曝光完成后,打開(kāi)X-光片夾,取出X-光片,迅速浸入顯影液中顯影,待出現(xiàn)明顯條帶后,即刻終止顯影。顯影時(shí)間一般為12min(2025
21、),溫度過(guò)低時(shí)(低于16)需適當(dāng)延長(zhǎng)顯影時(shí)間;顯影結(jié)束后,馬上把X-光片浸入定影液中,定影時(shí)間一般為510min,以膠片透明為止;用自來(lái)水沖去殘留的定影液后,室溫下晾干(注意:顯影和定影需移動(dòng)膠片時(shí),盡量拿膠片一角,手指甲不要?jiǎng)潅z片,否則會(huì)對(duì)結(jié)果產(chǎn)生影響)。X光片一般選用柯達(dá)原裝的生物實(shí)驗(yàn)專(zhuān)用柯達(dá)X-OMATBT膠片 。顯影液和定影液最好每周配置一次,避光室溫保存,顯影和定影液是最便宜的試劑了,千萬(wàn)不要因?yàn)樗绊懥苏麄€(gè)結(jié)果。七、凝膠圖象分析將膠片進(jìn)行掃描或拍照,用凝膠圖象處理系統(tǒng)分析目標(biāo)帶的分子量和凈光密度值,比如bio-rad的Quantity One。如何使用請(qǐng)看這里。主要參考資料:1
22、、WB實(shí)戰(zhàn)指南+正確使用Quantity One定量 by jacqueslm2001 2、Abcam的western新手指南 3、土豆網(wǎng)的western blot視頻 上海交大出品 4、分子克隆實(shí)驗(yàn)指南精編版 化學(xué)工業(yè)出版社5、抗體技術(shù)實(shí)驗(yàn)指南科學(xué)技術(shù)出版社6、milipore的western blot的優(yōu)化方案 7、Western blot步步看(網(wǎng)絡(luò)流傳最廣的資料) 作者不詳 8、Bio-rad 蛋白印跡手冊(cè) 9、窮人的勞斯萊斯-我的五年western blot體會(huì) by seagate 附:Western Blot Quick Guide(以及一天跑完Western的時(shí)間規(guī)劃)前期準(zhǔn)備
23、:蛋白已經(jīng)定量,各樣本已經(jīng)稀釋到某固定濃度,已經(jīng)和SDS loading buffer混合,已經(jīng)分裝好,保存與-20°。頭天下午或晚上配膠,分離膠和濃縮膠一起配好,帶上梳子,放入潮濕的自封袋內(nèi)放入4°冰箱備用。8:00 從冰箱里取出蛋白樣品,用PCR儀95度加熱5min?;旌暇鶆虿㈦x心。8:30 取出昨晚配好的膠,組合,加電泳液。在電泳液里拔梳子能稍微容易一些。用10ul的槍加樣。9:00 開(kāi)始電泳。恒流30mA一般1個(gè)小時(shí)足夠了。9:30 開(kāi)始準(zhǔn)備轉(zhuǎn)膜用的濾紙和PVDF膜,PVDF膜泡甲醇。一般8cm的寬是固定的,所以如果要裁膠的話(huà)可以先大概估計(jì)一下。10:10 電泳結(jié)束
24、(假設(shè)電泳用了70分鐘),起開(kāi)玻璃板,裁出膠上所要的條帶,如果整塊膠轉(zhuǎn)就更方便了。把膠放在盛有轉(zhuǎn)膜緩沖液的培養(yǎng)皿里。11:00 轉(zhuǎn)膜開(kāi)始(這里裁紙和鋪三明治還是比較費(fèi)時(shí)間的,我一般要用30分鐘到50min,所以這里要抓緊時(shí)間)。12:00 轉(zhuǎn)膜結(jié)束(這里按60min的半干轉(zhuǎn)的時(shí)間來(lái)計(jì)算)。開(kāi)始封閉1h。13:00 封閉結(jié)束,開(kāi)始孵育一抗(在這里你可以選擇一抗孵育過(guò)夜,如果不過(guò)夜的那一天就能結(jié)束),如果不過(guò)夜的話(huà)我一般選擇37° 1h然后在室溫(23°左右)再1h。15:00 一抗孵育結(jié)束。TBST洗滌3*10min或者5*6min。15:30 開(kāi)始孵育二抗。室溫1h足夠了。
25、16:30 二抗孵育結(jié)束。TBST洗滌3*10min或者5*6min,這里推薦采用5*6min。17:00 ECL發(fā)光,壓片10min,顯影1min,定影10min,那么在18:00之前你就能看到結(jié)果了,呵呵,如果結(jié)果不好還有后招,用stripping(一抗二抗洗脫液)洗滌,我用的是碧云天的堿性一抗二抗洗脫液,按照說(shuō)明書(shū)來(lái)一般20min就行,然后洗滌幾次,重新封閉1h,然后一抗過(guò)夜,明日在繼續(xù)戰(zhàn)斗。這樣的話(huà)18:30之前也能結(jié)束戰(zhàn)斗了。 Western Blot(免疫印跡法)(圖)主要包括以下 4 個(gè)基本步驟:樣品制備;電泳分離;蛋白的膜轉(zhuǎn)移;免疫雜交與顯色蛋白檢測(cè)。溶液和試劑1.
26、1X 磷酸鹽緩沖液(PBS)2. ModifiedRIPAbuffer:Tris-HCl:50 mM, pH 7.4 ; NP-40: 1% ;Na-deoxycholate: 0.25% ;NaCl: 150 mM ;EDTA:1 mM ;PMSF: 1 mM;Aprotinin,leupeptin,pepstatin:1 microgram/ml each ;Na3VO4: 1 mM;NaF: 1 mM3. 1X SDS 樣品緩沖液:62.5 mMTris-HCl(pH 6.8 于 25° C), 2% w/v SDS, 10%甘油,50 mMDTT, 0.01% w/v溴酚藍(lán)4
27、. 轉(zhuǎn)移緩沖液:25 mM Trisbase, 0.2 M 甘氨酸, 20%甲醇 (pH 8.3)5. 10X Tris緩沖鹽 (TBS):準(zhǔn)備1L 10X TBS:24.2 g Trisbase, 80 g NaCl;用1N HCl調(diào)pH為 7.67. 甲醇8. TBS/T緩沖液:1X TBS, 0.1% Tween-209. 封閉緩沖液(TBS/T):1X TBS,0.1% Tween-20加5% w/v脫脂奶粉或BSA10. 一抗的稀釋?zhuān)?X TBS,0.1% Tween-20 加 5% BSA ( 多抗) 或 5%脫脂奶粉( 單抗)。Note: 一般來(lái)說(shuō),BSA被推薦用于多克隆抗體,脫
28、脂奶粉用于單克隆抗體,這樣可得到較高的信噪比。預(yù)染的蛋白質(zhì)Marker,可用于監(jiān)測(cè)轉(zhuǎn)膜的效率。樣品制備原始樣品可為細(xì)胞、組織、培養(yǎng)上清、免疫沉淀或親和純化的蛋白,以下為 定性檢測(cè)目的蛋白時(shí)細(xì)胞樣品的處理方法,其余的樣品制備方法參閱相關(guān)文獻(xiàn)。1培養(yǎng)細(xì)胞或藥物處理。2棄培養(yǎng)基,用1X PBS漂洗細(xì)胞2次,去盡殘留培養(yǎng)基。3加入1X SDS樣品緩沖液(6-well plate,100l /w或 75 cm2 plate,500- 1000l/瓶) ,刮落細(xì)胞,轉(zhuǎn)移到Ep管。注意:冰上操作。4超聲 1015秒剪切DNA以減低樣品粘性。5煮沸樣品5 minutes。6離心12000g,5 min,取上清
29、。7電泳分離:上樣15l20l 至 SDS-PAGE 膠 (10 cm x 10 cm)電泳。 如要定量檢測(cè)某蛋白的表達(dá)水平, 應(yīng)用RIPA裂解液(1 ml per 107 cells/100 mm dish/150cm2 flask)裂解細(xì)胞, 收集裂解液至離心管中,在振蕩器上混勻415min,14000g離心15min(4),棄沉淀,用Bradford法或其它蛋白質(zhì)測(cè)定方法測(cè)定上清中蛋白濃度以調(diào)整上樣體積和上樣量,進(jìn)行Western雜交時(shí)還需設(shè)置內(nèi)或外參照,通常用beta-actin。注意:一般上樣2030 g已足夠,如待檢蛋白為低豐度蛋白,可加大上樣量 至100g,但電泳條帶
30、易拖尾,可制備亞細(xì)胞組份或采用更敏感的檢測(cè)方法。電泳分離(參照SDS-PAGE電泳方法) 轉(zhuǎn)膜雜交膜的選擇是決定 Western blot成敗的重要環(huán)節(jié)。應(yīng)根據(jù)雜交方案、被轉(zhuǎn) 移蛋白的特性以及分子大小等因素,選擇合適材質(zhì)、孔徑和規(guī)格的雜交膜。用于Western blot的膜主要有兩種:硝酸纖維素膜(NC) 和 PVDF 膜。NC 膜是蛋白印跡實(shí)驗(yàn)的標(biāo)準(zhǔn)固相支持物,在低離子轉(zhuǎn)移緩沖液的環(huán)境下,大多數(shù)帶負(fù)電荷的蛋白質(zhì)會(huì)與膜發(fā)生疏水作用而高親和力的結(jié)合在一起, 但在非離子型的去污劑作用 下,結(jié)合的蛋白還可以被洗脫下來(lái)。根據(jù)被轉(zhuǎn)移的蛋白分子量大小,選擇不同孔 徑的 NC 膜。因?yàn)殡S著膜孔徑的不斷減小,
31、膜對(duì)低分子量蛋白的結(jié)合就越牢固。 通常用 0.45 m 和 0.2m 兩種規(guī)格的 NC 膜。 大于20kD 的蛋白可用 0.45m 的膜, 小于 20kD的蛋白就要用 0.2 m 的膜了, 如用0.45 m 的膜就會(huì)發(fā)生“Blowthrough”的現(xiàn)象。PVDF 膜靈敏度、分辨率和蛋白親和力比常規(guī)的膜要高,非常適合于低 分子量蛋白的檢測(cè)。但 PVDF 膜在使用之前必需用純甲醇浸泡飽和 1-5 秒鐘。蛋白質(zhì)常用的轉(zhuǎn)移方法主要有兩種:槽式濕轉(zhuǎn)和半干轉(zhuǎn)移。前者操作容易, 轉(zhuǎn)移效率高;而后者適用于大膠的蛋白轉(zhuǎn)移,所用緩沖液少。以下為槽式濕轉(zhuǎn)的 操作步驟。1. 將膠浸于轉(zhuǎn)
32、移緩沖液中平衡 10min。 注意:如檢測(cè)小分子蛋白,可省略此步,因小分子蛋白容易擴(kuò)散出膠。2. 依據(jù)膠的大小剪取膜和濾紙6 片, 放入轉(zhuǎn)移緩沖液中平衡10min。 如用P VDF 膜需用純甲醇浸泡飽和 3-5 秒鐘。3. 裝配轉(zhuǎn)移三明治: 海綿 3 層濾紙 膠 膜 3 層濾紙 海綿, 每層放好后, 用試管趕去氣泡。切記:膠放于負(fù)極面(黑色面)。4. 將轉(zhuǎn)移槽置于冰浴中,放入三明治(黑色面對(duì)黑色面),加轉(zhuǎn)移緩沖液, 插上電極,100V,1h(電流約為 0.3A)。注意:應(yīng)再次檢查三明治和電極是否裝配正確,電源是否接通。5. 轉(zhuǎn)膜結(jié)束后,切斷電源,取出雜交膜免疫雜交與顯色1用25 ml TBS
33、洗膜5min,室溫,搖動(dòng)。2置膜于25 ml 封閉緩沖液中1h, 室溫,搖動(dòng)。315mlTBS/T洗3次(5 min/T)。4加入合適稀釋度的一抗,室溫孵育1-2h或4°C過(guò)夜,緩慢搖動(dòng)。515 ml TBS/T洗3次(5 min/T)。6加入合適稀釋度的堿性磷酸酶(AP)或辣根過(guò)氧化酶(HRP)標(biāo)記的二 抗,室溫孵育1h,緩慢搖動(dòng)。715 ml TBS/T洗3次(5 min/T)。815 ml TBS洗1次。9蛋白檢測(cè)( 顯色法或發(fā)光法,按相應(yīng)試劑說(shuō)明操作) 。注意事項(xiàng):1操作中戴手套,不要用手觸膜。2PVDF膜在甲醇中浸泡時(shí)間不要超過(guò)5秒。3如檢測(cè)小于20kD的蛋白應(yīng)用0.2m的
34、膜,并可省略轉(zhuǎn)移時(shí)的平衡步驟。4某些抗原和抗體可被Tween-20 洗脫,此時(shí)可用1.0% BSA代替Tween-20。5關(guān)于封閉劑的選擇:5%脫脂奶/TBSor PBS: 能和某些抗原相互作用,掩蓋抗體結(jié)合能力;0.33% BSA in PBS:低的內(nèi)源性交叉反應(yīng)性。6如用0. 1% Tween20、0.02% NaN3 in PBSor TBS作封閉劑和抗體稀釋液,抗體檢測(cè)后可進(jìn)行蛋白染色。7如要同時(shí)檢測(cè)大分子量和小分子蛋白,最好用梯度膠分離蛋白。Western Blot免疫印跡實(shí)驗(yàn)操作規(guī)程Western免疫印跡(Western Blot)是將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到膜上,然后利用抗體進(jìn)行檢測(cè)。對(duì)已知
35、表達(dá)蛋白,可用相應(yīng)抗體作為一抗進(jìn)行檢測(cè),對(duì)新基因的表達(dá)產(chǎn)物,可通過(guò)融合部分的抗體檢測(cè)。一、原理與Southern或Northern雜交方法類(lèi)似,但Western Blot采用的是聚丙烯酰胺凝膠電泳,被檢測(cè)物是蛋白質(zhì),“探針”是抗體,“顯色”用標(biāo)記的二抗。經(jīng)過(guò)PAGE分離的蛋白質(zhì)樣品,轉(zhuǎn)移到固相載體(例如硝酸纖維素薄膜)上,固相載體以非共價(jià)鍵形式吸附蛋白質(zhì),且能保持電泳分離的多肽類(lèi)型及其生物學(xué)活性不變。以固相載體上的蛋白質(zhì)或多肽作為抗原,與對(duì)應(yīng)的抗體起免疫反應(yīng),再與酶或同位素標(biāo)記的第二抗體起反應(yīng),經(jīng)過(guò)底物顯色或放射自顯影以檢測(cè)電泳分離的特異性目的基因表達(dá)的蛋白成分。該技術(shù)也廣泛應(yīng)用于檢測(cè)蛋白水平
36、的表達(dá)。二、試劑準(zhǔn)備1. SDS-PAGE試劑:見(jiàn)電泳實(shí)驗(yàn)。2. 勻漿緩沖液:1.0M Tris-HCl(pH 6.8)1.0ml;10%SDS 6.0ml;-巰基乙醇 0.2ml;ddH2O 2.8ml。3. 轉(zhuǎn)膜緩沖液:甘氨酸 2.9g;Tris 5.8g;SDS 0.37g;甲醇200ml;加ddH2O定容至1000ml。4. 0.01M PBS(pH7.4):NaCl 8.0g;KCl 0.2g;Na2HPO4 1.44g;KH2PO4 0.24g;加ddH2O至1000ml。5. 膜染色液:考馬斯亮蘭 0.2g;甲醇80ml;乙酸2ml;ddH2O118 ml。包被液(5
37、%脫脂奶粉,現(xiàn)配):脫脂奶粉1.0g 溶于20ml的0.01M PBS中。6. 顯色液:DAB 6.0mg;0.01M PBS 10.0ml;硫酸鎳胺 0.1ml;H2O2 1.0l。三、操作步驟1. 蛋白質(zhì)樣品獲得:細(xì)菌誘導(dǎo)表達(dá)后,可通過(guò)電泳上樣緩沖液直接裂解細(xì)胞,真核細(xì)胞加勻漿緩沖液,機(jī)械或超聲波室溫勻漿0.5-1min。然后4,13,000g離心15min。取上清液作為樣品。2. 電泳:制備電泳凝膠,進(jìn)行SDS-PAGE。3. 轉(zhuǎn)移:(半干式轉(zhuǎn)移) 電泳結(jié)束后將膠條割至合適大小,用轉(zhuǎn)膜緩沖液平衡,5min×3次。 膜處理:預(yù)先裁好與膠條同樣大小的濾紙和NC膜,浸入轉(zhuǎn)膜
38、緩沖液中10min。 轉(zhuǎn)膜:轉(zhuǎn)膜裝置從下至上依次按陽(yáng)極碳板、24層濾紙、NC膜、凝膠、24層濾紙、陰極碳板的順序放好,濾紙、凝膠、NC膜精確對(duì)齊,每一步去除氣泡,上壓500g重物,將碳板上多余的液體吸干。接通電源,恒流1mA/cm2 ,轉(zhuǎn)移1.5hr。轉(zhuǎn)移結(jié)束后,斷開(kāi)電源將膜取出,割取待測(cè)膜條做免疫印跡。將有蛋白標(biāo)準(zhǔn)的條帶染色,放入膜染色液中50s后,在50%甲醇中多次脫色,至背景清晰,然后用雙蒸水洗,風(fēng)干夾于兩層濾紙中保存,留與顯色結(jié)果作對(duì)比。四、免疫反應(yīng):1. 用0.01M PBS洗膜,5min ×3次。2. 加入包被液,平穩(wěn)搖動(dòng),室溫2hr。3. 棄包被液,用0.01
39、M PBS洗膜,5min×3次。4. 加入一抗(按合適稀釋比例用0.01M PBS稀釋?zhuān)后w必須覆蓋膜的全部),4 放置12hr以上。陰性對(duì)照,以1%BSA取代一抗,其余步驟與實(shí)驗(yàn)組相同。5. 棄一抗和1%BSA,用0.01M PBS分別洗膜,5min×4次。6. 加入辣根過(guò)氧化物酶偶聯(lián)的二抗(按合適稀釋比例用0.01M PBS稀釋?zhuān)?,平穩(wěn)搖動(dòng),室溫2hr。7. 棄二抗,用0.01M PBS洗膜,5min×4次。8. 加入顯色液,避光顯色至出現(xiàn)條帶時(shí)放入雙蒸水中終止反應(yīng)。四、注意事項(xiàng)1、一抗、二抗的稀釋度、作用時(shí)間和溫度對(duì)不同的蛋白要經(jīng)過(guò)預(yù)實(shí)驗(yàn)確定最佳條件。2、顯色液必須新鮮配置使用,最后加入H2O2。3、DAB有致癌的潛在可能,操作時(shí)要小心仔細(xì)。檢測(cè)任何目的靶蛋白都有不止一種抗體可供選擇,在同一個(gè)抗體公司,可能會(huì)有好幾種,甚至好幾十種;在不同的抗體公司,那就更多了。那怎樣在琳瑯滿(mǎn)目的抗體中,選擇自己實(shí)驗(yàn)需要的抗體呢?主要考慮如下幾種因素:分析自己實(shí)驗(yàn)應(yīng)用的實(shí)驗(yàn)方法是哪種?分析自己實(shí)驗(yàn)中標(biāo)本的種屬是哪種動(dòng)物或人的?分析樣本中的蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)性質(zhì),分析抗體的標(biāo)記和檢測(cè),分析抗體的宿主來(lái)源種屬
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