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文檔簡介
1、 生物化學(xué)復(fù)習(xí)提綱之名詞解釋等電點(diǎn):在某一PH的溶液中,氨基酸或蛋白質(zhì)解離成陽離子和陰離子的趨勢或程度相等,成為兼性離子,呈電中性,此時(shí)溶液的pH成為該氨基酸或蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)。肽鍵:一分子氨基酸的羧基和一分子氨基酸的氨基脫水縮合形成的酰胺鍵,即-CO-NH-。肽:肽是介于氨基酸和蛋白質(zhì)之間的物質(zhì)。兩個(gè)或以上的氨基酸脫水縮合形成若干個(gè)肽鍵從而組成一個(gè)肽,多個(gè)肽進(jìn)行多級(jí)折疊就組成一個(gè)蛋白質(zhì)分子。蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu):在每種蛋白質(zhì)中氨基酸按照一定的數(shù)目和組成進(jìn)行排列,并進(jìn)一步折疊成特定的空間結(jié)構(gòu)前者我們稱為蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)。蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu):指它的多肽鏈中有規(guī)則重復(fù)的構(gòu)象,限于主鏈原子的局部空間排列,不包
2、括與肽鏈其他區(qū)段的相互關(guān)系及側(cè)鏈構(gòu)象。肽單位:肽鍵的所有四個(gè)原子和與之相連的兩個(gè)-碳原子所組成的基團(tuán)。超二級(jí)結(jié)構(gòu):也稱之基元(motif)。是指在球狀蛋白質(zhì)分子的一級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,相鄰的二級(jí)結(jié)構(gòu)單位(螺旋折疊等)在三維折疊中相互靠近,彼此作用,在局部形成規(guī)則的二級(jí)結(jié)構(gòu)組合體,這種組合體就是超二級(jí)結(jié)構(gòu)。-螺旋(-helix):蛋白質(zhì)中常見的二級(jí)結(jié)構(gòu),肽鏈主鏈繞假想的中心軸盤繞成螺旋狀,一般都是右手螺旋結(jié)構(gòu),螺旋是靠鏈內(nèi)氫鍵維持的。折疊:蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu),肽鍵平面折疊成鋸齒狀,相鄰肽鏈主鏈的N-H和C=O之間形成有規(guī)則的氫鍵,在-折疊中,所有的肽鍵都參與鏈間氫鍵的形成,氫鍵與-折疊的長軸呈垂直關(guān)系
3、。結(jié)構(gòu)域:生物大分子中具有特異結(jié)構(gòu)和獨(dú)立功能的區(qū)域,特別指蛋白質(zhì)中這樣的區(qū)域。蛋白質(zhì)變性:是指蛋白質(zhì)在某些物理和化學(xué)因素作用下其特定的空間構(gòu)象被改變,從而導(dǎo)致其理化性質(zhì)的改變和生物活性的喪失,這種現(xiàn)象稱為蛋白質(zhì)變性。復(fù)性:原有性質(zhì)的意思。變性的生物大分子恢復(fù)成具有生物活性的天然構(gòu)象的現(xiàn)象。 變性的一種逆轉(zhuǎn)。全酶=酶蛋白+輔因子酶原:某些酶在細(xì)胞內(nèi)合成或初分泌時(shí)沒有活性,這些沒有活性的酶的前身稱為酶原共價(jià)催化:個(gè)底物或底物的一部分與催化劑形成共價(jià)鍵,然后被轉(zhuǎn)移給第二個(gè)底物。許多酶催化的基團(tuán)轉(zhuǎn)移反應(yīng)都是通過共價(jià)催化方式進(jìn)行的。酸-堿催化:質(zhì)子轉(zhuǎn)移加速反應(yīng)的催化作用。酶的活性部位:有些必需基團(tuán)雖然在
4、一級(jí)結(jié)構(gòu)上可能相距很遠(yuǎn),但在形成空間結(jié)構(gòu)時(shí)彼此靠近,集中在一起,形成具有一定空間結(jié)構(gòu)的區(qū)域,并能與底物特異地結(jié)合,將底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物。這一區(qū)域,稱為酶的活性部位(Active site)。米氏常數(shù):它的數(shù)值等于酶促反應(yīng)達(dá)到其最大速度Vm一半時(shí)的底物濃度S競爭性抑制作用:有些抑制劑和酶底物結(jié)構(gòu)相似,可與底物競爭酶活性中心,從而抑制酶和底物結(jié)合成中間產(chǎn)物。非競爭性抑制作用:抑制劑既可以與游離酶結(jié)合,也可以與ES復(fù)合物結(jié)合,使酶的催化活性降低。反競爭性抑制作用:抑制劑只與酶-底物復(fù)合物結(jié)合,而不與游離酶結(jié)合的一種酶促反應(yīng)抑制作用。這種抑制作用使得Vmax,Km都變小,但Vmax/Km比值不變。輔助因子
5、:結(jié)合酶由蛋白質(zhì)部分和非蛋白質(zhì)部分組成,前者稱為酶蛋白(apoenzyme),后者稱為輔助因子(cofactor),酶蛋白和輔助因子結(jié)合形成的復(fù)合物稱為全酶,只有全酶才有催化作用。輔酶:是一類可以將化學(xué)基團(tuán)從一個(gè)酶轉(zhuǎn)移到另一個(gè)酶上的有機(jī)小分子,與酶較為松散地結(jié)合,對(duì)于特定酶的活性發(fā)揮是必要的。輔酶中緊密共價(jià)結(jié)合的小分子有機(jī)物,與酶或蛋白質(zhì)結(jié)合的非常緊密,用透析法不能除去。酶活力:是指酶催化一定化學(xué)反應(yīng)的能力。激活劑:能提高酶活性的物質(zhì)。抑制劑:滯或降低化學(xué)反應(yīng)速度的物質(zhì),作用與負(fù)催化劑相同。它不能停止聚合反應(yīng),只是減緩聚合反應(yīng)。借以抑制或緩和化學(xué)反應(yīng)的物質(zhì)。酶的專一性:對(duì)所作用的底物有嚴(yán)格的選
6、擇性。一種酶僅能作用于一種物質(zhì),或一類分子結(jié)構(gòu)相似的物質(zhì),促其進(jìn)行一定的化學(xué)反應(yīng),產(chǎn)生一定的反應(yīng)產(chǎn)物。中間產(chǎn)物學(xué)說:酶促反應(yīng)中,酶首先和底物結(jié)合成不穩(wěn)定的中間配合物(ES),然后再生成產(chǎn)物(P),并釋放出酶。反應(yīng)式為S+E=ESE+P,這里S代表底物,E代表酶,ES為中間產(chǎn)物,P為反應(yīng)的產(chǎn)物醛糖:一類單糖,該單糖中氧化數(shù)最高的C原子(指定為C-1)是一個(gè)醛基,有醇和醛的性質(zhì)。酮糖:一類單糖,該單糖中氧化數(shù)最高的C原子(指定為C-2)是一個(gè)酮基。變旋:一個(gè)吡喃糖、呋喃糖或糖苷伴隨著它們的-和-異構(gòu)形式的平衡而發(fā)生的比旋度變化。糖苷:糖半縮醛羥基與另一個(gè)分子(例如醇、糖、嘌呤或嘧啶)的羥基、胺基或
7、巰基縮合形成的糖衍生物。糖苷鍵:一個(gè)環(huán)狀單糖半縮醛(或半縮酮)羥基與另一個(gè)分子(例如醇、糖、嘌呤或嘧啶)的羥基、胺基或巰基之間縮合形成的縮醛鍵或縮酮鍵,糖苷鍵是連接提供半縮醛羥基的糖和與之縮合的“非糖”部分的化學(xué)鍵。還原糖:指具有還原性的糖類。在糖類中,分子中含有游離醛基或酮基的單糖和含有游離醛基的二糖都具有還原性。同多糖:一種單糖縮合形成的多糖。必需脂肪酸:機(jī)體生命活動(dòng)必不可少,但機(jī)體自身又不能合成,必需由食物供給的多不飽和脂肪酸(PUFA)。磷脂:是含有磷酸的脂類,屬于復(fù)合脂。磷脂組成生物膜的主要成分。脂肪酸:是指一端含有一個(gè)羧基的長的脂肪族碳?xì)滏?,是有機(jī)物,直鏈飽和脂肪酸的通式是C(n)
8、H(2n+ 1)COOH。生物膜:鑲嵌有蛋白質(zhì)和糖類(統(tǒng)稱糖蛋白)的磷脂雙分子層,起著劃分和分隔細(xì)胞和細(xì)胞器作用生物膜,也是與許多能量轉(zhuǎn)化和細(xì)胞內(nèi)通訊有關(guān)的重要部位,同時(shí),生物膜上還有大量的酶結(jié)合位點(diǎn)。細(xì)胞、細(xì)胞器和其環(huán)境接界的所有膜結(jié)構(gòu)的總稱。流體鑲嵌模型:所有的生物膜都是連續(xù)的脂雙分子層,里面埋著各種膜蛋白。脂層是流動(dòng)的,脂分子能夠在自己所在的單層中迅速擴(kuò)散,但是很少翻轉(zhuǎn)到另一層。蛋白質(zhì)以各種方式跟脂結(jié)合,可分為內(nèi)嵌蛋白和外周蛋白。蛋白質(zhì)分子也能水平擴(kuò)散運(yùn)動(dòng)。細(xì)胞膜中蛋白質(zhì)所帶的糖鏈遠(yuǎn)遠(yuǎn)多于脂分子結(jié)合的糖鏈,糖鏈都伸向質(zhì)膜外表面。被動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn):物質(zhì)或離子順著濃度梯度或電位梯度通過細(xì)胞膜的擴(kuò)散過
9、程,其特點(diǎn)是不需要細(xì)胞提供能量。是細(xì)胞膜的物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)作用其中的一種。包括簡單擴(kuò)散、濾過和易化擴(kuò)散三種。主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn):些物質(zhì)(如鉀離子、鈉離子)以細(xì)胞膜特異載體蛋白攜帶下,通過細(xì)胞膜本身的某種耗能過程,逆濃度差或逆電位差的跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)稱為主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)。協(xié)同運(yùn)送:可以通過一個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白進(jìn)行同一方向(同向轉(zhuǎn)運(yùn))或反方向(反向轉(zhuǎn)運(yùn))轉(zhuǎn)運(yùn)。酸敗:油脂在貯藏時(shí)由于與空氣等作用發(fā)生氧化而進(jìn)一步分解產(chǎn)生異臭味的現(xiàn)象。核苷酸:一類由嘌呤堿或嘧啶堿、核糖或脫氧核糖以及磷酸三種物質(zhì)組成的化合物。磷酸二酯鍵:指一分子磷酸與兩個(gè)醇(羥基)酯化形成的兩個(gè)酯鍵。DNA雙螺旋:是一種核酸的構(gòu)象,在該構(gòu)象中,兩條反向平行的多核苷酸鏈相互纏繞形
10、成一個(gè)右手的雙螺旋結(jié)構(gòu)。DNA變性:指核酸雙螺旋堿基對(duì)的氫鍵斷裂,雙鏈變成單鏈,從而使核酸的天然構(gòu)象和性質(zhì)發(fā)生改變。融解溫度:熱變性中光吸收達(dá)到最大吸收(完全變性)一半(雙螺旋結(jié)構(gòu)失去一半)時(shí)的溫度。對(duì)DNA加熱時(shí),二條鏈的氫鍵斷開變成單鏈狀態(tài),把引起這種變化的溫度稱為融解溫度(Tm)。增色效應(yīng):指因高分子結(jié)構(gòu)的改變,而使摩爾吸光系數(shù)(molar extinction coefficient) 增大的現(xiàn)象。生物化學(xué)減色效應(yīng):指:若變性DNA復(fù)性形成雙螺旋結(jié)構(gòu)后,其260nm紫外吸收會(huì)降低,這種現(xiàn)象叫減色效應(yīng)。分子雜交:確定單鏈核酸堿基序列的技術(shù)。其基本原理是待測單鏈核酸與已知序列的單鏈核酸(叫
11、做探針)間通過堿基配對(duì)形成可檢出的雙螺旋片段。呼吸電子傳遞鏈:由一系列可作為電子載體的酶復(fù)合體和輔助因子構(gòu)成,可將來自還原型輔酶或底物的電子傳遞給有氧代謝的最終的電子受體分子氧。氧化磷酸化:是物質(zhì)在體內(nèi)氧化時(shí)釋放的能量供給ADP與無機(jī)磷合成ATP的偶聯(lián)反應(yīng)。化學(xué)滲透假說:是解釋氧化磷酸化作用機(jī)理的一種假說。電子傳遞鏈像一個(gè)質(zhì)子泵,電子傳遞過程中所釋放的能量,可促使質(zhì)子由線粒體基質(zhì)移位到線粒體內(nèi)膜外膜間空間形成質(zhì)子電化學(xué)梯度,即線粒體外側(cè)的H+濃度大于內(nèi)側(cè)并蘊(yùn)藏了能量。P/O比:一對(duì)電子經(jīng)呼吸鏈傳給O2的過程中所產(chǎn)生的ATP分子數(shù)。實(shí)質(zhì)是伴隨ADP磷酸化所消耗的無機(jī)磷酸的分子數(shù)與消耗分子氧的氧原
12、子數(shù)之比。高能化合物:體內(nèi)氧化分解中,一些化合物通過能量轉(zhuǎn)移得到了部分能量,把這類儲(chǔ)存了較高能量的化合物稱為高能化合物·它們是生物釋放,儲(chǔ)存和利用能量的媒介,是生物界直接的供能物質(zhì)。生物氧化:生物體內(nèi),從代謝物脫下的氫及電子通過一系列酶促反應(yīng)與氧化合成水并釋放能量的過程。也指物質(zhì)在生物體內(nèi)的一系列氧化過程。主要為機(jī)體提供可利用的能量。呼吸鏈阻斷劑:能夠阻斷呼吸鏈中某一部位電子流的物質(zhì)稱為電子傳遞阻斷劑或呼吸鍵阻斷劑。已知的阻斷劑及阻斷部。解偶聯(lián)劑:氧化磷酸化的一類抑制劑,使氧化與磷酸化脫離,雖然氧化照常進(jìn)行,但不能生成ATP,則P/O比值降低,甚至為零。糖酵解:指在氧氣不足條件下,葡
13、萄糖或糖原分解為丙酮酸或乳酸的過程,此過程中伴有少量ATP的生成。發(fā)酵:無氧等外源氫受體的條件下,底物脫氫后所產(chǎn)生的還原力H未經(jīng)呼吸鏈傳遞而直接交某一內(nèi)源性中間代謝物接受,以實(shí)現(xiàn)底物水平磷酸化產(chǎn)能的一類生物氧化反應(yīng)。乳酸發(fā)酵:指糖經(jīng)無氧酵解而生成乳酸的發(fā)酵過程,乙醇發(fā)酵同為生物體內(nèi)二種主要的發(fā)酵形式。底物水平磷酸化:物質(zhì)在生物氧化過程中,常生成一些含有高能鍵的化合物,而這些化合物可直接偶聯(lián)ATP或GTP的合成,這種產(chǎn)生ATP等高能分子的方式稱為底物水平磷酸化三羧酸循環(huán):是用于將乙酰CoA中的乙酰基氧化成二氧化碳和還原當(dāng)量的酶促反應(yīng)的循環(huán)系統(tǒng),該循環(huán)的第一步是由乙酰CoA與草酰乙酸縮合形成檸檬酸
14、。磷酸戊糖途徑:葡萄糖氧化分解的一種方式。由于此途徑是由6-磷酸葡萄糖(G6P)開始,故亦稱為己糖磷酸旁路。糖異生作用:由簡單的非糖前體轉(zhuǎn)變?yōu)樘堑倪^程。底物循環(huán):一對(duì)催化兩個(gè)途徑的中間代謝物之間循環(huán)的方向相反、代謝上不可逆的反應(yīng)。糖的有氧氧化無氧氧化:萄糖在有氧條件下,氧化分解生成二氧化碳和水的過程稱為糖的有氧氧化(aerobicoxidation),并釋放出能量。有氧氧化是糖分解代謝的主要方式,大多數(shù)組織中的葡萄糖均進(jìn)行有氧氧化分解供給機(jī)體能量。無氧氧化是指在缺氧或供氧不足的情況下,組織細(xì)胞內(nèi)的糖原,能經(jīng)過一定的化學(xué)變化,產(chǎn)生乳酸和水或乙醇和二氧化碳和水,并釋放出一部分能量的過程,也稱糖酵解
15、。?;d體蛋白:從頭合成脂肪酸,是由含有多種酶的復(fù)合體的脂肪酸合成系統(tǒng)的催化下進(jìn)行的,而在它的酰基縮合的階段,酰基CoA不是作為直接底物,而是被轉(zhuǎn)移至復(fù)合體中的酰基載體蛋白起反應(yīng)的。肉毒堿穿梭系統(tǒng):由于酸的-氧化作用是在線粒體的基質(zhì)中進(jìn)行的,而在細(xì)胞液中形成的長鏈脂酰CoA不能通過線粒體內(nèi)膜,需要內(nèi)膜上的載體肉堿攜帶,以脂?;男问娇缭絻?nèi)膜而進(jìn)入基質(zhì)。尿素循環(huán):肝臟中2分子氨和1分子CO2生成1分子尿素的環(huán)式代謝途徑。氧化脫氨基作用:是指氨基酸在酶的作用下伴有氧化的脫氨基反應(yīng)。轉(zhuǎn)氨:一個(gè)-氨基酸的-氨基借助轉(zhuǎn)氨酶的催化作用轉(zhuǎn)移到一個(gè)-酮酸的過程。生糖氨基酸:能通過代謝轉(zhuǎn)變成葡萄糖的氨基酸。聯(lián)合
16、脫氨基作用:轉(zhuǎn)氨基與谷氨酸氧化脫氨或是嘌呤核苷酸循環(huán)聯(lián)合脫氨,以滿足機(jī)體排泄含氮廢物的需求。半保留復(fù)制:一種雙鏈脫氧核糖核酸(DNA)的復(fù)制模型,其中親代雙鏈分離后,每條單鏈均作為新鏈合成的模板。復(fù)制叉:是DNA復(fù)制時(shí)在DNA鏈上通過解旋、解鏈和SSB蛋白的結(jié)合等過程形成的Y字型結(jié)構(gòu)稱為復(fù)制叉。DNA聚合酶: DNA聚合酶 , 以DNA為復(fù)制模板,從將DNA由5'端點(diǎn)開始復(fù)制到3'端的酶。DNA聚合酶的主要活性是催化DNA的合成(在具備模板、引物、dNTP等的情況下)及其相輔的活性。前導(dǎo)鏈:與復(fù)制叉移動(dòng)的方向一致,通過連續(xù)的5-3聚合合成的新的DNA鏈。滯后鏈:與復(fù)制叉移動(dòng)的方
17、向相反,通過不連續(xù)的5-3聚合合成的新的DNA鏈。岡崎片段:相對(duì)比較短的DNA鏈(大約1000核苷酸殘基),是在DNA的滯后鏈的不連續(xù)合成期間生成的片段。單鏈結(jié)合蛋白:于螺旋酶沿復(fù)制叉方向向前推進(jìn)產(chǎn)生的單鏈區(qū),防止新形成的單鏈DNA重新配對(duì)形成雙鏈DNA或被核酸酶降解的蛋白質(zhì)。轉(zhuǎn)錄:遺傳信息由DNA轉(zhuǎn)換到RNA的過程。作為蛋白質(zhì)生物合成的第一步,轉(zhuǎn)錄是mRNA以及非編碼RNA(tRNA、rRNA等)的合成步驟。核心酶:大腸桿菌的RNA聚合酶全酶由5個(gè)亞基組成(2,),沒有基的酶叫核心酶。內(nèi)含子:在轉(zhuǎn)錄后的加工中,從最初的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物除去的內(nèi)部的核苷酸序列。模板鏈:可作為模板轉(zhuǎn)錄為RNA的那條鏈,該
18、鏈與轉(zhuǎn)錄的RNA堿基互補(bǔ)(A-U,G-C)。在轉(zhuǎn)錄過程中,RNA聚合酶與模板鏈結(jié)合,并沿著模板鏈的3'5'方向移動(dòng),按照5'3'方向催化RNA的合成。編碼鏈:DNA中,不能進(jìn)行轉(zhuǎn)錄的那一條DNA鏈,該鏈的核苷酸序列與轉(zhuǎn)錄生成的RNA的序列一致(在RNA中是以U取代了DNA中的T)。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):簡稱PCR,于放大擴(kuò)增特定的DNA片段??煽醋魃矬w外的特殊DNA復(fù)制。中心法則:指遺傳信息從DNA傳遞給RNA,再從RNA傳遞給蛋白質(zhì),即完成遺傳信息的轉(zhuǎn)錄和翻譯的過程。也可以從DNA傳遞給DNA,即完成DNA的復(fù)制過程。這是所有有細(xì)胞結(jié)構(gòu)的生物所遵循的法則。在某些病
19、毒中的RNA自我復(fù)制(如煙草花葉病毒等)和在某些病毒中能以RNA為模板逆轉(zhuǎn)錄成DNA的過程(某些致癌病毒)是對(duì)中心法則的補(bǔ)充。翻譯是根據(jù)遺傳密碼的中心法則,將成熟的信使RNA分子(由DNA通過轉(zhuǎn)錄而生成)中“堿基的排列順序”(核苷酸序列)解碼,并生成對(duì)應(yīng)的特定氨基酸序列的過程。遺傳密碼決定蛋白質(zhì)中氨基酸順序的核苷酸順序 ,由3個(gè)連續(xù)的核苷酸組成的密碼子所構(gòu)成 。由于脫氧核糖核酸(DNA)雙鏈中一般只有一條單鏈(稱為有義鏈或編碼鏈)被轉(zhuǎn)錄為信使核糖核酸(mRNA),而另一條單鏈(稱為反義鏈)則不被轉(zhuǎn)錄,所以即使對(duì)于以雙鏈 DNA作為遺傳物質(zhì)的生物來講,密碼也用核糖核酸(RNA)中的核苷酸順序而不用DNA中的脫氧核苷酸順序表示。起始密碼子:被認(rèn)為對(duì)應(yīng)于AUG。其中原核生物的起始密碼子AUG翻譯對(duì)應(yīng)的是甲酰甲硫氨酸(fMet),真核生物的起始密碼子AUG翻譯對(duì)應(yīng)的是甲硫氨酸(Met)。密碼子: 信使RNA鏈上決定一個(gè)氨基酸
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