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文檔簡介
1、基因表達量實時熒光定量PCR檢測步驟1 材料(試劑和耗材)1.1 樣本(小鼠組織)-2個1.2 引物(life technology公司合成)1.3 BestarTMqPCR RT Kit(德國DBI貨號:DBI-2220)1.4 Bestar® SybrGreenqPCRmastermix(德國DBI貨號:DBI-2043)1.5 96孔板(美國life technology)2 材料(儀器)2.1 ABI7500熒光定量PCR儀(life technology公司)2.2 TGL-16M低溫冷凍離心機(湘儀)2.3 SW-CJ-1D單人凈化工作臺(瀘凈凈化)2.4 HR40- A
2、2生物安全柜(Haier)3 實驗步驟3.1 RNA的抽提RNA 的提取按life technology公司提供的Triozol RNA提取試劑盒的使用說明進行。程序如下:(1)將組織在液氮中磨碎,每50-100mg組織加入1ml TRIzol;(2)加入0.2mL氯仿,蓋緊離心管管蓋,上下顛倒混勻60s(請勿渦漩激烈振蕩),室溫靜置3min,12,000g,4離心 15min,置于冰上;(3)溶液分為三層,RNA溶解在水相中,小心吸取 500l水相至另一個新的RNasefree的EP管中;(4)加入500l異丙醇,-20度放置1h,12,000g,4離心10min,離心后管底出現(xiàn)RNA沉淀,
3、棄上清;(5)加入1ml 75乙醇,用手輕輕顛倒,12,000g離心5min,去上清;(6)超凈工作臺上吹干樣品10min,加入適量DEPC水溶解RNA。加入40l DEPC水溶解沉淀。3.2 RNA質(zhì)量檢測紫外分光光度計測定RNA濃度:3.3去基因組DNA和cDNA的合成將RNA加入到gDNA吸附柱,室溫10,000g離心1min,收集濾液即為去除基因組DNA的RNA。把RNA在65°C條件下熱變性5分鐘后,立即置于冰上冷卻。逆轉錄反應:5×RT BufferRT Enzyme MixPrimer MixRNARNase-free WaterToal反應條件:37
4、6;C, 15min98°C, 5min4°C,hold反應結束后,-20°C保存。 2L 0.5L 0.5L 6L 1L 10L3.4cDNA的實時熒光定量PCR 3.4.1實驗步驟每個樣本分別設置3個目的基因和3個內(nèi)參基因的平行實驗。PCR反應體系為20L,根據(jù)表1.配置。反應條件為:95°C2min 95°C10s60°C34s(采集熒光信號) 72°C 30s循環(huán)結束后從60升高到98獲取熔解曲線。45個循環(huán)3.4.2實驗結果的分析方法本實驗采用2-Ct法進行分析,計算公式為:F=2對照組目的基因對照組管家基因待測組目的基因待測組管家基因-( - ) -( - )平均Ct值平均Ct值平均Ct值平均Ct值F為相對表達量,根據(jù)此次試驗的設計,對照組中的目的基因表達量為1。4結果4.1 擴增曲線4.2 熔解曲線4.3實驗數(shù)據(jù)見EXCEL表格。備注:Ct
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