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文檔簡(jiǎn)介
1、第五講 酶分子修飾,第五講 酶分子修飾,教學(xué)目標(biāo): 了解有關(guān)酶分子修飾的重要應(yīng)用以及酶分子的物理修飾作用 理解蛋白酶化學(xué)修飾的方法和意義 掌握酶分子化學(xué)修飾的形式、目的、原理與特點(diǎn) 教學(xué)重點(diǎn): 酶分子化學(xué)修飾的方法和意義、酶分子化學(xué)修飾的形式 教學(xué)難點(diǎn): 化學(xué)修飾的原理與特點(diǎn),第五講 酶分子修飾,5.1、酶分子修飾的定義及其意義 5.2、酶分子修飾方法 5.3、酶修飾后的性質(zhì)變化 5.4、酶的分子定向進(jìn)化,分析酶在工業(yè)生產(chǎn)中應(yīng)用受到極大限制的原因,熱穩(wěn)定性差 活力低 耐受pH范圍窄 分子量過(guò)大 成本高 來(lái)源有限 有異體反應(yīng),酶的應(yīng)用受到了很大限制促使科研工作者必須不斷地開(kāi)展新的研究,用化學(xué)或分
2、子生物學(xué)方法對(duì)酶分子進(jìn)行改造,以滿足各種反應(yīng)條件對(duì)酶的需求,克服天然酶的缺陷。 隨著各個(gè)學(xué)科及相關(guān)技術(shù)的發(fā)展,特別對(duì)酶結(jié)構(gòu)與功能的深入了解、基因工程及固定化技術(shù)的普及,酶的分子改造工程進(jìn)入實(shí)用階段。 總體來(lái)說(shuō)酶的分子工程分兩部分: 分子生物學(xué)水平:即用基因工程方法對(duì)DNA進(jìn)行分子改造,以獲得化學(xué)結(jié)構(gòu)更合理的酶蛋白; 對(duì)天然酶分子進(jìn)行改造:包括酶一級(jí)結(jié)構(gòu)中氨基酸置換、肽鏈切割、氨基酸側(cè)鏈修飾等,5.1、酶分子修飾的定義及其意義,1、定義:通過(guò)各種方法使酶分子的結(jié)構(gòu)發(fā)生某些改變,從而改變酶的某些特性和功能的技術(shù)過(guò)程,即在體外將酶分子通過(guò)人工的方法與一些化學(xué)基團(tuán)(物質(zhì)),特別是具有生物相容性的物質(zhì),
3、進(jìn)行共價(jià)連接,從而改變酶的結(jié)構(gòu)和性質(zhì),討論:自然界中存在酶分子改造修飾嗎,酶原激活 可逆共價(jià)調(diào)節(jié),胃蛋白酶原、胰蛋白酶原、胰凝乳蛋白酶原,磷酸化酶a與磷酸化酶b互變,2、酶分子修飾的意義,增強(qiáng)酶的穩(wěn)定性(stability) 提高酶的活力(activity) 降低或消除酶的抗原性(immunological property) 研究和了解酶分子中主鏈、側(cè)鏈、組成單位、金屬離子和各種物理因素對(duì)酶分子空間構(gòu)象(structure)的影響,3、酶分子修飾的基本要求和條件,1)對(duì)酶性質(zhì)的了解: 酶的穩(wěn)定性:熱穩(wěn)定性、酸堿穩(wěn)定性、抑制劑等 酶活性中心的狀況:活性中心基團(tuán)、輔因子以及分子大小、性狀、亞基數(shù)
4、 (2)對(duì)修飾劑的要求: 良好的生物相容性和水溶性 修飾劑的相對(duì)分子質(zhì)量(較大)、修飾劑鏈的長(zhǎng)度對(duì)蛋白質(zhì)的吸附性 修飾劑上反應(yīng)基團(tuán)的數(shù)目及位置 修飾劑上反應(yīng)基團(tuán)的活化方法與條件 (3)對(duì)酶反應(yīng)條件的選擇: 反應(yīng)體系中酶與修飾劑的分子比例 反應(yīng)體系中的溶劑性質(zhì)、鹽濃度和pH條件 反應(yīng)溫度及時(shí)間,5.2、酶分子的修飾方法,物理修飾: 不改變酶的組成單位及其基團(tuán)的修飾,即酶分子中的共價(jià)鍵不發(fā)生改變,只是在物理因素(高溫、高壓、高鹽、極端pH值)作用下,副鍵發(fā)生某些變化和重排。 化學(xué)修飾: 廣義:指凡涉及共價(jià)部分或部分共價(jià)鍵的形成或破壞的轉(zhuǎn)變。 狹義:指在較溫和的條件下以可控的方式使一種蛋白質(zhì)與某些化
5、學(xué)試劑起特異反應(yīng),從而引起單個(gè)氨基酸殘基或其功能基團(tuán)發(fā)生共價(jià)的化學(xué)變化,一、影響酶分子化學(xué)修飾的主要因素,1、酶蛋白功能基團(tuán)的反應(yīng)性 蛋白質(zhì)功能基團(tuán)所處的環(huán)境會(huì)強(qiáng)烈地影響它的物理和化學(xué)性質(zhì) 蛋白質(zhì)分子的表面特點(diǎn)也影響化學(xué)試劑的接近 因此,有必要考察局部衡區(qū)對(duì)功能基和修飾劑的影響。由于功能基的反應(yīng)性是通過(guò)它的親核性來(lái)測(cè)量的,應(yīng)當(dāng)強(qiáng)調(diào)pKa和影響pKa的因素。 2、修飾劑的反應(yīng)性,1、影響酶蛋白功能基團(tuán)的反應(yīng)性因素,微區(qū)的極性 基團(tuán)間的氫鍵 靜電效應(yīng) 位阻效應(yīng) 其它,電荷轉(zhuǎn)移、共價(jià)鍵形成、金屬螯合、旋轉(zhuǎn)自由度,微區(qū)的極性,微區(qū)的極性是決定基團(tuán)解離狀態(tài)的關(guān)鍵因素之一。極性對(duì)整個(gè)反應(yīng)速度影響與反應(yīng)的類
6、型有密切關(guān)系。 從整體看來(lái),局部極性的改變對(duì)色氨酸、甲硫氨酸和胱氨酸反應(yīng)性的影響較小 對(duì)氨基和組氨酸反應(yīng)性的影響較大 對(duì)酪氨酸、半胱氨酸和羧基的反應(yīng)性影響最大,基團(tuán)間的氫鍵作用,在蛋白質(zhì)的酚基-羧基相互作用中,羧基的pKa應(yīng)比正常值低,而酚基的pKa高于正常值,H,靜電效應(yīng),用高分辨率的核磁共振組氨酸殘基的電離行為進(jìn)行研究表明,不同蛋白質(zhì)中的組氨酸殘基的pKa是不同的; 原因可能在于帶電基團(tuán)相互靜電作用的影響,位阻效應(yīng),烷基在空間上緊靠功能基,會(huì)使修飾劑不能與功能基接觸,出現(xiàn)位阻效應(yīng)。 對(duì)枯草桿菌蛋白酶BPN的X射線衍射研究指出:10個(gè)酪氨酸殘基均在蛋白質(zhì)分子表面,而且苯酚的羥基幾乎在所有情況
7、下都沒(méi)有形成氫鍵。對(duì)它進(jìn)行徹底硝化和碘化后,10個(gè)酪氨酸中只有8個(gè)被修飾。若沒(méi)有X射線衍射研究結(jié)果,很可能解釋為至少有2個(gè)酪氨酸殘基被包埋在分子內(nèi)部,但實(shí)際情況并不是這樣的,這種情況很可能是空間障礙引起的,旋轉(zhuǎn)自由度,加快修飾反應(yīng)速度的一個(gè)重要原因是限制了構(gòu)象的總數(shù)(即限制了旋轉(zhuǎn)自由度),這種限制可能是由于上述提及的幾類相互作用引起的。 酚酸的酯化速度:在苯環(huán)上引入幾個(gè)甲基,特別是在同一碳原子上引入2個(gè)甲基,則限制了基團(tuán)的自由旋轉(zhuǎn),因而使酚酸的酯化速度常數(shù)提高了108倍以上,2、影響修飾劑反應(yīng)性的因素,選擇吸附 靜電相互作用 位阻因素 催化因素,選擇吸附,化學(xué)修飾前,修飾劑是根據(jù)各自的特點(diǎn)選擇
8、性地吸附在低極性區(qū)或高極性區(qū),有時(shí)可以根據(jù)對(duì)速度的飽和效應(yīng),檢測(cè)出蛋白質(zhì)-修飾劑復(fù)合物的形成。 正像酶-底物復(fù)合物那樣,蛋白質(zhì)修飾劑復(fù)合物形成后,修飾過(guò)程的速度就加強(qiáng)了,這種速度的加強(qiáng),部分是由于選擇性吸附的結(jié)果,靜電相互作用,帶電的修飾劑能被選擇性地吸引到蛋白質(zhì)表面帶相反電荷的部位,靜電相互作用可使修飾劑向多功能部位中的一個(gè)殘基定位或向雙功能基的一側(cè)定位。修飾劑的靜電取向也是影響其反應(yīng)性的一個(gè)因素。 碘乙酸和碘乙酰胺烷基化速度和烷基化部位差異 此外,靜電排斥力能抑制修飾作用,位阻因素,蛋白質(zhì)表面的位阻因素或者底物、輔因子、抑制劑所產(chǎn)生的位阻因素都可能阻止修飾劑與功能基的正常反應(yīng)。但修飾的結(jié)果
9、卻能提供有關(guān)蛋白質(zhì)表面的有用信息。 用a溴代丁酸可烷基化核糖核酸酶第l2號(hào)組氨酸,而且反應(yīng)進(jìn)行很快; 若用a溴代戊酸作修飾劑,則很難進(jìn)行反應(yīng); 若用a溴代己酸作修飾劑,則不能發(fā)生烷化反應(yīng),催化因素,修飾部位的其他功能基,如果是產(chǎn)生一般的酸堿催化作用,則也能影響修飾反應(yīng)。不同的修飾劑,其反應(yīng)速度和反應(yīng)部位有明顯差異。 對(duì)硝基苯乙酸鹽和苯乙酸鹽對(duì)胰凝乳蛋白酶的活性絲氨酸的乙?;瘜儆谕粰C(jī)理,但苯乙酸鹽的反應(yīng)性差,這在較大程度上與酶的酸堿催化有關(guān)。 氟磷酸鹽與氯磷酸鹽相比,對(duì)絲氨酸酶有非常高的反應(yīng)性,這可能與一般酸堿催化除去氟原子有關(guān),3、修飾反應(yīng)專一性的控制,1)試劑的選擇 (2)反應(yīng)條件的選擇
10、(3)反應(yīng)的專一性,1)試劑的選擇,一般來(lái)說(shuō),選擇蛋白質(zhì)修飾劑要考慮以下問(wèn)題: 修飾反應(yīng)要完成到什么程度 對(duì)個(gè)別氨基酸是否專一 在反應(yīng)條件下,修飾反應(yīng)有沒(méi)有限度 修飾后蛋白質(zhì)的構(gòu)象是否基本保持不變 是否需要分離修飾后的衍生物 反應(yīng)是否可逆 是否適合于建立快速、方便的分析方法,蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)和試劑的空間結(jié)構(gòu)之間的相互影響也能加強(qiáng)修飾反應(yīng)速度和反應(yīng)的專一性。 對(duì)核糖核酸酶A第119號(hào)組氨酸和第l2號(hào)組氨酸的修飾,使用不同的試劑,這兩個(gè)殘基的反應(yīng)速度就不同。 烷基化反應(yīng)在第l2號(hào)組氨酸;羧甲基化反應(yīng)選擇性修飾第119號(hào)組氨酸。 一般來(lái)說(shuō),試劑的體積小一些為宜,這樣既能保證修飾反應(yīng)順利進(jìn)行,又可減少
11、因空間障礙而破壞蛋白質(zhì)分子嚴(yán)密結(jié)構(gòu)的危險(xiǎn),2)反應(yīng)條件的選擇,蛋白質(zhì)與修飾劑作用所要求的反應(yīng)條件,除允許能順利進(jìn) 行外,還必須滿足以下要求: 一是不造成蛋白質(zhì)的不可逆變性(做對(duì)照實(shí)驗(yàn)); 二是有利于專一性修飾蛋白質(zhì)(反應(yīng)的溫度、pH、反應(yīng)介質(zhì)、緩沖液)。 氯離子能夠抑制碳酸酐酶的酯酶活力,所以修飾反應(yīng)緩沖液中不能含有氯離子; 磷酸鹽是某些酶的競(jìng)爭(zhēng)抑制劑,該離子的結(jié)合可能會(huì)封閉修飾部位; 鈣離子對(duì)-淀粉酶的激活作用,3)反應(yīng)的專一性,利用蛋白質(zhì)分子中某些基團(tuán)的特殊性: 二異丙基氟磷酸酯(DEP)能與胰凝乳蛋白酶的活性絲氨酸作用迅速導(dǎo)致酶失活,但DEP在同樣條件下卻不能與胰凝乳蛋白酶原及一些簡(jiǎn)單的
12、模擬化合物作用; 選擇不同的反應(yīng)pH值: 蛋白質(zhì)分子中各功能基的解離常數(shù)(pKa)是不同的。如用溴(碘)代乙酸(或其酰胺)對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行修飾時(shí): 當(dāng)反應(yīng)pH值為6時(shí),只專一與組氨酸的咪唑基作用; 當(dāng)反應(yīng)pH值為3時(shí),則專一與甲硫氨酸側(cè)鏈作用,反應(yīng)的專一性,利用某些產(chǎn)物的不穩(wěn)定性: 在高pH值下,用二硫化碳、O一甲基異脲和亞氨酸等可將氨基轉(zhuǎn)變成脲和胍的衍生物。雖然巰基也能與上述試劑作用,但因pH值高,與巰基形成的產(chǎn)物可被迅速分解。 親和標(biāo)記: 實(shí)現(xiàn)專一性修飾的重要途徑,親和標(biāo)記試劑除了能與蛋白質(zhì)作用外,還要求試劑的結(jié)構(gòu)和與蛋白質(zhì)作用的底物或抑制劑相似。 在作用前試劑是先以非共價(jià)鍵形式結(jié)合到蛋白質(zhì)的
13、活性部位上,然后再發(fā)生化學(xué)作用,將試劑置于活性部位基團(tuán)上。 對(duì)甲基苯磺酰氟能作用于胰凝乳蛋白酶的活性絲氨酸,反應(yīng)的專一性,差別標(biāo)記: 在底物或抑制劑存在下進(jìn)行化學(xué)修飾時(shí),由于它們保護(hù)著蛋白質(zhì)的活性部位基團(tuán),使這些基團(tuán)不能與試劑作用,然后將過(guò)量的底物或抑制劑除去,所得到的部分修飾的蛋白質(zhì)再與含同位素標(biāo)記的同樣試劑作用,結(jié)果只有原來(lái)被底物或抑制劑保護(hù)的基團(tuán)是帶放射性同位素標(biāo)記的。用這一方法可直接得到蛋白質(zhì)發(fā)揮功能作用的必需基團(tuán); 利用蛋白質(zhì)狀態(tài)的差異: 有時(shí)在結(jié)晶狀態(tài)下進(jìn)行反應(yīng),可以提高修飾的專一性。 核糖核酸酶在晶體狀態(tài)下進(jìn)行羧甲基化時(shí),反應(yīng)主要集中在第119號(hào)組氨酸上,對(duì)第12號(hào)組氨酸修飾很少
14、,兩者之比為60:1;但在水溶液中進(jìn)行同樣的修飾,兩者之比為15:1,4、修飾程度和修飾部位的測(cè)定,1)分析方法: 光譜法:要求修飾后的衍生物具有獨(dú)特的光譜或它的光譜與修飾劑的不同; 間接法:同位素標(biāo)記、有色修飾劑的光譜強(qiáng)度、順磁共振譜、熒光標(biāo)記。 (2)化學(xué)修飾數(shù)據(jù)的分析: 時(shí)間進(jìn)程分析獲得時(shí)間進(jìn)程曲線,可以了解修飾殘基的性質(zhì)和數(shù)目以及修飾殘基與蛋白質(zhì)生物活性之間的關(guān)系等; 確定必需基團(tuán)的性質(zhì)和數(shù)目:鄒氏作圖法(1962年鄒承魯,二、酶分子的化學(xué)修飾,1、金屬離子置換修飾 2、大分子結(jié)合修飾(共價(jià)/非共價(jià)) 3、側(cè)鏈基團(tuán)修飾 4、肽鏈有限水解修飾 5、氨基酸置換修飾,1、金屬離子置換修飾,把
15、酶分子中的金屬離子換成另一種金屬離子,使酶的特性和功能發(fā)生改變的修飾方法,淀粉酶中的鈣離子(Ca2+) 谷氨酸脫氫酶中的鋅離子(Zn2+) 過(guò)氧化氫酶分子中的亞鐵離子(Fe2+) ?;被崦阜肿又械匿\離子(Zn2+) 超氧化物歧化酶分子中的銅、鋅離子(Cu2+,Zn2,酶的金屬離子置換修飾,若從酶分子中除去其所含的金屬離子,酶往往會(huì)喪失其催化活性。 如果重新加入原有的金屬離子,酶的催化活性可以恢復(fù)或者部分恢復(fù)。 若用另一種金屬離子進(jìn)行置換,則可使酶呈現(xiàn)出不同的特性。有的可以使酶的活性降低甚至喪失,有的卻可以使酶的活力提高或者增加酶的穩(wěn)定性,金屬離子置換修飾的過(guò)程,酶的分離純化: 首先將欲進(jìn)行
16、修飾酶經(jīng)過(guò)分離純化,除去雜質(zhì),獲得具有一定純度的酶液; 除去原有金屬離子: 加入一定量的金屬螯合劑(如乙二胺四乙酸(EDTA)等)使酶分子中的金屬離子與螯合劑形成螯合物,通過(guò)透析、超濾、分子篩層析等方法將金屬螯合物從酶液中除去,酶往往成為無(wú)活性狀態(tài); 加入置換離子: 在去離子的酶液中加入一定量的另一種金屬離子,酶蛋白與新加入的金屬離子結(jié)合,除去多余的置換離子,就可以得到經(jīng)過(guò)金屬離子置換后的酶。 注: 金屬離子置換修飾只適用于那些在分子結(jié)構(gòu)中本來(lái)含有金屬離子的酶; 用于金屬離子置換修飾的金屬離子,一般都是二價(jià)金屬離子,2、大分子結(jié)合修飾,一、非共價(jià)修飾,二、共價(jià)修飾,一、非共價(jià)修飾,使用一些能與
17、酶非共價(jià)地相互作用而又能有效地保護(hù)酶的一些添加物,既能通過(guò)氫鍵固定在酶分子表面,也能通過(guò)氫鍵有效地與外部水相連,從而保護(hù)酶的活力。 一類添加物通過(guò)調(diào)節(jié)酶的微環(huán)境來(lái)保護(hù)酶的活力,如多元醇、多糖、多聚氨基酸、多胺等; 一類添加物通過(guò)分子之間相互作用排除表面區(qū)域內(nèi)的水分子,從而增加其穩(wěn)定性,如蛋白質(zhì),二、共價(jià)修飾,用可溶性大分子通過(guò)共價(jià)鍵連接于酶分子的表面,形成一層覆蓋層。 用聚乙二醇修飾超氧物歧化酶,降低或消除酶的抗原性,提高了抗蛋白酶能力,延長(zhǎng)了酶在體內(nèi)的半衰期從而提高了酶藥效。 1分子核糖核酸酶與6.5分子的右旋糖酐結(jié)合,可以使酶活力提高到原有酶活力的2.25倍; 1分子胰凝乳蛋白酶與11分子
18、右旋糖酐結(jié)合,酶活力達(dá)到原有酶活力的5.1倍,聚乙二醇,聚乙二醇是線性分子具有良好的生物相容性和水溶性,在體內(nèi)無(wú)毒性、無(wú)殘留、無(wú)免疫原性,并可消除酶的抗原性,使其末端活化后可以與酶產(chǎn)生交聯(lián),因而,被廣泛用于酶的修飾,大分子共價(jià)修飾過(guò)程,修飾劑的選擇: 根據(jù)酶分子的結(jié)構(gòu)和修飾劑的特性選擇適宜的水溶性大分子。如聚乙二醇(PEG)、右旋糖酐、蔗糖聚合物、葡聚糖、環(huán)狀糊精、肝素、羧甲基纖維素、聚氨基酸等。 修飾劑的活化: 作為修飾劑中含有的基團(tuán)往往不能直接與酶分子的基團(tuán)進(jìn)行反應(yīng)而結(jié)合在一起,在使用之前一般需要經(jīng)過(guò)活化,然后才可以與酶分子的某側(cè)鏈基團(tuán)進(jìn)行反應(yīng)。 修飾: 將帶有活化基團(tuán)的大分子修飾劑與經(jīng)過(guò)
19、分離純化的酶液,以一定的比例混合,在一定的溫度、pH值等條件下反應(yīng)一段時(shí)間,使修飾劑的活化基團(tuán)與酶分子的某側(cè)鏈基團(tuán)以共價(jià)鍵結(jié)合,對(duì)酶分子進(jìn)行修飾。 分離: 需要通過(guò)凝膠層析等方法進(jìn)行分離,將具有不同修飾度的酶分子分開(kāi),從中獲得具有較好修飾效果的修飾酶,3、氨基酸殘基側(cè)鏈基團(tuán)的化學(xué)修飾,采用一定的化學(xué)方法使酶蛋白的側(cè)鏈基團(tuán)發(fā)生改變,從而改變酶分子的特性和功能的修飾方法。 酶蛋白的側(cè)鏈基團(tuán)指組成蛋白質(zhì)的氨基酸殘基上的功能團(tuán)。主要包括氨基、羧基、巰基、胍基、酚基等。這些基團(tuán)可以形成各種副鍵,對(duì)酶蛋白空間結(jié)構(gòu)的形成和穩(wěn)定有重要作用。側(cè)鏈基團(tuán)一旦改變將引起酶蛋白空間構(gòu)象的改變,從而改變酶的特性和功能。
20、用于研究各種基團(tuán)在酶分子中的作用及其對(duì)酶的結(jié)構(gòu)、特性和功能的影響。在研究酶的活性中心中的必需基團(tuán)時(shí)經(jīng)常采用,氨基酸殘基,活性中心7種氨基酸出現(xiàn)的頻率最高:Lys、Asp、Glu、Cys、His、Tyr、Ser; 根據(jù)氨基酸側(cè)鏈R基的極性,20種氨基酸可分成4類: 非極性R基氨基酸(共8種):Ala、Leu、Val、Ile、Phe、Try、Met、Pro; 中性的極性R基氨基酸(共7種):Ser、Thr、Tyr、Cys、Asn、Gly、Gln; 帶正電荷的極性R基氨基酸(共3種):Lys、Arg、His; 帶負(fù)電荷的極性R基氨基酸(共2種):Asp、Glu,催化活性/非催化活性基團(tuán)的修飾,對(duì)非催
21、化基團(tuán)修飾可改變酶的動(dòng)力學(xué)性質(zhì),改變酶對(duì)特殊底物的束縛能力。經(jīng)常被修飾的殘基有: 親核的Ser、Cys、Met、Thr、Lys、His 親電的Tyr、Trp 對(duì)催化活性基團(tuán)可以通過(guò)選擇性修飾側(cè)鏈成分來(lái)實(shí)現(xiàn)氨基酸的取代,討論:酶的修飾反應(yīng)的主要類型,?;磻?yīng) 烷基化反應(yīng) 氧化和還原反應(yīng) 芳香環(huán)取代反應(yīng),1) ?;磻?yīng),化學(xué)修飾試劑有乙酰咪唑、二異丙基磷酰氟、酸酐磺酰氯、硫代三氟乙酸乙酯和O-甲基異脲等,在室溫(2025)、pH值為4.59.0的條件下可與酶分子的某些側(cè)鏈基團(tuán)發(fā)生酰基化反應(yīng)。 作用于酶分子側(cè)鏈基團(tuán)有氨基、羥基、巰基以及酚基等,2) 烷基化反應(yīng),飾試劑的特點(diǎn)常常是帶有活潑的鹵素原子,
22、由于鹵素原子的電負(fù)性,使烷基帶有部分正電荷,很容易導(dǎo)致酶分子的親核基團(tuán)(例如-NH:、-SH等)發(fā)生烷基化。 修飾試劑:2,4-二硝基氟苯、碘代乙酸、碘代乙酰胺、苯甲酰鹵代物和碘甲烷等。 作用于分子的側(cè)鏈基團(tuán)有氨基、巰基、羧基、硫醚基和咪唑基等,3)氧化和還原反應(yīng),氧化性試劑有H202、N-溴代琥珀酰亞胺等。易受氧化作用的側(cè)鏈基團(tuán)有巰基、硫醚基、吲哚基、咪唑基以及酚基等。 有些試劑具有很強(qiáng)的氧化性,往往容易使肽鏈斷裂,因此在修飾反應(yīng)中要控制好氧化條件。光敏劑存在下的光氧化是一種比較溫和的氧化作用。值得提出的是連四硫酸鈉或連四硫酸鉀(tetrathionate)是一種溫和的氧化劑,因此在化學(xué)修飾
23、反應(yīng)中常用來(lái)作為巰基可逆保護(hù)劑。 還原修飾試劑有2一巰基乙醇、巰基乙酸和二硫蘇糖醇(DTT)等,4) 芳香環(huán)取代反應(yīng),酶分子氨基酸殘基的酚羥基在3位和5位上很容易發(fā)生親電取代的碘化和硝化反應(yīng)。 四硝基甲烷(tetranitro-methane,TNM)可以作用于酪氨酸的酚羥基,形成3-硝基酪氨酸的衍生物,這種產(chǎn)物有特殊的光譜,可用于直接的定量測(cè)定,羧基的化學(xué)修飾反應(yīng),氨基的化學(xué)修飾反應(yīng),巰基的化學(xué)修飾反應(yīng),咪唑基的化學(xué)修飾反應(yīng),胍基的化學(xué)修飾反應(yīng),色氨酸吲哚基的化學(xué)修飾反應(yīng),酚羥基的化學(xué)修飾反應(yīng),4) 酶蛋白主鏈修飾(肽鏈有限水解修飾,利用酶分子主鏈的切斷和連接,使酶分子的化學(xué)結(jié)構(gòu)及其空間結(jié)構(gòu)
24、發(fā)生某些改變,從而改變酶的特性和功能的方法。 酶蛋白主鏈修飾主要是靠酶切/酶原激活法,a、胃蛋白酶原的激活,b、胰蛋白酶原(trypsinogen)的激活,c、胰凝乳蛋白酶原(chymotrypsinogen)的激活,氨基酸或核苷酸的置換修飾可以采用化學(xué)修飾方法. 例如,Bender等成功地利用化學(xué)修飾法將枯草桿菌蛋白酶活性中心的絲氨酸轉(zhuǎn)換為半胱氨酸,修飾后該酶失去對(duì)蛋白質(zhì)和多肽的水解能力,卻出現(xiàn)了催化硝基苯酯等底物水解的活性。但是化學(xué)修飾法難度大,成本高,專一性差,而且要對(duì)酶分子逐個(gè)進(jìn)行修飾,操作復(fù)雜,難以工業(yè)化生產(chǎn)。 現(xiàn)在常用的氨基酸置換修飾的方法是定點(diǎn)突變技術(shù)。定點(diǎn)突變(site dir
25、ected mutagenesis)是20世紀(jì)80年代發(fā)展起來(lái)的一種基因操作技術(shù)。是指在DNA序列中的某一特定位點(diǎn)上進(jìn)行堿基的改變從而獲得突變基因的操作技術(shù),是蛋白質(zhì)工程(Protein Engineering)和酶分子組成單位置換修飾中常用的技術(shù)。定點(diǎn)突變技術(shù),為氨基酸或核苷酸的置換修飾提供了先進(jìn)、可靠、行之有效的手段,5) 氨基酸置換修飾,酶分子的定點(diǎn)突變,1、基因序列分析 2、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析 3、酶活性中心分析 4、引物設(shè)計(jì)進(jìn)行基因定點(diǎn)突變 5、酶基因克隆表達(dá) 6、變異特性分析,4.4 酶修飾后的性質(zhì)變化,熱穩(wěn)定性:一般來(lái)說(shuō),熱穩(wěn)定性有較大的提高。 抗原性:比較公認(rèn)的是PEG和人血清白蛋
26、白在消除酶的抗原性上效果比較明顯。 各類失活因子的抵抗力:修飾酶對(duì)蛋白酶、抑制劑均有一定的抵抗能力,從而提高其穩(wěn)定性。 半衰期:一般在體內(nèi)的半衰期得到有效延長(zhǎng)。由于酶分子經(jīng)修飾后,增強(qiáng)對(duì)熱、蛋白酶、抑制劑等的穩(wěn)定性,從而延長(zhǎng)了在體內(nèi)的半衰期。 最適pH:大部分酶經(jīng)化學(xué)修飾后,酶的最適pH發(fā)生了變化,這種變化在應(yīng)用研究上有時(shí)具有重要意義。修飾酶最適pH更接近于生理環(huán)境,在臨床應(yīng)用上有較大意義。 Km的變化:大多數(shù)酶經(jīng)修飾后,Vm沒(méi)有明顯變化,但有些酶經(jīng)修飾后,Km值變大,4.5 酶的定向進(jìn)化,酶分子的合理設(shè)計(jì)(rational design) 酶分子的定向進(jìn)化(directed evolution,酶的合理設(shè)計(jì),體外定向進(jìn)化的意義,理論上,蛋白質(zhì)分子蘊(yùn)藏著很大的進(jìn)化潛力,很多功能有待于開(kāi)發(fā),這是酶的體外定向進(jìn)化的基本先決條件。 所謂酶的體外定向進(jìn)化,又稱實(shí)驗(yàn)分子進(jìn)化,屬于蛋白質(zhì)的非合理設(shè)計(jì),它不需事先了解酶的空間結(jié)構(gòu)和催化機(jī)制,通過(guò)人為地創(chuàng)造特殊的條件,模擬自然進(jìn)化機(jī)制(隨機(jī)突變、重組和自然選擇),在體外改造酶基因,并定向選擇出所需性質(zhì)的突變酶。 酶的體外定向
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